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基于AS-PCR鑒定枇杷S基因型及‘早黃’自交親和機制的研究

發(fā)布時間:2020-06-17 05:00
【摘要】:枇杷是一種亞熱帶常綠果樹,屬于薔薇科,蘋果亞科植物。自交不親和是一種普遍的遺傳控制機制,廣泛存在于被子植物中,它可以促使花柱拒絕自身的花粉,從而阻止近親繁殖。自交不親和受單一位點上(S-locus)的復等位基因(S-allele)控制,但在不同植物中的遺傳控制機制并不一致。主要分為配子體自交不親和與孢子體自交不親和。枇杷與蘋果,梨相同,屬于典型的配子體自交不親和樹種。然而,就目前而言,對于枇杷自交不親和的研究相對較少。本文通過已知的9個枇杷S-RNase基因,設計了 9對擴增S基因的特異性引物,建立了 S等位基因特異性擴增體系,利用這9對引物首次鑒定了 28個枇杷品種的基因型,重新鑒定了 11個已知基因型的枇杷品種的基因型;此外,對親和枇杷品種'早黃'枇杷進行了自交親和機制的初步研究;擴增了部分枇杷品種的花粉SFB基因,對其進行了進化分析。主要研究結果如下:1、根據(jù)已經(jīng)鑒定的13個枇杷S-RNase基因,選擇其中9個S-RNase基因(S2-RNase,S6-RNase,S7-RNase,S8-RNase,S9-RNase,S10-RNase,S11-RNase,S12-RNase,S13-RNase),并基于這9個S-RNase的序列設計了相對應的9對S等位基因特異性引物。利用已知基因型的8個枇杷品種對設計的9對引物進行了特異性的檢測,發(fā)現(xiàn)這9對引物均能擴增出相應的S-RNase,成功的建立了 S等位基因特異性擴增體系。并且利用這9對引物首次鑒定了 28個枇杷品種的基因型,對之前研究過的11個品種的基因型進行了重新鑒定。將本研究中鑒定的11個枇杷品種的基因型與之前鑒定的結果相比較,發(fā)現(xiàn)這11個品種中有8個品種的基因型與之前研究中的鑒定結果一致,進一步的證明了 9對特異性引物能夠有效且特異的擴增相應S-RNase基因,并且能夠被用來快速鑒定含有這9個S-RNase基因的枇杷品種的基因型。2、在已知'早黃'枇杷和'白玉'枇杷的基因型(S2S10)一致的情況下,通過4組田間授粉實驗,發(fā)現(xiàn):'早黃'枇杷自交,有子代產(chǎn)生:'白玉'枇杷自交,沒有子代產(chǎn)生;在以'早黃'為父本,'白玉'為母本時,有子代產(chǎn)生,而以'早黃'為母本,'白玉'為父本時,有子代產(chǎn)生,我們確定了'早黃'枇杷為自交親和品種,'白玉'枇杷為自交不親和品種,且'早黃'枇杷自交親和的發(fā)生與花柱和花粉的S基因有關。然后,根據(jù)克隆的S2-RNase與S10-RNase基因的部分序列,設計了兩對熒光引物,對這兩個枇杷品種中S2-RNase基因與S10-RNase基因表達量進行了分析,發(fā)現(xiàn)'早黃'枇杷中S10-RNase基因的表達量遠遠低于'白玉'枇杷中S10-RNase基因的表達量。進一步的,利用Tail PCR對了兩個枇杷品種中S10-RNase基因的全長和啟動子進行了克隆。通過序列比對后發(fā)現(xiàn),兩個枇杷品種的的S10-RNase基因的編碼區(qū)及內含子區(qū)的序列完全一致。然而,與'白玉'枇杷不同的是,在'早黃'枇杷中S10-RNase基因的啟動子在ATG上游1755bp的位置缺失了 52個bp的堿基序列;谏鲜鼋Y果,我們推測,'早黃'枇杷之所以表現(xiàn)為自交親和是由于花柱S10-RNase基因的啟動子失去了的功能,無法啟動S10-RNase基因的表達,致使S10-RNase喪失了識別并降解自身花粉RNA的功能。3、利用已知的擴增枇杷花粉SFB基因的引物D-SFBF1和D-SFBR1,對8個枇杷品種花粉SFB基因進行克隆和測序分析,成功獲得了 8個新的SFB基因(SFB13~SFB20)。測序結果表明,枇杷與李屬植物不同(一個品種只含有2個SFB基因),一個品種的枇杷含有多個不同的SFB基因,且SFB基因的序列相似性較S-RNase基因來說較高,更為保守。不同SFB基因在不同的品種中存在的頻率存在較大差異,其中SFB2出現(xiàn)在了 6個枇杷品種中,SFB20只出現(xiàn)在'寧海白'枇杷中。將得到的8個新的SFB基因進行蛋白質功能分析,發(fā)現(xiàn)花粉SFB蛋白主要是參與氨基酸的生物合成,合成輔助因子,脂肪酸代謝,且SFB13,SFB17,SFB20均具有裂解酶的功能。經(jīng)過同源性分析,進化樹構建之后,發(fā)現(xiàn)枇杷的SFB基因主要分為三大類,其中第Ⅲ類SFB基因與第Ⅱ類SFB基因的同源性較高,而第Ⅰ類中的SFB基因同源性較低,為69%。根據(jù)這些結果,推測出在枇杷屬植物中可能由多個SFB基因一起控制花粉S決定因子的特異性,協(xié)同識別非自我的S-RNase基因。
【學位授予單位】:南京農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:S667.3
【圖文】:

相對位置,位置,名稱,箭頭


圖2-1邋9對特異引物在基因中的相對位置。左邊為S等位基因的名稱和PCR擴增片段的逡逑長度,箭頭的位置為引物結合的位置。逡逑Fig2-1.邋The邋location邋of邋9邋allele邋specific邋primer邋pairs.邋The邋names邋of邋the邋S邋allele邋and邋the邋expected邋sizes邋of逡逑the邋PCR邋fragments邋are邋shown邋on邋the邋left.邋Primer邋binding邋sites邋are邋indicated邋by邋arrow邋heads.逡逑

等位基因特異性,枇杷品種,退火溫度


利用8個已知基因型的枇杷品種(附表2-2邋)來檢驗9對S等位基因特異性引物的逡逑特異性。由于不同引物對的GC含量不同,因而在PCR擴增時,對應的退火溫度也不逡逑同,范圍在56°C ̄62°C之間。結果發(fā)現(xiàn)(如圖2-2):逡逑(1)邐EpfF/R在退火溫度為58°C時,只在‘白玉’枇杷(Wfl)中能擴增出對逡逑應的片段,大小為417bp,而在其他的枇杷品種中沒有擴增出條帶;逡逑(2)邋EpS^F/R在退火溫度為58°C時,在‘紅燈籠’邋(5^)和美國種中逡逑獲得了正確的片段,大小為222bp,且沒有非特異條帶的出現(xiàn),而在其他品種中沒有逡逑擴增出相應的條帶;逡逑(3)邐EpfF/R在退火溫度達到62°C時,成功的在‘冰糖種’邋(S3")和‘青種’逡逑(W3)中擴增出大小為247bp的片段,且條帶單一。在其他品種中沒有得到條帶;逡逑(4)邐Ep5?F/R在退火溫度為58°C時,在以8個枇杷品種的DNA為模板進行PCR逡逑擴增后

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本文編號:2717110

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