栽培柑橘由接穗與砧木嫁接而成,接穗和砧木的相互作用影響柑橘的園藝性狀、生理活動(dòng)和抗逆性等,盡管有關(guān)柑橘砧穗互作的研究國(guó)內(nèi)外已有報(bào)道,但在分子層面的互作研究非常缺乏。前人研究表明園藝作物砧穗間普遍存在mRNA交流現(xiàn)象,但柑橘上是否也存在交流mRNA尚不清楚。本研究以柑橘品種紅夏橙（Citrus sinensis Osbeck）和常用砧木枳（Poncirus trifoliata L.Raf）為材料構(gòu)建異源嫁接組合,通過(guò)基于轉(zhuǎn)錄組的單核苷酸多態(tài)性分析,初步鑒定了可在柑橘砧穗間交流的mRNA并探討了其可能的作用,為深入研究柑橘砧穗互作機(jī)制提供了理論基礎(chǔ)。本論文主要研究結(jié)果如下:1.構(gòu)建了紅夏橙/枳和枳/枳兩種砧穗嫁接組合,分別對(duì)兩種嫁接組合的接穗和砧木以及砧穗交界面取樣進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。以本研究獲得的18個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)以及前人發(fā)布的17個(gè)紅夏橙轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),通過(guò)比對(duì)分析獲得這兩個(gè)材料的特征性SNP位點(diǎn)254580個(gè)。在紅夏橙/枳異源嫁接組合中若接穗某mRNA擁有來(lái)自砧木的特征性SNP位點(diǎn),則該mRNA可能由砧木轉(zhuǎn)移至接穗,同理可檢測(cè)由接穗轉(zhuǎn)移至砧木的mRNA。結(jié)果篩選得到30個(gè)從紅夏橙轉(zhuǎn)移到... 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖5：兩種柑橘嫁接組合

統(tǒng)的 BWA（Burrows Wheeler Alig）等生物序列對(duì)比工具鑒定 SNP 和候選 mRNA 有必要做生物學(xué)實(shí)驗(yàn)PS 標(biāo)記的 8 個(gè)從紅夏橙轉(zhuǎn)移至枳的夏橙和枳中的 CDS 序列進(jìn)行 PCR 有的 SNPs 位點(diǎn)。在每個(gè)候選基因物的設(shè)計(jì)，然后將 SNP 位點(diǎn)轉(zhuǎn)化為物時(shí)在紅夏橙序列中引入了酶切位橙序列的條帶即可通過(guò)酶切得到兩現(xiàn)兩條帶的現(xiàn)象，即可說(shuō)明該 m經(jīng)酶切驗(yàn)證后紅夏橙/枳嫁接組合相同且均為單一條帶，說(shuō)明條帶切結(jié)果�？赡苁怯捎跇悠分薪涣鞯腁 的酶切位點(diǎn)，導(dǎo)致 SNP 位點(diǎn)均未M 1 2 3

圖 7：5 個(gè)候選基因在紅夏橙和枳間的 SNPs 位點(diǎn)注：白色間隙為 SNPs 位點(diǎn)，SNP 位點(diǎn)相連個(gè)數(shù)越多白色間隙越長(zhǎng)。Fig. 7 The SNPs of five candidate genes between Citrus sinensis and Poncirus trifoliata.Note: The white gaps are SNPs site, the more SNP sites are connected, the longer thewhite gap is.圖8：Cs2g02150.1和Cs5g20420.1在特征性SNP位點(diǎn)處出現(xiàn)重疊峰Fig. 8 The overlapping peak of the diagnostic SNP in Cs2g02150.1 and Cs5g20420.1G/ACs2g02150.1A/GCs5g20420.1

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：2976016