基于露地菊鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組的CgbZIP基因克隆及表達分析
【學位授予單位】:東北林業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S682.11
【圖文】:
圖2-2邋qPCR驗證深度測序的基因表達量逡逑Fig邋.2-2邋Validation邋of邋the邋unigenes邋expression邋between邋qPCR邋and邋deep邋sequencing逡逑異表達基因功能注釋和富集分析逡逑比對露地菊鹽脅迫處理組和對照組樣品間Unigene的表達量,對其中因進行功能注釋,統(tǒng)計結(jié)果如下:逡逑表2-5差異表達基因的功能注釋在各數(shù)據(jù)庫的分布情況逡逑Tab.2-5邋The邋database邋distribution邋of邋different邋expression邋unigenes邋fuction邋annotation逡逑釋數(shù)據(jù)庫名稱Database邋name邐被注釋數(shù)量Annotated邋number逡逑COG邐1566逡逑GO邐2441逡逑KEGG邐1569逡逑KOG邐2327逡逑Pfam邐3515逡逑Swiss-Prot邐3016逡逑nr邐4049逡逑Annotated邋total邋number邐4143逡逑
邐2邋m逡逑Annotated邋Gerves逡逑圖2-3差異表達基因和Unigene在KEGG中分類統(tǒng)計結(jié)果逡逑Fig.2-3邋DEGs邋and邋Unigenes邋classification邋in邋KEGG逡逑(4)露地菊植物激素信號傳導途徑相關(guān)基因的表達分析逡逑大量研究發(fā)現(xiàn)植物激素信號傳導途徑與植物的抗逆性密切相關(guān),本研究的結(jié)果也與逡逑此相印證,在植物激素信號傳導通路中發(fā)現(xiàn)的差異表達基因數(shù)量遠高于其他通路,分析逡逑此通路中的差異表達基因,預(yù)測其功能并篩選潛在的抗鹽性基因可作為日后分子克隆的逡逑目的基因,為露地菊耐鹽基因挖掘提供參考依據(jù)。逡逑64條差異表達基因在激素傳導通路中參與了生長素(Auxin,IAA)、細胞分裂素逡逑(Cytokinin)、赤霉素(Gibberellin,GA)、脫落酸(Abscisic邋acid,邋ABA)、乙稀逡逑(Ethylene)、油菜素內(nèi)酯(Brassinosteroid,邋BA)、茉莉酸(Jasmonate,JA)、水楊逡逑酸(Salicylic邋acid
【參考文獻】
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本文編號:2734117
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