基于ITS和cpDNA petB-petD序列的寒蘭群體遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性研究
發(fā)布時間:2021-01-21 08:11
蘭科是開花植物中最大的科之一,也是植物保護(hù)當(dāng)中的“旗艦”類群。寒蘭(Cymbidium kanran)隸屬于蘭科(Orchidaceae)蘭屬(Cymbidium),具有很高的觀賞價值和經(jīng)濟(jì)價值。我國寒蘭資源十分豐富,但近年來隨著人們的濫采濫挖,野生寒蘭資源及其生境遭到了破壞,對寒蘭資源的保護(hù)刻不容緩。本研究在調(diào)查我國野生寒蘭資源分布的基礎(chǔ)上,采集了我國7省10個寒蘭居群的132個個體,利用ITS和cpDNA分子標(biāo)記研究其遺傳多樣性以及遺傳結(jié)構(gòu),分析了寒蘭居群的遺傳分化、基因流、居群動態(tài)等特點,并提出了相應(yīng)的保護(hù)策略,為寒蘭資源的保護(hù)和可持續(xù)利用提供了參考。主要研究結(jié)果如下:(1)ITS序列比對排列后長度為658bp,G+C含量在57.60%-68.39%之間,平均為65.99%;ITS1序列G+C含量在53.91%-71.19%之間,平均為67.57%;5.8S序列G+C含量在56.31%-60.74%之間,平均為57.69%;ITS2序列G+C含量在67.86%-70.63%之間,平均為69.82%;cpDNA petB-petD序列比對排列后長度為536bp,G+C含量在33.2...
【文章來源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
8S-26SrDNA基本結(jié)構(gòu)
第 2 章 材料與方法2.1 實驗材料2.1.1 實驗材料采集實驗所用寒蘭樣本分別采自于廣西省桂林市(GL)、福建省武夷山市(WYS)、湖南省靖州縣(JZ)、湖北省來鳳縣(LF)、貴州省榕江縣(RJ)、浙江省云和縣(YH)以及江西省的崇義縣(CY)、宜豐縣(YF)、尋烏縣(XW)和龍南縣(LN),共 7 個省份 10 個樣地,10 個寒蘭居群總計 132 個樣本,其中江西省包括 4 個居群,作為外類群的春蘭采自于湖北省來鳳縣。寒蘭樣本采集結(jié)束后,將植株帶回并栽種于南昌大學(xué)先骕園蘭花大棚中,實驗時選取新鮮幼嫩無病蟲害的葉片。寒蘭各居群采樣地信息見圖 2.1 和表 2.1。
部分樣本電泳結(jié)果如圖3.1 所示。用微量分光光度計測定樣本的濃度和純度,濃度在 100-300ng/μl 之間,A260/A280 值在 1.6-2.0 之間,符合本實驗的要求。用篩選出的引物以及建立的PCR 反應(yīng)體系分別對 ITS 和 cpDNA petB-petD 片段進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,ITS 序列長度在 750bp 左右,cpDNApetB-petD 序列長度在600bp 左右。圖 3.2 和圖 3.3 分別為 ITS 和 cpDNApetB-petD 序列部分?jǐn)U增產(chǎn)物電泳圖。圖 3.1 基因組 DNA 電泳圖Fig. 3.1 The electrophoretogram of genome DNA注:M 為 DL5000 DNAMarkerNote: M represents DL5000 DNAMarker圖 3.2 ITS 序列部分?jǐn)U增產(chǎn)物電泳圖Fig. 3.2 The electrophoretogram of ITS amplification products注:M 為 DL2000 DNAMarker;1-15 為 RJ1-15;16-22 為 LN1-7Note: M represents DL2000 DNAMarker ; 1-15 represent RJ1-15; 16-22 represent LN1-7, respectively
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]寒蘭種子無菌萌發(fā)及根狀莖誘導(dǎo)分化技術(shù)研究[J]. 陳進(jìn)燎,胡慶林,張藝祎,李云霞,歐碧華,翟俊文. 中國園藝文摘. 2016(12)
[2]基于SRAP標(biāo)記的國蘭種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及分子身份證構(gòu)建[J]. 唐源江,曹雯靜,吳坤林. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(09)
[3]寒蘭栽培管理[J]. 李浩新. 中國花卉園藝. 2014(24)
[4]寒蘭種質(zhì)資源表型性狀多樣性分析[J]. 段艷皊,范義榮,敖素燕,寧惠娟,郭雨楠. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2014(16)
[5]寒蘭株系間遺傳多樣性和親緣關(guān)系的SSR分子標(biāo)記分析[J]. 徐曉薇,江南,楊俊波,楊燕萍,王麗芳. 核農(nóng)學(xué)報. 2011(06)
