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番茄MADS-box家族轉(zhuǎn)錄因子SOC-like4(SlSL4)調(diào)控果實(shí)成熟的功能研究

發(fā)布時(shí)間:2020-06-30 14:50
【摘要】:果實(shí)成熟是一個(gè)復(fù)雜的生理生化過(guò)程總和,涉及果實(shí)顏色變化、細(xì)胞壁代謝及果實(shí)軟化、風(fēng)味物質(zhì)和營(yíng)養(yǎng)成分變化和糖代謝等,這些變化不僅利于果實(shí)種子擴(kuò)散,而且為人類(lèi)和動(dòng)物的飲食提供了必要的營(yíng)養(yǎng)。因此,果實(shí)成熟的研究,特別是肉質(zhì)果實(shí)的成熟調(diào)控成為近年來(lái)科學(xué)家們研究的熱點(diǎn)。在前期工作中,我們利用野生型番茄AC~(++)、番茄成熟突變體(Cnr,rin,nor)的不同發(fā)育時(shí)期果實(shí)RNA為實(shí)驗(yàn)材料,進(jìn)行基因芯片分析,比較了番茄果實(shí)不同成熟突變體(Cnr,rin,nor)處于不同發(fā)育時(shí)期的番茄果實(shí)基因芯片數(shù)據(jù),并采用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)ANN的方法成功建立番茄果實(shí)成熟的信號(hào)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型。通過(guò)該神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,發(fā)現(xiàn)了大量與番茄果實(shí)成熟調(diào)控密切相關(guān)的特異基因,尤其是在果實(shí)成熟過(guò)程中表達(dá)的低豐度轉(zhuǎn)錄因子。其中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)基因——SOC-Lile 4(SlSL4),該基因與番茄果實(shí)的成熟密切相關(guān),并在非乙烯調(diào)控果實(shí)成熟突變體中起到核心調(diào)控作用。為了進(jìn)一步分析該基因在番茄果實(shí)中可能存在的功能,本研究取得了以下主要結(jié)果:1.我們分離并克隆得到了番茄SlSL4基因(NCBI登錄號(hào):XM_004234224)。SlSL4基因CDS區(qū)全長(zhǎng)為498bp,編碼165個(gè)氨基酸。SlSL4定位于細(xì)胞核,具有多個(gè)核酸和蛋白結(jié)合位點(diǎn)。SlSL4屬于MADS-box基因家族,具有典型的MADS結(jié)構(gòu)域。2.通過(guò)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)SlSL4基因的表達(dá)模式分析發(fā)現(xiàn):(1)SlSL4基因在番茄各組織中的表達(dá)水平有差異:該基因在番茄花、果實(shí)、萼片和根中均有表達(dá),且在花和果實(shí)中大量表達(dá),但是在葉片中表達(dá)量較少;(2)SlSL4基因在野生番茄AC~(++)和果實(shí)成熟突變體rin、nor、Nr的果實(shí)成熟不同時(shí)期中的表達(dá)水平有差異,該基因在突變體nor、Nr果實(shí)中的表達(dá)量明顯高于野生型果實(shí);SlSL4基因在野生型成熟不同時(shí)期果實(shí)中的表達(dá)量呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢(shì),并在破色期到達(dá)最大值;(3)通過(guò)SlSL4在5種激素(Eth,ABA,GA,SA,JA)處理后的番茄葉片中的表達(dá)模式分析發(fā)現(xiàn):SlSL4基因在乙烯處理的葉片中的表達(dá)水平高于野生型,該基因可能參與乙烯調(diào)控途徑。3.為了研究SlSL4基因在番茄成熟調(diào)控中的具體功能,我們分別構(gòu)建了SlSL4基因的超表達(dá)載體與RNAi沉默載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化野生番茄AC~(++),培育出并篩選得到SlSL4基因超表達(dá)和RNAi沉默的轉(zhuǎn)基因番茄株系。通過(guò)對(duì)SlSL4超表達(dá)轉(zhuǎn)基因番茄果實(shí)的研究發(fā)現(xiàn):相同環(huán)境下SlSL4超表達(dá)轉(zhuǎn)基因番茄果實(shí)比野生番茄果實(shí)成熟時(shí)間推遲;SlSL4基因RNAi沉默的轉(zhuǎn)基因番茄植株研究發(fā)現(xiàn)該植株開(kāi)花極易脫落且不易結(jié)果。4.在mRNA水平對(duì)SlSL4基因的功能進(jìn)行分析,結(jié)果顯示:轉(zhuǎn)基因番茄果實(shí)中乙烯生物合成相關(guān)基因(ACO1,ACO3,ACS2)和乙烯合成上游基因RIN的表達(dá)水平在果實(shí)成熟的不同時(shí)期明顯下調(diào),乙烯響應(yīng)基因(E4,E8,ERF1)表達(dá)水平同樣下調(diào);轉(zhuǎn)基因番茄果實(shí)中類(lèi)胡蘿卜素合成關(guān)鍵酶基因PSY1的表達(dá)相較于野生型果實(shí)有明顯差異;這些結(jié)果說(shuō)明SlSL4基因可能參與乙烯調(diào)控途徑并且影響番茄果實(shí)的成熟。5.利用酵母雙雜交技術(shù)我們對(duì)SlSL4蛋白與番茄中其他參與果實(shí)成熟調(diào)控的MADS-box蛋白間進(jìn)行了相互作用分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):SlSL4蛋白可與SlMADS-RIN、SlMADS1和SlTAGL1蛋白之間分別發(fā)生相互作用,說(shuō)明SlSL4蛋白可能與SlMADS-RIN、SlMADS1和SlTAGL1蛋白同樣具有調(diào)節(jié)果實(shí)成熟的功能,在番茄果實(shí)成熟調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮作用。同時(shí),酵母雙雜交結(jié)果顯示SlSL4蛋白與番茄離區(qū)發(fā)育相關(guān)蛋白SlMADS-MC和JOINTLESS不發(fā)生相互作用,表明SlSL4蛋白可能不是通過(guò)與SlMADS-MC和JOINTLESS蛋白互作來(lái)控制花的脫落和結(jié)果的。
【學(xué)位授予單位】:西南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類(lèi)號(hào)】:S641.2
【圖文】:

