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節(jié)瓜雜種種子純度鑒定的SSR分析

發(fā)布時(shí)間:2020-06-13 19:35
【摘要】:節(jié)瓜(Benincasa hispida Cogn.var.chieh-qua How.),別名毛瓜、毛節(jié)瓜、小冬瓜等,是葫蘆科(Cucurbitaceae)冬瓜屬(Benincasa)一年生草本植物,是我國(guó)華南地區(qū)普遍消費(fèi)的瓜類蔬菜。近年來(lái)節(jié)瓜種植面積不斷擴(kuò)大,節(jié)瓜種子市場(chǎng)逐漸擴(kuò)大,新的雜交品種不斷出現(xiàn),節(jié)瓜種子純度的快速鑒定越來(lái)越重要。種子在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中作為最基本的生產(chǎn)資料,是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中不可替代的要素,因此種子的質(zhì)量檢驗(yàn)工作在種子生產(chǎn)銷售過(guò)程中是非常重要的一環(huán),而種子純度鑒定是種子質(zhì)量檢驗(yàn)工作中重要組成部分。本研究基于節(jié)瓜全基因組測(cè)序結(jié)果,設(shè)計(jì)適用于節(jié)瓜的SSR引物,運(yùn)用SSR分子標(biāo)記技術(shù),建立室內(nèi)快速鑒定節(jié)瓜雜種種子純度的技術(shù)體系,對(duì)節(jié)瓜品種純度進(jìn)行鑒定。主要研究結(jié)果如下:1、通過(guò)研究DNA提取方法,初步探索出適用于節(jié)瓜SSR-PCR的DNA快速提取方法(堿處理法),比較了 DNA快速提取法和CTAB法,前者具有如下優(yōu)點(diǎn):(1)步驟簡(jiǎn)單易操作,不需要多次離心和反復(fù)抽提。(2)相對(duì)于CTAB法,節(jié)省大量時(shí)間,提取的樣品越多,節(jié)省的時(shí)間越多。(3)試劑材料的消耗較少,試驗(yàn)成本低。2、以8份親本材料DNA為模板,篩選了200對(duì)節(jié)瓜SSR引物,獲得8對(duì)能夠穩(wěn)定擴(kuò)增、帶型簡(jiǎn)單,表現(xiàn)為父本顯性和父母本共顯性的引物可用于6個(gè)雜交組合純度鑒定中。對(duì)課題組16份雜種種子進(jìn)行快速鑒定,對(duì)比其中10份田間鑒定結(jié)果,驗(yàn)證了該技術(shù)體系的準(zhǔn)確性。3、本研究運(yùn)用節(jié)瓜子葉DNA快速提取方法(堿處理法)和SSR分子標(biāo)記技術(shù)相結(jié)合,初步建立節(jié)瓜雜種種子SSR分子標(biāo)記純度鑒定技術(shù)體系。
【圖文】:

提取方法,快速法,親本材料


DNA純度低。用改良CTAB法提取的親本材料DNA經(jīng)核酸蛋白儀檢測(cè),逡逑OD26q/OD280比值在1.78-2.02之間,表明所提取的DNA質(zhì)量較好,純度較高,部分樣品逡逑DNA有RNA殘留。用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)兩種方法提。模危临|(zhì)量(圖3-1),逡逑表明改良CTAB法提取的DNA比快速法提取的DNA質(zhì)量好,純度高。逡逑■■■■■■■■逡逑圖3-1不同DNA提取方法電泳檢測(cè)結(jié)果逡逑注:1-4為快速法,5-8為CTAB法逡逑Fig.3-1邋Electrophoresis邋results邋of邋different邋DNA邋extraction邋methods逡逑Note:邋1-4邋is邋a邋fast邋method,5-8邋is邋the邋CTAB邋method逡逑3.1.2不同DNA提取方法對(duì)PCR產(chǎn)物的影響逡逑為了驗(yàn)證快速法提取的DNA質(zhì)量是否能夠滿足SSR-PCR擴(kuò)增的條件,利用在8逡逑份親本材料中不能擴(kuò)增出特異性條帶的引物對(duì)快速法提取的雜種DNA和其中4份使用逡逑21逡逑

快速法,雜交組合,引物,PCR擴(kuò)增


注:1-4為CTAB法,5-8為快速法逡逑Fig.3-2邋PCR邋amplification邋results邋of邋different邋DNA邋extraction邋methods逡逑Note:邋1-4邋is邋the邋CTAB邋method,邋5-8邋is邋a邋fast邋method逡逑3.2邋SSR分子標(biāo)記引物的篩選逡逑利用8份親本材料對(duì)200對(duì)引物進(jìn)行親本多態(tài)性鑒定,結(jié)果共有90對(duì)SSR引物可逡逑擴(kuò)增出清晰穩(wěn)定的產(chǎn)物,,其中有34對(duì)引物在6個(gè)雜交組合間表現(xiàn)出多態(tài)性,多態(tài)性比逡逑率為37.78%,其中有8對(duì)引物可將6個(gè)雜交組合與其親本區(qū)別開來(lái)(表3-1)。其中引逡逑物scaffold4449在雜交組合R05xR07中表現(xiàn)為父母本共顯性;引物scaffold4775在雜交逡逑組合邋R02xR01、R03xR01、R02xR04、R05xR07邋中表現(xiàn)為父母本共顯性;引物邋scaffold5674逡逑在雜交組合R03xR0l、R02xR04中表現(xiàn)為父母本共顯性;引物scaffold7705在雜交組合逡逑R02xR0l、R02xR04中中表現(xiàn)為父本顯性;引物scaffold8902在雜交組合R05xR08中表逡逑xx、x
【學(xué)位授予單位】:廣西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S642.9

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2711639

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