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辣椒果實(shí)Vc、辣椒素和辣椒紅素合成途徑轉(zhuǎn)錄組表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-07-02 15:30
【摘要】:辣椒是一種重要的經(jīng)濟(jì)作物,在世界各地都有種植。辣椒的種類很多,從果實(shí)形狀到果實(shí)顏色變化多端,辣椒素含量也不同。辣椒中含有豐富的人類所必需的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),如可溶性糖、Vc、辣椒素和辣椒紅素等。辣椒全基因組的測(cè)序完成,為研究辣椒果實(shí)發(fā)育的分子機(jī)理和果實(shí)顏色等奠定了基礎(chǔ)。本文借助轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù),分析Vc、辣椒素和辣椒紅素合成途徑相關(guān)結(jié)構(gòu)基因差異表達(dá),通過(guò)共表達(dá)分析找出調(diào)控這些合成途徑的關(guān)鍵基因,并通過(guò)qRT-PCR技術(shù),驗(yàn)證關(guān)鍵基因在不同時(shí)期不同組織中的表達(dá)量。取得如下研究結(jié)果:1利用RNA-Seq測(cè)序技術(shù),對(duì)辣椒骨干親本“6421”的根、莖、葉、花、果肉、胎座和種子按不同發(fā)育時(shí)期進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。每個(gè)樣品重復(fù)3次,累計(jì)測(cè)序樣本達(dá)150多個(gè),共獲得1000Gb Clean reads,并通過(guò)生物信息學(xué)分析構(gòu)建了辣椒大樣本RNA動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄組可視化數(shù)據(jù)庫(kù)!6421”和Zunla的Alignment幾乎都在90%以上,CM334的Alignment較低,基本都在80%~85%之間。2比較分析辣椒與番茄Vc合成途徑結(jié)構(gòu)基因在果肉不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式,辣椒果實(shí)Vc合成主要在完全紅熟前完成;GME1和AO基因在辣椒果肉Vc含量中發(fā)揮了重要作用。3分析了51個(gè)辣椒素合成相關(guān)基因,AT3d和KasId在辣椒胎座中特異表達(dá),在辣椒素合成途徑中起決定作用;特異基因表達(dá)與共表達(dá)分析,推測(cè)Capana06g001834和Capana03g000296(bHLH)可能參與調(diào)控辣椒素的合成。4分析了辣椒紅素合成途徑結(jié)構(gòu)基因的差異表達(dá),LCYB基因在辣椒不同組織中均表達(dá),不同發(fā)育時(shí)期表達(dá)量變化不大,推測(cè)其不僅參與辣椒紅素的合成,還參與調(diào)控辣椒果實(shí)的發(fā)育;CCS基因在辣椒果肉中特異表達(dá),在辣椒紅素合成途徑中起決定作用。
【學(xué)位授予單位】:湖南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S641.3
【圖文】:

葉片


圖 2.2 不同發(fā)育時(shí)期辣椒果實(shí)Fig2.2 Pepper fruits sampled at different developmental stages圖 2.3 不同發(fā)育時(shí)期葉片F(xiàn)ig2.3 Leaves sampled at different developmental stagesL10L9L8L5L7L6L1 L2L3L4L55L^L6L7L8L9L10

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圖 2.2 不同發(fā)育時(shí)期辣椒果實(shí)Fig2.2 Pepper fruits sampled at different developmental stagesL10L9L8L7L6L^L6L7L8L9L10

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2738362

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