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中國(guó)北方梨種質(zhì)熒光標(biāo)記SSR分子身份證的構(gòu)建和親緣關(guān)系分析

發(fā)布時(shí)間:2020-06-04 21:21
【摘要】:中國(guó)是梨的起源中心和主要的多樣性中心之一,且梨屬植物被認(rèn)為是第三世紀(jì)起源于中國(guó)西部和西南山區(qū)。梨樹在中國(guó)已有3000多年的栽培歷史,在中國(guó)主要水果中其栽培面積和總產(chǎn)量均排第三。根據(jù)梨種質(zhì)資源的原生地理分布,可劃分為東方梨和西方梨兩種。中國(guó)作為東方梨主要原產(chǎn)地之一,具有豐富的種質(zhì)資源,且現(xiàn)已經(jīng)定名的梨屬植物有13個(gè)種。面對(duì)如此多的梨種質(zhì)資源,進(jìn)行種質(zhì)鑒定和親緣關(guān)系及種群結(jié)構(gòu)分析,不僅對(duì)梨種質(zhì)繁育具有重要的意義,也是保護(hù)這些種質(zhì)知識(shí)產(chǎn)權(quán)的需要。SSR標(biāo)記具有數(shù)量多、多態(tài)性豐富、共顯性遺傳、特異性強(qiáng)、出現(xiàn)頻率高、重復(fù)性好和操作簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),有利于構(gòu)建分子身份證、親緣關(guān)系分析和種群結(jié)構(gòu)分析等的研究。本試驗(yàn)選取294份梨種質(zhì)材料,包括137份白梨、57份秋子梨、25份砂梨、19份新疆梨、43份雜交品種、1份川梨、3份杜梨、1份河北梨、2份褐梨、4份木梨和2份西洋梨,利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行親緣關(guān)系及種群結(jié)構(gòu)分析,并構(gòu)建種質(zhì)分子身份證。主要試驗(yàn)結(jié)果如下:1、利用17對(duì)熒光標(biāo)記SSR引物對(duì)294份梨種質(zhì)進(jìn)行擴(kuò)增,獲得400個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)擴(kuò)增的等位基因數(shù)從15-35個(gè)不等,平均為23.5個(gè),片段長(zhǎng)度63-364bp;位點(diǎn)期望雜合度在0.710-0.904,表觀雜合度為0.418-0.833,香農(nóng)信息指數(shù)為1.697-2.707。引物可區(qū)分供試?yán)娣N質(zhì)的數(shù)量從42份到103份不等,平均每對(duì)引物可區(qū)分種質(zhì)數(shù)量為72份,區(qū)分率為14.3%-35.0%,平均區(qū)分率為25.6%。2、構(gòu)建了294份梨種質(zhì)的分子身份證和條形碼標(biāo)識(shí)。聚類分析在相似系數(shù)0.871處,294份梨種質(zhì)聚為四個(gè)組,與地理位置相關(guān),除了‘綏中謝花甜’和‘粉紅宵’,均能將其他種質(zhì)材料區(qū)分開,其中‘南果梨’的芽變品種‘南果4號(hào)’和‘大南果’,‘尖把’與其芽變品種‘尖把王’,及‘秋子’與其芽變品種‘甜秋子’也均被區(qū)分開。SSR標(biāo)記可以區(qū)分梨的芽變品種,可用于梨種質(zhì)的鑒別和保護(hù)。3、中國(guó)西部地區(qū)的梨種質(zhì)親緣關(guān)系較近,梨種質(zhì)的親緣關(guān)系與地理位置相關(guān)。白梨的遺傳背景明顯區(qū)別于別的種群,分為兩種類型,即華北平原地區(qū)的白梨和燕山山脈附近的白梨。新疆梨的遺傳關(guān)系與西部地區(qū)的梨種質(zhì)親緣關(guān)系較近。野生秋子梨與栽培秋子梨具有不同的遺傳背景,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。4、‘庫(kù)爾勒香梨’是具有燕山山脈附近白梨、野生秋子梨和栽培秋子梨基因滲透的新疆梨品種,‘鐵皮’、‘紅密’和‘費(fèi)縣紅梨’應(yīng)歸類為白梨,白梨也具有褐皮的品種!O果梨’是具有白梨基因滲透和秋子梨基因滲透的品種,‘野梨1’和‘野梨2’應(yīng)該歸類為白梨。
【圖文】:

指紋圖譜,杜梨,紅糖,省份


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第二章 北方梨種質(zhì)分子身份證構(gòu)建及親緣關(guān)系分析第二章 北方梨種質(zhì)分子身份證構(gòu)建及親緣關(guān)系分析中國(guó)是東方梨的主要原產(chǎn)地,種質(zhì)資源豐富,現(xiàn)中國(guó)保存梨種質(zhì)資源 2000 份以上。梨樹分布廣泛,種間雜交沒有障礙,同物異名與同名異物現(xiàn)象嚴(yán)重,為梨種質(zhì)資源評(píng)價(jià)和利用帶來(lái)極大不便。隨著分子身份證的提出,其便作為品種識(shí)別的一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)而廣泛應(yīng)用,它將指紋圖譜數(shù)字化,克服了指紋圖譜需要人工比對(duì)的低效繁瑣的缺點(diǎn)。為本試驗(yàn)中的中國(guó)北方梨種質(zhì)試材構(gòu)建分子身份證特異標(biāo)識(shí),可提高種質(zhì)鑒定和評(píng)價(jià)效率。2.1 材料與方法2.1.1 試驗(yàn)材料本試驗(yàn)供試的 294 份梨品種,包括 137 份白梨、57 份秋子梨、25 份砂梨、19 份新疆梨、43份雜交品種和 13 份其他種(1 份川梨、3 份杜梨、1 份河北梨、2 份褐梨、4 份木梨和 2 份西洋梨)。供試材料分別取自以下 4 個(gè)地方,分別是中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所國(guó)家種質(zhì)梨資源圃、甘肅臨夏、云南和山東果樹所(Table2-1)。供試品種的分布如圖 2-1.

種群,遺傳距離,種群分化,秋子梨


特別是種群 6 與‘其他’明顯區(qū)分。其他四個(gè)種群種群分化較近,其中,白梨與沙梨種群分化近,秋子梨與雜交品種的種群分化近。圖3-1 基于Nei(Nei,1983)利用neighbor-joining分析種群間的遺傳距離Fig. 3-1 Using the neighbor-joining to analyse the genetic relationship based on Nei(Nei,1983)distance3.2.2 梨種群的遺傳特性利用 17 對(duì) SSR 標(biāo)記對(duì) 294 份梨種質(zhì)組成的 6 個(gè)種群進(jìn)行基因分型。種群間的觀測(cè)雜合度最低的是‘其他’,為 0.633,,最高的是秋子梨,為 0.781;期望雜合度在最低的是白梨,為 0.801,最高的是秋子梨,為 0.859;種群間的近交系數(shù)最低的是新疆梨
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S661.2

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2696993

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