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藍莓種質(zhì)資源的DNA條形碼及表型多樣性研究

發(fā)布時間:2020-10-09 06:05
   藍莓是杜鵑花科(Ericaceae)越橘屬(Vaccinium)多年生木本植物,具有極高的營養(yǎng)價值。本研究運用DNA條形碼技術及表型性狀多樣性對藍莓種質(zhì)資源進行綜合分析,探究不同品種間的遺傳分化狀況及遺傳多樣性。對部分品種的8個條形碼片段(rpoB、psbA-trnH、ycf5、rbcL、rpoC、matK、ITS、ITS2)進行擴增與測序,分析擴增效率及測序成功率、品種間和品種內(nèi)遺傳距離、barcoding gap、并對遺傳距離計算結(jié)果進行Willcoxon檢驗,利用NJ樹法對各藍莓品種進行聚類分析。對藍莓不同品種的表型性狀進行整理,結(jié)合聚類分析、相關分析、主成分分析、香農(nóng)-維納多樣性指數(shù)等分析方法及指標對表型遺傳多樣性研究。主要結(jié)論如下:(1)在8個DNA條形碼中,條形碼ITS與ycf5在所有藍莓樣本中均無擴增產(chǎn)物。除matK序列擴增成功率(96.30%)、測序成功率(99.04%)相對較低外,其它5個條形碼擴增與測序成功率均為100%。各條形碼的變異位點數(shù)依次為:ITS2(11個)matK(4個)rbcL(3個)psbA-trnH(2個)rpoC(1個)rpoB(0個)。各藍莓品種的品種內(nèi)、品種間遺傳距離較小,介于0.00016-0.00258之間,且品種間遺傳距離大于品種內(nèi)。(2)Barcoding gap分析結(jié)果顯示,各條形碼均未形成明顯的間隔區(qū),但從分布情況看,ITS2、psbA-trnH、matK 3個條形碼有偏向兩端分布的趨勢,尤其是ITS2。Wilcoxon檢驗顯示,條形碼ITS2、psbA-trnH品種間變異較大,條形碼psbA-trnH品種內(nèi)的變異較大。聚類分析結(jié)果表明,條形碼psbA-trnH和rpoC可將藍莓品種分為2個類群,條形碼rbcL和matK將藍莓劃分為3個類群,條形碼ITS2將藍莓分為4個類群。利用條形碼組合可提高藍莓品種鑒定率,其中ITS2+matK+rpoC+rbcL鑒定成功率最高為20%。(3)主成分分析表明,前4個主成分方差累計貢獻率53.477%,其中特征根值大于0.5的有25個性狀,占調(diào)查指標的67.57%,包含樹形因子、葉形因子、果實因子,能夠代表藍莓的表型特征。15個質(zhì)量性狀,包含55個變異類型,平均變異類型3.4個,香濃維納指數(shù)在0.32~1.36之間,平均為0.87;22個數(shù)量性狀中,各性狀間相關性有差異,或呈正相關,或呈負相關,變異系數(shù)在4.77%~47.37%之間,單果重量表現(xiàn)出最大的變異,果型指數(shù)表現(xiàn)出最小的變異,香濃維納指數(shù)在0.22~2.06之間,平均為1.80。(4)根據(jù)相關分析、主成分分析、R型聚類分析結(jié)果,對37個測試性狀進行降維處理,最終篩選出25個遺傳信息豐富的性狀,并做Q型聚類。結(jié)果表明當歐式距離Ll=17時,將所有品種劃分為5個類群,發(fā)現(xiàn)其聚類結(jié)果與栽培生境和栽培類群有相關性。
【學位單位】:北華大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:S663.9
【部分圖文】:

分布情況,藍莓,品種間,條形碼


但從分布情況看有偏向兩端的趨勢,因此,這些條形碼相對較適于藍莓品種的鑒別(見圖2.1)。圖 2.1 藍莓品種間、品種內(nèi)變異的 Barcoding gapA: ITS2; B: psbA-trnH; C: rbcL; D: rpoC; E: matKFigure.2.1 Barcoding gap analysis of among or within varieties of Blueberry

條形碼,藍莓,品種


21續(xù)圖 2.2-2 基于不同條形碼對 40 個藍莓品種構(gòu)建 NJ 樹Continue Fig.2.2-2 Neighbor-joining(NJ)tree for 44 varieties of blueberry byusing different sequences2.3.7 條形碼組合系統(tǒng)發(fā)育樹分析應用條形碼組合提高 DNA 條形碼對藍莓品種鑒別能力。對不同條形碼組合進行同質(zhì)性檢驗,結(jié)果表明最佳的條形碼組合為 ITS2+matK+rpoC+rbcL,其檢驗P=0.08(>0.05),說明該組合適合建樹與分析(圖 3)。此條形碼組合可將 40

個性,指標,越桔,聚類分析


越桔37個性狀指標的R型聚類分析

【參考文獻】

相關期刊論文 前10條

1 劉翼翔;吳永沛;劉光明;曹敏杰;呂業(yè)春;籍保平;;野生藍莓酚酸成分鑒定及其清除細胞內(nèi)自由基活性研究[J];中國食品學報;2015年12期

2 高健;孟婉Y

本文編號:2833321


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