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草地早熟禾PpCHL1基因的克隆及功能的初步鑒定

發(fā)布時間:2021-02-10 21:00
  草地早熟禾(Poa pratensis L.)是一種冷季型的多年生草坪草,屬于禾本科早熟禾屬。因其色澤喜人和具有強抗寒性、耐修剪、耐踐踏等優(yōu)點應(yīng)用廣泛。葉綠素酶是參與葉綠降解過程中的關(guān)鍵酶,但有關(guān)草地早熟禾葉綠素酶1基因特性及其在葉綠素降解過程中發(fā)揮的作用鮮有報道。本研究利用RACE技術(shù)獲得PpCHL1基因的全長cDNA,編碼具有316個氨基酸,且含有以絲氨酸為活性中心的酯酶結(jié)構(gòu)域。氨基酸序列Blast 比對結(jié)果顯示與烏拉爾圖小麥CHL1蛋白同源性高達(dá)74%,故而命名為PpCHL1,并在Genbank中提交登記(KU145126)。通過染色體步移技術(shù)獲得PpCHL1基因的啟動子序列1247bp,順式作用元件預(yù)測發(fā)現(xiàn)該基因具有TATA-box(核心轉(zhuǎn)錄起始元件)、Box4(光響應(yīng)作用元件)、AuxRR-core(響應(yīng)IAA作用元件)、CCGTCC-box(植物分生組織激活位點)、CGTCA-motif、TGACG-motif(響應(yīng)MeJA作用元件)、circadian(參與生理調(diào)控元件)。說明該基因響應(yīng)激素信號的調(diào)節(jié),并參與生理代謝反應(yīng)。為了探討適合草地早熟禾的內(nèi)參基因,為后續(xù)進(jìn)行基因表... 

【文章來源】:北京林業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:82 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

草地早熟禾PpCHL1基因的克隆及功能的初步鑒定


圖2-1草地早熟禾PpCT/L/基因的擴增結(jié)果??Fig.2-1?cDNA?amplification?of?PpCHLl??

結(jié)構(gòu)域,預(yù)測分析,水解酶,基因


HHIHI?BHHHHI??圖2-1草地早熟禾PpCT/L/基因的擴增結(jié)果??Fig.2-1?cDNA?amplification?of?PpCHLl??A:?PpCHLl^yim;?B:?PpCHL1^5^m;?C:?PpCHll??A:?The3'region?of?PpCHLl?;?B:?The?5*?region?of?P/7C//Z7;?C:?The?full?length?of/^C/ZZ./??該基因通過BLAST比對發(fā)現(xiàn)與烏拉爾圖小麥(7>vY/a/w^'//vwm)?C7/I/基因源性相似度達(dá)74%,故而命名為基因。通過ORF?Finder?qū)υ摶蜷_放閱讀??行預(yù)測分析,其ORF全長951?bp,編碼316個氨基酸。利用NCBI?Conserved?Domain??h對該蛋白的保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測分析,結(jié)果表明PpCffll基因編碼的蛋白屬于??-脂肪酶家族,包含<x/p水解酶的結(jié)構(gòu)域,具有水解酶的特性(圖2-2)。??1?St?lit?IS?參?2M?2SI?Oil?31S??

進(jìn)化樹


C?n*er.sii??i?dp?p??圖2-3草地早熟禾PpCHLl與其他植物CHL的氨基酸序列多重比對??Fig.2-3?Multiple?sequence?alignment?of?PpCHLl?with?other?plants?CHL??尸.戶m妳訪:草地早熟禾;。如/vww:烏拉爾圖小麥;山羊草;Twrarrw:小麥;??蔡藜苜猜;乂從//<37^:擬南芥;Ato^c/zzY:節(jié)節(jié)麥.Consensus:表示相同的序列,在序列下方用小寫字??母表示。Consensus?shows?the?same?sequences?and?are?listed?below?in?minuscule??為了深入了解草地早熟禾PpCHLl與其他植物CHL之間的進(jìn)化關(guān)系,將上述7??個CHL的氨基酸序列,利用MEGA5.0軟件對不同物種的蛋白進(jìn)行了聚類分析,構(gòu)??建了系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2-4)。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]柑橘內(nèi)參基因的穩(wěn)定性評價[J]. 肖翠,嚴(yán)佳文,龍桂友,戴素明,李大志,鄧子牛.  果樹學(xué)報. 2012(06)
[2]植物蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位研究進(jìn)展[J]. 邢浩然,劉麗娟,劉國振.  華北農(nóng)學(xué)報. 2006(S2)
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博士論文
[1]擬南芥葉綠素降解相關(guān)基因NYE1、NYE2、CRN1的鑒定及其功能研究[D]. 任國棟.復(fù)旦大學(xué) 2009

碩士論文
[1]大葉落地生根KdSAHH基因功能鑒定[D]. 李珊珊.北京林業(yè)大學(xué) 2016
[2]紫花苜蓿鋅指蛋白基因的克隆及初步鑒定[D]. 晁躍輝.重慶大學(xué) 2009



本文編號:3027979

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