喀西茄低溫脅迫響應(yīng)miRNAs及其靶基因的挖掘與分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-11 01:54
茄子(Solanum melongenaa L.)是茄科(Solanaceae)茄屬(Solanum L.)喜溫蔬菜,對低溫敏感,溫度是茄子生長發(fā)育的主要限制因素之一,溫度低于15℃時(shí)茄子生長受到抑制,低于5℃時(shí)茄子莖葉部受到低溫冷害,在0℃以下茄子則受到凍害而死亡,當(dāng)田間生產(chǎn)中茄子遭遇低溫時(shí)會發(fā)生冷害,影響其產(chǎn)量和品質(zhì)?ξ髑眩⊿olanum aculeatissimum Jacq.)是茄子近緣野生種,具有強(qiáng)耐冷性,是茄子耐冷性研究的重要材料。MicroRNA(miRNA)作為植物生長發(fā)育的重要調(diào)節(jié)器,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控不同的生物和代謝過程中調(diào)節(jié)基因的表達(dá),如參與調(diào)控溫度、干旱、鹽堿和營養(yǎng)脅迫等非生物脅迫。本研究以喀西茄作為試驗(yàn)材料,采用高通量測序和生物信息學(xué)分析等技術(shù)挖掘喀西茄低溫脅迫響應(yīng)miRNAs及其靶基因,并深入研究耐冷相關(guān)miRNAs在低溫下的表達(dá)模式和應(yīng)答低溫脅迫的功能。主要研究結(jié)果如下:1、以1℃低溫處理2h、6h、12h、24h(CA)和未處理0h(CK)的喀西茄葉片進(jìn)行高通量測序,轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫共篩選到61657個(gè)差異表達(dá)基因,miRNA測序共篩選到306個(gè)保守miRN...
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
轉(zhuǎn)錄組與m沮潤A分析流程圖
對四葉一心時(shí)喀西茄進(jìn)行rc低溫處理,設(shè)置7個(gè)不同處理時(shí)間點(diǎn)(Oh、2h、6h、??12?h、24?h、48?h、72?h),測定1°C低溫處理下喀西茄葉片脯氨酸和丙二醛含量,分析各個(gè)??時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)變化情況,以篩選合理的喀西茄自身調(diào)控時(shí)間點(diǎn)。如圖2所示,隨著rc低??溫處理時(shí)間增長,喀西茄中丙二醛含量變化不顯著,喀西茄自身丙二醛積累量較少,膜系??統(tǒng)受損程度較輕,表明其承受l°c低溫能力強(qiáng)。同時(shí),隨著rc低溫處理時(shí)間增長,在24h??內(nèi)喀西茄自身積累的腩氨酸含量顯著增加,表示其在rc低溫下能夠產(chǎn)生大量脯氨酸,從??而清除低溫后積累的活性氧(ros),避免損傷以應(yīng)對rc低溫脅迫。??
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物中miRNA響應(yīng)非生物脅迫研究進(jìn)展[J]. 劉玉鳳,王孝,陳海銀,劉琨,劉陽,齊明芳,寧曉峰,李天來. 中國蔬菜. 2017(02)
[2]低夜溫下番茄ABA缺失突變體和野生型葉片中miRNA差異表達(dá)分析[J]. 王孝,劉陽,陳海銀,劉琨,齊明芳,李天來,劉玉鳳. 園藝學(xué)報(bào). 2016(12)
[3]Phytohormones and their metabolic engineering for abiotic stress tolerance in crop plants[J]. Shabir H.Wani,Vinay Kumar,Varsha Shriram,Saroj Kumar Sah. The Crop Journal. 2016(03)
[4]Dicer調(diào)節(jié)生殖功能的研究進(jìn)展[J]. 符梅,徐克惠,許文明. 遺傳. 2016(07)
[5]低溫對茄子根吸收面積和可溶性糖質(zhì)量濃度的影響[J]. 閻世江,張繼寧,劉潔. 仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(01)
[6]南京地區(qū)大棚茄子越冬栽培技術(shù)[J]. 張燕燕,唐懋華. 中國瓜菜. 2012(06)
[7]低溫脅迫對茄子單性結(jié)實(shí)材料生理特性的影響[J]. 高秀瑞,李冰,高洪波,武彥榮,潘秀清. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(19)
[8]茄子幼苗耐低溫性生理機(jī)制研究[J]. 閆世江,張繼寧,劉潔. 西北植物學(xué)報(bào). 2011(12)
[9]喀西茄引種適應(yīng)性初探[J]. 池小妹,莊勇. 云南中醫(yī)中藥雜志. 2010(11)
[10]西瓜耐冷性研究進(jìn)展[J]. 徐錦華,羊杏平,劉廣,高長洲,朱凌麗. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(05)
博士論文
[1]枳(Poncirus trifoliata)低溫相關(guān)microRNAs鑒定及ptf-miR396b抗寒功能研究[D]. 張曉娜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]草莓microRNA的鑒定及差異表達(dá)研究[D]. 李賀.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]低夜溫及ABA對番茄葉片中miRNAs及其靶基因表達(dá)的影響[D]. 王孝.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]鋁脅迫對喀西茄和車前生理生態(tài)特征的影響[D]. 李蘊(yùn).西南大學(xué) 2008
[3]茄子耐低溫結(jié)果習(xí)性與生理機(jī)制的研究[D]. 王建忠.揚(yáng)州大學(xué) 2008
本文編號:3075657
【文章來源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:97 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
轉(zhuǎn)錄組與m沮潤A分析流程圖
對四葉一心時(shí)喀西茄進(jìn)行rc低溫處理,設(shè)置7個(gè)不同處理時(shí)間點(diǎn)(Oh、2h、6h、??12?h、24?h、48?h、72?h),測定1°C低溫處理下喀西茄葉片脯氨酸和丙二醛含量,分析各個(gè)??時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)變化情況,以篩選合理的喀西茄自身調(diào)控時(shí)間點(diǎn)。如圖2所示,隨著rc低??溫處理時(shí)間增長,喀西茄中丙二醛含量變化不顯著,喀西茄自身丙二醛積累量較少,膜系??統(tǒng)受損程度較輕,表明其承受l°c低溫能力強(qiáng)。同時(shí),隨著rc低溫處理時(shí)間增長,在24h??內(nèi)喀西茄自身積累的腩氨酸含量顯著增加,表示其在rc低溫下能夠產(chǎn)生大量脯氨酸,從??而清除低溫后積累的活性氧(ros),避免損傷以應(yīng)對rc低溫脅迫。??
