南瓜資源抗逆性評價及嫁接對西瓜果實品質(zhì)影響的轉(zhuǎn)錄組和代謝組分析
發(fā)布時間:2020-12-31 03:33
西瓜(Citrullus lanatus)是世界范圍內(nèi)重要的園藝作物,枯萎病和根腐病等土傳病害是限制西瓜產(chǎn)業(yè)發(fā)展的瓶頸,采用嫁接可提高西瓜對土傳病害的抗性。南瓜是適合西瓜嫁接的砧木材料,但目前對砧用南瓜的資源評價和利用研究尚不夠深入。本課題對南瓜資源的耐旱性和根腐病抗性進行鑒定,以期篩選出優(yōu)異的種質(zhì)資源,為進一步砧木選育奠定基礎。針對部分南瓜作為砧木嫁接后導致西瓜果實品質(zhì)下降的問題,本課題選用對嫁接西瓜果實品質(zhì)影響較小和較大的南瓜砧木材料,以西瓜自交系97103為接穗,以自嫁為對照,通過對果實膨大停止期和商品成熟期的果肉樣品的轉(zhuǎn)錄組和代謝組進行分析,來研究不同砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)形成的影響,獲得的主要結(jié)果如下:1.對不同南瓜種質(zhì)一葉一心時期的性狀進行評價。以126份南瓜種質(zhì)為材料,包括33份中國南瓜(C.moschata),93份印度南瓜(C.maxima)。以2份商業(yè)砧木?青研1號‘和?京欣砧4號‘作為對照,進行南瓜種質(zhì)資源嫁接適宜時期(一葉一心時期)的性狀調(diào)查與評價,發(fā)現(xiàn)27份材料下胚軸長度較商業(yè)砧木等同或更短;大部分南瓜種質(zhì)資源材料都具有與商業(yè)砧木同等莖粗或大于商業(yè)砧木,僅有1...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
1 前言
1.1 課題的提出
1.2 國內(nèi)外研究進展
1.2.1 嫁接在西瓜生產(chǎn)中的應用
1.2.2 不同砧木嫁接對西瓜果實品質(zhì)的影響
1.2.3 砧用南瓜耐旱性研究進展
1.2.4 砧用南瓜抗土傳病害研究進展
1.2.5 西瓜果實糖酸研究進展
1.2.6 轉(zhuǎn)錄組和代謝組在植物果實研究中的應用
1.3 本研究的目的及主要內(nèi)容
1.3.1 本研究的目的
1.3.2 本研究的主要內(nèi)容
2 材料與方法
2.1 南瓜屬自交系苗期性狀調(diào)查
2.1.1 試驗材料
2.1.2 南瓜自交系幼苗培養(yǎng)
2.1.3 測量指標及方法
2.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
2.2 南瓜種質(zhì)資源苗期耐旱性評價
2.2.1 試驗材料
2.2.2 南瓜種質(zhì)資源幼苗培育及干旱處理
2.2.3 相關(guān)指標測定及方法
2.2.4 數(shù)據(jù)處理及分析
2.3 南瓜種質(zhì)資源抗根腐病鑒定
2.3.1 實驗材料
2.3.2 供試菌株
2.3.3 菌株活化擴繁
2.3.4 西瓜根腐病菌的生殖生長(產(chǎn)孢方法)
2.3.5 相關(guān)培養(yǎng)基配方
2.3.6 接菌流程
2.3.7 病害分級
2.3.8 病原菌的鑒定
2.4 南瓜砧木對嫁接西瓜果實糖酸含量的影響
2.4.1 實驗材料
2.4.2 材料培養(yǎng)
2.5 果實感官品質(zhì)評價
2.5.1 試驗材料
2.5.2 評價標準
2.6 RNA-Seq分析
2.6.1 試驗材料及取樣
2.6.2 RNA的提取和檢測
2.6.3 鏈特異性文庫的構(gòu)建和庫檢
2.6.4 上機測序
2.6.5 差異表達基因的鑒定
2.6.6 GO富集分析和Pathway分析
2.6.7 糖酸積累相關(guān)基因的差異表達分析