模型圖,乙烯合成,轉(zhuǎn)導(dǎo),番茄


圖 1.1 番茄乙烯合成和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)模型(Liu, Pirrello et al. 2015)e 1.1 Simplified scheme showing ethylene synthesis and response in tPirrello et al. 2015)躍變型果實(shí)中已經(jīng)提出了兩個(gè)乙烯生物合成系統(tǒng)t al. 1972)。系統(tǒng) 1 負(fù)責(zé)躍變型果實(shí)躍變期之前和非躍變型組織所產(chǎn)生的基礎(chǔ)水平的乙烯。系統(tǒng) 1 是自抑制乙烯產(chǎn)生程中起作用,系統(tǒng) 2 在呼吸躍變成熟期運(yùn)行,并能自生催系統(tǒng) 1 乙烯的產(chǎn)生依賴(lài)于 ACS1A 和 ACS6 的表達(dá),都受乙激活是由乙烯的正調(diào)控使 ACS2 和 ACS4 上調(diào)反應(yīng)形成的l. 1998; Barry, Llop-Tous et al. 2000)。在系統(tǒng) 1 里 ACO1 和中低表達(dá),但是它們的轉(zhuǎn)錄水平隨著乙烯產(chǎn)量的增加而升統(tǒng) 2 的過(guò)渡。此外,ACO4 在果實(shí)成熟時(shí)期持續(xù)穩(wěn)定的表達(dá)l. 1998)。乙烯生物合成基因的表達(dá)受發(fā)育調(diào)控因子調(diào)控,S2 和 ACO1 啟動(dòng)子來(lái)調(diào)節(jié)表達(dá)的 RIN 和 LeHB-1 (Lin, Hoano et al. 2013),因此,系統(tǒng) 2 乙烯生產(chǎn)可能不是促成躍變

序列,結(jié)構(gòu)域,基因,外顯子


圖1.4 MADS-box蛋白的分類(lèi)及結(jié)構(gòu)(Alvarezbuylla and Al 2000; Becker, Winter et al. 2000; BoRaes et al. 2003)Figure 1.4 Classification and structure of MADS-box protein(Alvarezbuylla and Al 2000;Becker, Winter et al. 2000; Bodt, Raes et al. 2003)目前,研究較多的 MADS-box 基因是類(lèi)型 2 中的 MIKC 型基因,而類(lèi)型 1基因相對(duì)研究較少。植物中屬于類(lèi)型 2 的 MADS-box 基因具有 M、I、K、C 四主要結(jié)構(gòu)域,而根據(jù) I 結(jié)構(gòu)域的蛋白序列和結(jié)構(gòu)的差異,將 MIKC 型分為:MIK型和MIKC*型。MIKC 型MADS-box 基因通常含有7-8個(gè)外顯子和6-7個(gè)內(nèi)含子一般情況下,M 結(jié)構(gòu)域是由 1 個(gè)位于 N 端的外顯子編碼,K 結(jié)構(gòu)域由 3-5 個(gè)位N 端的外顯子編碼,C 末端由最后的 2-3 個(gè)外顯子編碼。N 末端的 M 結(jié)構(gòu)域是中最保守的,是由 50-60 個(gè)氨基酸殘基組成的。M 結(jié)構(gòu)域具有與目標(biāo)基因特異合作用的序列 CC(A/T)6GG(CArG-box)(Shore and Sharrocks 1995)。例如:番茄SlMADS-RIN 基因可結(jié)合 CArG-box 結(jié)構(gòu)域,然后調(diào)控自身表達(dá)和其下游基因:ACACS2、PG、TBG4 等(Fujisawa, Nakano et al. 2011)。I 結(jié)構(gòu)域大約由 30 多個(gè)親水基酸殘基組成,位于 M 結(jié)構(gòu)域與 K 結(jié)構(gòu)域之間,主要和 M 結(jié)構(gòu)域一起決定轉(zhuǎn)

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