南瓜資源抗逆性評(píng)價(jià)及嫁接對(duì)西瓜果實(shí)品質(zhì)影響的轉(zhuǎn)錄組和代謝組分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-31 03:33
西瓜(Citrullus lanatus)是世界范圍內(nèi)重要的園藝作物,枯萎病和根腐病等土傳病害是限制西瓜產(chǎn)業(yè)發(fā)展的瓶頸,采用嫁接可提高西瓜對(duì)土傳病害的抗性。南瓜是適合西瓜嫁接的砧木材料,但目前對(duì)砧用南瓜的資源評(píng)價(jià)和利用研究尚不夠深入。本課題對(duì)南瓜資源的耐旱性和根腐病抗性進(jìn)行鑒定,以期篩選出優(yōu)異的種質(zhì)資源,為進(jìn)一步砧木選育奠定基礎(chǔ)。針對(duì)部分南瓜作為砧木嫁接后導(dǎo)致西瓜果實(shí)品質(zhì)下降的問題,本課題選用對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)影響較小和較大的南瓜砧木材料,以西瓜自交系97103為接穗,以自嫁為對(duì)照,通過對(duì)果實(shí)膨大停止期和商品成熟期的果肉樣品的轉(zhuǎn)錄組和代謝組進(jìn)行分析,來(lái)研究不同砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)形成的影響,獲得的主要結(jié)果如下:1.對(duì)不同南瓜種質(zhì)一葉一心時(shí)期的性狀進(jìn)行評(píng)價(jià)。以126份南瓜種質(zhì)為材料,包括33份中國(guó)南瓜(C.moschata),93份印度南瓜(C.maxima)。以2份商業(yè)砧木?青研1號(hào)‘和?京欣砧4號(hào)‘作為對(duì)照,進(jìn)行南瓜種質(zhì)資源嫁接適宜時(shí)期(一葉一心時(shí)期)的性狀調(diào)查與評(píng)價(jià),發(fā)現(xiàn)27份材料下胚軸長(zhǎng)度較商業(yè)砧木等同或更短;大部分南瓜種質(zhì)資源材料都具有與商業(yè)砧木同等莖粗或大于商業(yè)砧木,僅有1...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:99 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
1 前言
1.1 課題的提出
1.2 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
1.2.1 嫁接在西瓜生產(chǎn)中的應(yīng)用
1.2.2 不同砧木嫁接對(duì)西瓜果實(shí)品質(zhì)的影響
1.2.3 砧用南瓜耐旱性研究進(jìn)展
1.2.4 砧用南瓜抗土傳病害研究進(jìn)展
1.2.5 西瓜果實(shí)糖酸研究進(jìn)展
1.2.6 轉(zhuǎn)錄組和代謝組在植物果實(shí)研究中的應(yīng)用
1.3 本研究的目的及主要內(nèi)容
1.3.1 本研究的目的
1.3.2 本研究的主要內(nèi)容
2 材料與方法
2.1 南瓜屬自交系苗期性狀調(diào)查
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.2 南瓜自交系幼苗培養(yǎng)
2.1.3 測(cè)量指標(biāo)及方法
2.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2.2 南瓜種質(zhì)資源苗期耐旱性評(píng)價(jià)
2.2.1 試驗(yàn)材料
2.2.2 南瓜種質(zhì)資源幼苗培育及干旱處理
2.2.3 相關(guān)指標(biāo)測(cè)定及方法
2.2.4 數(shù)據(jù)處理及分析
2.3 南瓜種質(zhì)資源抗根腐病鑒定
2.3.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.3.2 供試菌株
2.3.3 菌株活化擴(kuò)繁
2.3.4 西瓜根腐病菌的生殖生長(zhǎng)(產(chǎn)孢方法)
2.3.5 相關(guān)培養(yǎng)基配方
2.3.6 接菌流程
2.3.7 病害分級(jí)
2.3.8 病原菌的鑒定
2.4 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)糖酸含量的影響
2.4.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.4.2 材料培養(yǎng)
2.5 果實(shí)感官品質(zhì)評(píng)價(jià)
2.5.1 試驗(yàn)材料
2.5.2 評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)