2.6.8 RNA-Seq數(shù)據(jù)驗證
2.7 代謝組分析
2.7.1 實驗材料及取樣
2.7.2 樣品處理
2.7.3 GC-TOF-MS平臺檢測
2.7.4 原始數(shù)據(jù)預處理
2.7.5 主成分分析
2.7.6 正交偏最小二乘法-判別分析(OPLS-DA)
2.7.7 單變量統(tǒng)計分析篩選差異代謝物
3 結(jié)果與分析
3.1 南瓜自交系幼苗苗期性狀評價
3.2 南瓜砧木種質(zhì)資源耐旱性評價
3.3 南瓜砧木種質(zhì)資源抗根腐病評價
3.3.1 病原菌鑒定
3.3.2 南瓜種質(zhì)資源根腐病抗性評價
3.4 南瓜砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)影響
3.4.1 南瓜砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)影響
3.4.2 南瓜砧木嫁接西瓜對西瓜果實綜合口感的影響
3.4.3 四份嫁接組合果實糖酸含量測定
3.5 南瓜種質(zhì)資源在轉(zhuǎn)錄水平對嫁接西瓜果實糖酸含量的影響
3.5.1 RNA-Seq測序及同參考基因組比對結(jié)果
3.5.2 樣本相關(guān)性分析
3.5.3 差異表達基因的鑒定
3.5.4 GO富集分析
3.5.5 Pathway分析
3.5.6 qRT-PCR驗證RNA-Seq數(shù)據(jù)
3.6 南瓜種質(zhì)資源在代謝水平對嫁接西瓜果實糖酸含量的影響
3.6.1 樣本質(zhì)量控制
3.6.2 西瓜果實代謝組主成分分析(PCA)
3.6.3 代謝組數(shù)據(jù)樣本相關(guān)性分析
3.6.4 樣品信號相應的峰占比
3.6.5 樣本差異代謝物Pathway分析
4 討論
4.1 南瓜屬自交系苗期性狀評價
4.2 南瓜種質(zhì)資源耐旱性鑒定
4.3 南瓜種質(zhì)資源抗根腐病鑒定
4.4 南瓜砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)轉(zhuǎn)錄水平的影響
4.5 南瓜砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)代謝水平的影響
5 全文結(jié)論
參考文獻
附錄
附錄 ⅠITS序列擴增的引物、體系和程序
附錄 ⅡRNA質(zhì)量檢測結(jié)果
附錄 Ⅲ 菌株、孢子及特征苗期發(fā)病照片
附錄 Ⅳ 菌株測序及物種鑒定結(jié)果
致謝
本文編號:2948876
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學位級別】:碩士
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摘要
Abstract
縮略詞表
1 前言
1.1 課題的提出
1.2 國內(nèi)外研究進展
1.2.1 嫁接在西瓜生產(chǎn)中的應用
1.2.2 不同砧木嫁接對西瓜果實品質(zhì)的影響
1.2.3 砧用南瓜耐旱性研究進展
1.2.4 砧用南瓜抗土傳病害研究進展
1.2.5 西瓜果實糖酸研究進展
1.2.6 轉(zhuǎn)錄組和代謝組在植物果實研究中的應用
1.3 本研究的目的及主要內(nèi)容
1.3.1 本研究的目的
1.3.2 本研究的主要內(nèi)容
2 材料與方法
2.1 南瓜屬自交系苗期性狀調(diào)查
2.1.1 試驗材料
2.1.2 南瓜自交系幼苗培養(yǎng)
2.1.3 測量指標及方法
2.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