圖6?Unigene的GO分類圖??Figure?6?GO?annotation?of?Unigene.??在KEGG數(shù)據(jù)庫對unigenes進(jìn)行了?BLAST分析,總共有31582個(gè)unigenes參與了?12個(gè)?KEGG?途徑。如表?5?所不,主要途徑是“metabolic?pathways”(6796?of?31582?unigene(21.52%)),其次是“biosynthesis?of?secondary?metabolites”(?3466?of?31582?unigenes?(10.97%))“plant-pathogen?interaction”?(?1935?of?31582?unigenes(6.13%)?),“plant?hormone?signatransduction”(?1869?of?31582?unigenes?(5.92%)),“RNA?transport”(?1837?of?31582?unigene(5.82%)),結(jié)果可以進(jìn)一步證明功能分類和途徑分配。??表5?Unigene的KEGG?Pathway分類統(tǒng)計(jì)表??Table?5?KEGG?Pathway?Classification?Statistics?of?Unigene??Pathway?Count?Pathway?ID?Level?1?Level?2??Metabolic?pathways?6796?koO?1100?Metabolism?Global?map??Biosynthesis?of?secondary??3466?koOlllO?Metabolism?Global?map??metabolites??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]植物中miRNA響應(yīng)非生物脅迫研究進(jìn)展[J]. 劉玉鳳,王孝,陳海銀,劉琨,劉陽,齊明芳,寧曉峰,李天來. 中國蔬菜. 2017(02)
[2]低夜溫下番茄ABA缺失突變體和野生型葉片中miRNA差異表達(dá)分析[J]. 王孝,劉陽,陳海銀,劉琨,齊明芳,李天來,劉玉鳳. 園藝學(xué)報(bào). 2016(12)
[3]Phytohormones and their metabolic engineering for abiotic stress tolerance in crop plants[J]. Shabir H.Wani,Vinay Kumar,Varsha Shriram,Saroj Kumar Sah. The Crop Journal. 2016(03)
[4]Dicer調(diào)節(jié)生殖功能的研究進(jìn)展[J]. 符梅,徐克惠,許文明. 遺傳. 2016(07)
[5]低溫對茄子根吸收面積和可溶性糖質(zhì)量濃度的影響[J]. 閻世江,張繼寧,劉潔. 仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院學(xué)報(bào). 2014(01)
[6]南京地區(qū)大棚茄子越冬栽培技術(shù)[J]. 張燕燕,唐懋華. 中國瓜菜. 2012(06)
[7]低溫脅迫對茄子單性結(jié)實(shí)材料生理特性的影響[J]. 高秀瑞,李冰,高洪波,武彥榮,潘秀清. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(19)
[8]茄子幼苗耐低溫性生理機(jī)制研究[J]. 閆世江,張繼寧,劉潔. 西北植物學(xué)報(bào). 2011(12)
[9]喀西茄引種適應(yīng)性初探[J]. 池小妹,莊勇. 云南中醫(yī)中藥雜志. 2010(11)
[10]西瓜耐冷性研究進(jìn)展[J]. 徐錦華,羊杏平,劉廣,高長洲,朱凌麗. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(05)
博士論文
[1]枳(Poncirus trifoliata)低溫相關(guān)microRNAs鑒定及ptf-miR396b抗寒功能研究[D]. 張曉娜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]草莓microRNA的鑒定及差異表達(dá)研究[D]. 李賀.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]低夜溫及ABA對番茄葉片中miRNAs及其靶基因表達(dá)的影響[D]. 王孝.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]鋁脅迫對喀西茄和車前生理生態(tài)特征的影響[D]. 李蘊(yùn).西南大學(xué) 2008
[3]茄子耐低溫結(jié)果習(xí)性與生理機(jī)制的研究[D]. 王建忠.揚(yáng)州大學(xué) 2008
本文編號:3075657
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