2.6 RNA-Seq分析
2.6.1 試驗(yàn)材料及取樣
2.6.2 RNA的提取和檢測(cè)
2.6.3 鏈特異性文庫(kù)的構(gòu)建和庫(kù)檢
2.6.4 上機(jī)測(cè)序
2.6.5 差異表達(dá)基因的鑒定
2.6.6 GO富集分析和Pathway分析
2.6.7 糖酸積累相關(guān)基因的差異表達(dá)分析
2.6.8 RNA-Seq數(shù)據(jù)驗(yàn)證
2.7 代謝組分析
2.7.1 實(shí)驗(yàn)材料及取樣
2.7.2 樣品處理
2.7.3 GC-TOF-MS平臺(tái)檢測(cè)
2.7.4 原始數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.7.5 主成分分析
2.7.6 正交偏最小二乘法-判別分析(OPLS-DA)
2.7.7 單變量統(tǒng)計(jì)分析篩選差異代謝物
3 結(jié)果與分析
3.1 南瓜自交系幼苗苗期性狀評(píng)價(jià)
3.2 南瓜砧木種質(zhì)資源耐旱性評(píng)價(jià)
3.3 南瓜砧木種質(zhì)資源抗根腐病評(píng)價(jià)
3.3.1 病原菌鑒定
3.3.2 南瓜種質(zhì)資源根腐病抗性評(píng)價(jià)
3.4 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)影響
3.4.1 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)影響
3.4.2 南瓜砧木嫁接西瓜對(duì)西瓜果實(shí)綜合口感的影響
3.4.3 四份嫁接組合果實(shí)糖酸含量測(cè)定
3.5 南瓜種質(zhì)資源在轉(zhuǎn)錄水平對(duì)嫁接西瓜果實(shí)糖酸含量的影響
3.5.1 RNA-Seq測(cè)序及同參考基因組比對(duì)結(jié)果
3.5.2 樣本相關(guān)性分析
3.5.3 差異表達(dá)基因的鑒定
3.5.4 GO富集分析
3.5.5 Pathway分析
3.5.6 qRT-PCR驗(yàn)證RNA-Seq數(shù)據(jù)
3.6 南瓜種質(zhì)資源在代謝水平對(duì)嫁接西瓜果實(shí)糖酸含量的影響
3.6.1 樣本質(zhì)量控制
3.6.2 西瓜果實(shí)代謝組主成分分析(PCA)
3.6.3 代謝組數(shù)據(jù)樣本相關(guān)性分析
3.6.4 樣品信號(hào)相應(yīng)的峰占比
3.6.5 樣本差異代謝物Pathway分析
4 討論
4.1 南瓜屬自交系苗期性狀評(píng)價(jià)
4.2 南瓜種質(zhì)資源耐旱性鑒定
4.3 南瓜種質(zhì)資源抗根腐病鑒定
4.4 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)轉(zhuǎn)錄水平的影響
4.5 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)代謝水平的影響
5 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄 ⅠITS序列擴(kuò)增的引物、體系和程序
附錄 ⅡRNA質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果
附錄 Ⅲ 菌株、孢子及特征苗期發(fā)病照片
附錄 Ⅳ 菌株測(cè)序及物種鑒定結(jié)果
致謝
本文編號(hào):2948876
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:99 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
Abstract
縮略詞表
1 前言
1.1 課題的提出
1.2 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
1.2.1 嫁接在西瓜生產(chǎn)中的應(yīng)用
1.2.2 不同砧木嫁接對(duì)西瓜果實(shí)品質(zhì)的影響
1.2.3 砧用南瓜耐旱性研究進(jìn)展
1.2.4 砧用南瓜抗土傳病害研究進(jìn)展
1.2.5 西瓜果實(shí)糖酸研究進(jìn)展
1.2.6 轉(zhuǎn)錄組和代謝組在植物果實(shí)研究中的應(yīng)用
1.3 本研究的目的及主要內(nèi)容
1.3.1 本研究的目的
1.3.2 本研究的主要內(nèi)容
2 材料與方法
2.1 南瓜屬自交系苗期性狀調(diào)查
2.1.1 試驗(yàn)材料
2.1.2 南瓜自交系幼苗培養(yǎng)
2.1.3 測(cè)量指標(biāo)及方法