2.2 南瓜種質(zhì)資源苗期耐旱性評價
2.2.1 試驗材料
2.2.2 南瓜種質(zhì)資源幼苗培育及干旱處理
2.2.3 相關(guān)指標測定及方法
2.2.4 數(shù)據(jù)處理及分析
2.3 南瓜種質(zhì)資源抗根腐病鑒定
2.3.1 實驗材料
2.3.2 供試菌株
2.3.3 菌株活化擴繁
2.3.4 西瓜根腐病菌的生殖生長(產(chǎn)孢方法)
2.3.5 相關(guān)培養(yǎng)基配方
2.3.6 接菌流程
2.3.7 病害分級
2.3.8 病原菌的鑒定
2.4 南瓜砧木對嫁接西瓜果實糖酸含量的影響
2.4.1 實驗材料
2.4.2 材料培養(yǎng)
2.5 果實感官品質(zhì)評價
2.5.1 試驗材料
2.5.2 評價標準
2.6 RNA-Seq分析
2.6.1 試驗材料及取樣
2.6.2 RNA的提取和檢測
2.6.3 鏈特異性文庫的構(gòu)建和庫檢
2.6.4 上機測序
2.6.5 差異表達基因的鑒定
2.6.6 GO富集分析和Pathway分析
2.6.7 糖酸積累相關(guān)基因的差異表達分析
2.6.8 RNA-Seq數(shù)據(jù)驗證
2.7 代謝組分析
2.7.1 實驗材料及取樣
2.7.2 樣品處理
2.7.3 GC-TOF-MS平臺檢測
2.7.4 原始數(shù)據(jù)預處理
2.7.5 主成分分析
2.7.6 正交偏最小二乘法-判別分析(OPLS-DA)
2.7.7 單變量統(tǒng)計分析篩選差異代謝物
3 結(jié)果與分析
3.1 南瓜自交系幼苗苗期性狀評價
3.2 南瓜砧木種質(zhì)資源耐旱性評價
3.3 南瓜砧木種質(zhì)資源抗根腐病評價
3.3.1 病原菌鑒定
3.3.2 南瓜種質(zhì)資源根腐病抗性評價
3.4 南瓜砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)影響
3.4.1 南瓜砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)影響
3.4.2 南瓜砧木嫁接西瓜對西瓜果實綜合口感的影響
3.4.3 四份嫁接組合果實糖酸含量測定
3.5 南瓜種質(zhì)資源在轉(zhuǎn)錄水平對嫁接西瓜果實糖酸含量的影響
3.5.1 RNA-Seq測序及同參考基因組比對結(jié)果
3.5.2 樣本相關(guān)性分析
3.5.3 差異表達基因的鑒定
3.5.4 GO富集分析
3.5.5 Pathway分析
3.5.6 qRT-PCR驗證RNA-Seq數(shù)據(jù)
3.6 南瓜種質(zhì)資源在代謝水平對嫁接西瓜果實糖酸含量的影響
3.6.1 樣本質(zhì)量控制
3.6.2 西瓜果實代謝組主成分分析(PCA)
3.6.3 代謝組數(shù)據(jù)樣本相關(guān)性分析
3.6.4 樣品信號相應的峰占比
3.6.5 樣本差異代謝物Pathway分析
4 討論
4.1 南瓜屬自交系苗期性狀評價
4.2 南瓜種質(zhì)資源耐旱性鑒定
4.3 南瓜種質(zhì)資源抗根腐病鑒定
4.4 南瓜砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)轉(zhuǎn)錄水平的影響
4.5 南瓜砧木對嫁接西瓜果實品質(zhì)代謝水平的影響
5 全文結(jié)論
參考文獻
附錄
附錄 ⅠITS序列擴增的引物、體系和程序
附錄 ⅡRNA質(zhì)量檢測結(jié)果
附錄 Ⅲ 菌株、孢子及特征苗期發(fā)病照片
附錄 Ⅳ 菌株測序及物種鑒定結(jié)果
致謝
本文編號:2948876
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