番茄SOD基因家族的全基因組鑒定及鹽脅迫下表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-16 03:27
番茄對(duì)鹽中度敏感,主要種植在溫暖和干旱地區(qū),而這些地區(qū)的土壤鹽度往往較高,其生長(zhǎng)發(fā)育和產(chǎn)量易受到鹽漬及干旱等逆境脅迫的影響。逆境脅迫易導(dǎo)致植物體內(nèi)的活性氧(reactiveoxygenspecies,ROS)濃度升高,產(chǎn)生一系列的生化反應(yīng),造成細(xì)胞功能紊亂甚至死亡。超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)作為抗氧化系統(tǒng)的第一道防線,能夠有效的清除植物體內(nèi)的活性氧,使植物減輕或免于環(huán)境脅迫帶來的傷害。已有研究表明番茄SOD酶活性在鹽漬,干旱等非生物脅迫下發(fā)生明顯改變,說明SOD與番茄抗逆過程具有密切的聯(lián)系。但目前關(guān)于番茄SOD(SlSOD)基因及其表達(dá)的調(diào)控機(jī)制還知之甚少。因此本研究通過運(yùn)用生物信息學(xué)、遺傳學(xué)、分子生物學(xué)等手段對(duì)SlSOD基因家族成員類型、基因結(jié)構(gòu)、蛋白保守序列及其在植物中的進(jìn)化關(guān)系和啟動(dòng)子中順式元件等進(jìn)行了系統(tǒng)的鑒定分析,并對(duì)其成員在非生物脅迫(鹽漬和干旱處理)和激素處理?xiàng)l件下的表達(dá)模式進(jìn)行研究,以探討SOD在番茄抗逆過程中的作用。主要研究結(jié)果如下:1.在全基因組水平上對(duì)SlSOD基因家族進(jìn)行了鑒定,共獲得9個(gè)候選基因,分別是 4 個(gè) Cu/Z...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 超氧化物歧化酶的研究進(jìn)展
1.1.1 SOD的分類及亞細(xì)胞位置
1.1.2 SOD基因的表達(dá)模式
1.1.3 植物SOD與非生物脅迫
1.1.4 植物SOD與生物脅迫
1.1.5 SOD基因過表達(dá)對(duì)植物抗逆性的影響
1.1.6 番茄中SOD的研究進(jìn)展
1.2 研究意義
1.3 研究?jī)?nèi)容
第二章 番茄SOD基因家族的生物信息學(xué)分析
2.1 材料與方法
2.1.1 數(shù)據(jù)檢索與收集
2.1.2 基因的染色體位置和復(fù)制鑒定
2.1.3 基因結(jié)構(gòu)分析
2.1.4 SlSOD蛋白的物理化學(xué)性質(zhì),亞細(xì)胞位置預(yù)測(cè)及保守基序分析
2.1.5 SODs進(jìn)化樹的構(gòu)建
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 在全基因組水平上鑒定番茄中SOD基因家族
2.2.2 SlSOD基因的染色體分布及內(nèi)含子/外顯子結(jié)構(gòu)分析
2.2.3 物理化學(xué)性質(zhì)及亞細(xì)胞定位
2.2.4 SlSOD蛋白質(zhì)保守序列分析
2.2.5 SOD基因在植物中的進(jìn)化分析
2.3 討論與結(jié)論
第三章 番茄SOD基因家族在非生物脅迫和激素處理下的表達(dá)模式分析
3.1 材料與試劑
3.1.1 材料
3.1.2 試劑
3.1.3 儀器
3.1.4 試驗(yàn)方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 基因啟動(dòng)子中的順式元件功能預(yù)測(cè)分析
3.2.2 SlSOD基因在番茄不同組織中的表達(dá)模式分析
3.2.3 SlSOD基因在鹽和干旱脅迫下的表達(dá)模式分析
3.2.4 SlSOD基因在不同的激素處理下的表達(dá)模式分析
3.3 討論與結(jié)論
3.3.1 SlSOD基因家族啟動(dòng)子可能受逆境、不同激素和光的誘導(dǎo)
3.3.2 SlSOD基因家族不同成員對(duì)鹽漬和干旱脅迫的特異性響應(yīng)
3.3.3 SlSOD基因家族不同成員對(duì)激素脅迫的特異性響應(yīng)
全文結(jié)論
全文創(chuàng)新點(diǎn)
展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號(hào):2980070
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 超氧化物歧化酶的研究進(jìn)展
1.1.1 SOD的分類及亞細(xì)胞位置
1.1.2 SOD基因的表達(dá)模式
1.1.3 植物SOD與非生物脅迫
1.1.4 植物SOD與生物脅迫
1.1.5 SOD基因過表達(dá)對(duì)植物抗逆性的影響
1.1.6 番茄中SOD的研究進(jìn)展
1.2 研究意義
1.3 研究?jī)?nèi)容
第二章 番茄SOD基因家族的生物信息學(xué)分析
2.1 材料與方法
2.1.1 數(shù)據(jù)檢索與收集
2.1.2 基因的染色體位置和復(fù)制鑒定
2.1.3 基因結(jié)構(gòu)分析
2.1.4 SlSOD蛋白的物理化學(xué)性質(zhì),亞細(xì)胞位置預(yù)測(cè)及保守基序分析
2.1.5 SODs進(jìn)化樹的構(gòu)建
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 在全基因組水平上鑒定番茄中SOD基因家族
2.2.2 SlSOD基因的染色體分布及內(nèi)含子/外顯子結(jié)構(gòu)分析
2.2.3 物理化學(xué)性質(zhì)及亞細(xì)胞定位
2.2.4 SlSOD蛋白質(zhì)保守序列分析
2.2.5 SOD基因在植物中的進(jìn)化分析
2.3 討論與結(jié)論
第三章 番茄SOD基因家族在非生物脅迫和激素處理下的表達(dá)模式分析
3.1 材料與試劑
3.1.1 材料
3.1.2 試劑
3.1.3 儀器
3.1.4 試驗(yàn)方法
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 基因啟動(dòng)子中的順式元件功能預(yù)測(cè)分析
3.2.2 SlSOD基因在番茄不同組織中的表達(dá)模式分析
3.2.3 SlSOD基因在鹽和干旱脅迫下的表達(dá)模式分析
3.2.4 SlSOD基因在不同的激素處理下的表達(dá)模式分析
3.3 討論與結(jié)論
3.3.1 SlSOD基因家族啟動(dòng)子可能受逆境、不同激素和光的誘導(dǎo)
3.3.2 SlSOD基因家族不同成員對(duì)鹽漬和干旱脅迫的特異性響應(yīng)
3.3.3 SlSOD基因家族不同成員對(duì)激素脅迫的特異性響應(yīng)
全文結(jié)論
全文創(chuàng)新點(diǎn)
展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士期間發(fā)表的論文
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本文編號(hào):2980070
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