2.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2.2 南瓜種質(zhì)資源苗期耐旱性評(píng)價(jià)
2.2.1 試驗(yàn)材料
2.2.2 南瓜種質(zhì)資源幼苗培育及干旱處理
2.2.3 相關(guān)指標(biāo)測(cè)定及方法
2.2.4 數(shù)據(jù)處理及分析
2.3 南瓜種質(zhì)資源抗根腐病鑒定
2.3.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.3.2 供試菌株
2.3.3 菌株活化擴(kuò)繁
2.3.4 西瓜根腐病菌的生殖生長(zhǎng)(產(chǎn)孢方法)
2.3.5 相關(guān)培養(yǎng)基配方
2.3.6 接菌流程
2.3.7 病害分級(jí)
2.3.8 病原菌的鑒定
2.4 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)糖酸含量的影響
2.4.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.4.2 材料培養(yǎng)
2.5 果實(shí)感官品質(zhì)評(píng)價(jià)
2.5.1 試驗(yàn)材料
2.5.2 評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)
2.6 RNA-Seq分析
2.6.1 試驗(yàn)材料及取樣
2.6.2 RNA的提取和檢測(cè)
2.6.3 鏈特異性文庫(kù)的構(gòu)建和庫(kù)檢
2.6.4 上機(jī)測(cè)序
2.6.5 差異表達(dá)基因的鑒定
2.6.6 GO富集分析和Pathway分析
2.6.7 糖酸積累相關(guān)基因的差異表達(dá)分析
2.6.8 RNA-Seq數(shù)據(jù)驗(yàn)證
2.7 代謝組分析
2.7.1 實(shí)驗(yàn)材料及取樣
2.7.2 樣品處理
2.7.3 GC-TOF-MS平臺(tái)檢測(cè)
2.7.4 原始數(shù)據(jù)預(yù)處理
2.7.5 主成分分析
2.7.6 正交偏最小二乘法-判別分析(OPLS-DA)
2.7.7 單變量統(tǒng)計(jì)分析篩選差異代謝物
3 結(jié)果與分析
3.1 南瓜自交系幼苗苗期性狀評(píng)價(jià)
3.2 南瓜砧木種質(zhì)資源耐旱性評(píng)價(jià)
3.3 南瓜砧木種質(zhì)資源抗根腐病評(píng)價(jià)
3.3.1 病原菌鑒定
3.3.2 南瓜種質(zhì)資源根腐病抗性評(píng)價(jià)
3.4 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)影響
3.4.1 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)影響
3.4.2 南瓜砧木嫁接西瓜對(duì)西瓜果實(shí)綜合口感的影響
3.4.3 四份嫁接組合果實(shí)糖酸含量測(cè)定
3.5 南瓜種質(zhì)資源在轉(zhuǎn)錄水平對(duì)嫁接西瓜果實(shí)糖酸含量的影響
3.5.1 RNA-Seq測(cè)序及同參考基因組比對(duì)結(jié)果
3.5.2 樣本相關(guān)性分析
3.5.3 差異表達(dá)基因的鑒定
3.5.4 GO富集分析
3.5.5 Pathway分析
3.5.6 qRT-PCR驗(yàn)證RNA-Seq數(shù)據(jù)
3.6 南瓜種質(zhì)資源在代謝水平對(duì)嫁接西瓜果實(shí)糖酸含量的影響
3.6.1 樣本質(zhì)量控制
3.6.2 西瓜果實(shí)代謝組主成分分析(PCA)
3.6.3 代謝組數(shù)據(jù)樣本相關(guān)性分析
3.6.4 樣品信號(hào)相應(yīng)的峰占比
3.6.5 樣本差異代謝物Pathway分析
4 討論
4.1 南瓜屬自交系苗期性狀評(píng)價(jià)
4.2 南瓜種質(zhì)資源耐旱性鑒定
4.3 南瓜種質(zhì)資源抗根腐病鑒定
4.4 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)轉(zhuǎn)錄水平的影響
4.5 南瓜砧木對(duì)嫁接西瓜果實(shí)品質(zhì)代謝水平的影響
5 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄 ⅠITS序列擴(kuò)增的引物、體系和程序
附錄 ⅡRNA質(zhì)量檢測(cè)結(jié)果
附錄 Ⅲ 菌株、孢子及特征苗期發(fā)病照片
附錄 Ⅳ 菌株測(cè)序及物種鑒定結(jié)果
致謝
本文編號(hào):2948876
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