[6]寒蘭盆苗栽培適宜基質(zhì)配比研究[J]. 姜運力,劉蘭,王蓮輝,陳景艷,羅在柒. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(26)
[7]寒蘭品種類型的SRAP分子鑒定[J]. 蹇黎,朱利泉. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(15)
[8]遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 馬靜,安永平,王彩芬,張文銀. 陜西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(01)
[9]rDNA ITS區(qū)序列分子標(biāo)記技術(shù)在植物學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 牛憲立,姬可平,吳群,呂國慶. 生物信息學(xué). 2009(04)
[10]蘭花的傳粉與保護(hù)研究[J]. 李鵬,鄭桂靈,周峰. 北方園藝. 2009(05)
博士論文
[1]鐵皮石斛種質(zhì)資源的鑒定與評價研究[D]. 包英華.廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2014
碩士論文
[1]寒蘭成花機(jī)理及花期調(diào)控研究[D]. 龔湉.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[2]基于ITS和cpDNA分子標(biāo)記的江西野生寒蘭居群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 張威.南昌大學(xué) 2014
[3]東亞特有珍稀蘭科植物扇脈杓蘭的遺傳多樣性與譜系地理學(xué)研究[D]. 李星霖.華東師范大學(xué) 2014
[4]基于ITS和cpDNA分子標(biāo)記的江西建蘭野生居群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 李亞.南昌大學(xué) 2013
[5]基于ITS和cpDNA江西蕙蘭野生居群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 龔黃莎.南昌大學(xué) 2013
[6]基于ITS和trnH-psbA對川西南杓蘭的分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 張業(yè)棟.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[7]秦嶺冷杉和巴山冷杉的種群遺傳結(jié)構(gòu)及譜系地理學(xué)的比較研究[D]. 張啟偉.廣西師范大學(xué) 2012
[8]60Co-γ射線對寒蘭根狀莖的輻射誘變效應(yīng)研究[D]. 李婧嫄.南昌大學(xué) 2011
[9]江西省野生寒蘭的ISSR遺傳多樣性研究[D]. 孫小琴.南昌大學(xué) 2010
[10]基于cpDNA單倍型的銀杏群體遺傳與譜系分析[D]. 曾真.浙江大學(xué) 2008
本文編號:2990803
【文章來源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
8S-26SrDNA基本結(jié)構(gòu)
第 2 章 材料與方法2.1 實驗材料2.1.1 實驗材料采集實驗所用寒蘭樣本分別采自于廣西省桂林市(GL)、福建省武夷山市(WYS)、湖南省靖州縣(JZ)、湖北省來鳳縣(LF)、貴州省榕江縣(RJ)、浙江省云和縣(YH)以及江西省的崇義縣(CY)、宜豐縣(YF)、尋烏縣(XW)和龍南縣(LN),共 7 個省份 10 個樣地,10 個寒蘭居群總計 132 個樣本,其中江西省包括 4 個居群,作為外類群的春蘭采自于湖北省來鳳縣。寒蘭樣本采集結(jié)束后,將植株帶回并栽種于南昌大學(xué)先骕園蘭花大棚中,實驗時選取新鮮幼嫩無病蟲害的葉片。寒蘭各居群采樣地信息見圖 2.1 和表 2.1。
部分樣本電泳結(jié)果如圖3.1 所示。用微量分光光度計測定樣本的濃度和純度,濃度在 100-300ng/μl 之間,A260/A280 值在 1.6-2.0 之間,符合本實驗的要求。用篩選出的引物以及建立的PCR 反應(yīng)體系分別對 ITS 和 cpDNA petB-petD 片段進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示,ITS 序列長度在 750bp 左右,cpDNApetB-petD 序列長度在600bp 左右。圖 3.2 和圖 3.3 分別為 ITS 和 cpDNApetB-petD 序列部分?jǐn)U增產(chǎn)物電泳圖。圖 3.1 基因組 DNA 電泳圖Fig. 3.1 The electrophoretogram of genome DNA注:M 為 DL5000 DNAMarkerNote: M represents DL5000 DNAMarker圖 3.2 ITS 序列部分?jǐn)U增產(chǎn)物電泳圖Fig. 3.2 The electrophoretogram of ITS amplification products注:M 為 DL2000 DNAMarker;1-15 為 RJ1-15;16-22 為 LN1-7Note: M represents DL2000 DNAMarker ; 1-15 represent RJ1-15; 16-22 represent LN1-7, respectively
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]寒蘭種子無菌萌發(fā)及根狀莖誘導(dǎo)分化技術(shù)研究[J]. 陳進(jìn)燎,胡慶林,張藝祎,李云霞,歐碧華,翟俊文. 中國園藝文摘. 2016(12)
[2]基于SRAP標(biāo)記的國蘭種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及分子身份證構(gòu)建[J]. 唐源江,曹雯靜,吳坤林. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(09)
[3]寒蘭栽培管理[J]. 李浩新. 中國花卉園藝. 2014(24)
[4]寒蘭種質(zhì)資源表型性狀多樣性分析[J]. 段艷皊,范義榮,敖素燕,寧惠娟,郭雨楠. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2014(16)
[5]寒蘭株系間遺傳多樣性和親緣關(guān)系的SSR分子標(biāo)記分析[J]. 徐曉薇,江南,楊俊波,楊燕萍,王麗芳. 核農(nóng)學(xué)報. 2011(06)
[6]寒蘭盆苗栽培適宜基質(zhì)配比研究[J]. 姜運力,劉蘭,王蓮輝,陳景艷,羅在柒. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(26)
[7]寒蘭品種類型的SRAP分子鑒定[J]. 蹇黎,朱利泉. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(15)
[8]遺傳多樣性研究進(jìn)展[J]. 馬靜,安永平,王彩芬,張文銀. 陜西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(01)
[9]rDNA ITS區(qū)序列分子標(biāo)記技術(shù)在植物學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 牛憲立,姬可平,吳群,呂國慶. 生物信息學(xué). 2009(04)
[10]蘭花的傳粉與保護(hù)研究[J]. 李鵬,鄭桂靈,周峰. 北方園藝. 2009(05)
博士論文
[1]鐵皮石斛種質(zhì)資源的鑒定與評價研究[D]. 包英華.廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2014
碩士論文
[1]寒蘭成花機(jī)理及花期調(diào)控研究[D]. 龔湉.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[2]基于ITS和cpDNA分子標(biāo)記的江西野生寒蘭居群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 張威.南昌大學(xué) 2014
[3]東亞特有珍稀蘭科植物扇脈杓蘭的遺傳多樣性與譜系地理學(xué)研究[D]. 李星霖.華東師范大學(xué) 2014
[4]基于ITS和cpDNA分子標(biāo)記的江西建蘭野生居群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 李亞.南昌大學(xué) 2013
[5]基于ITS和cpDNA江西蕙蘭野生居群遺傳結(jié)構(gòu)研究[D]. 龔黃莎.南昌大學(xué) 2013
[6]基于ITS和trnH-psbA對川西南杓蘭的分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 張業(yè)棟.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[7]秦嶺冷杉和巴山冷杉的種群遺傳結(jié)構(gòu)及譜系地理學(xué)的比較研究[D]. 張啟偉.廣西師范大學(xué) 2012
[8]60Co-γ射線對寒蘭根狀莖的輻射誘變效應(yīng)研究[D]. 李婧嫄.南昌大學(xué) 2011
[9]江西省野生寒蘭的ISSR遺傳多樣性研究[D]. 孫小琴.南昌大學(xué) 2010
[10]基于cpDNA單倍型的銀杏群體遺傳與譜系分析[D]. 曾真.浙江大學(xué) 2008
本文編號:2990803
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