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皺皮木瓜種質(zhì)藥用成分對遮蔭和套袋技術(shù)的響應(yīng)及轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

發(fā)布時間:2020-04-19 12:08
【摘要】:皺皮木瓜為薔薇科植物貼梗海棠(Chaenomeles speciosa),皺皮木瓜具有極高的藥用營養(yǎng)價值,是保健食品和中藥的重要來源。本研究通過分析不同種質(zhì)間皺皮木瓜主要藥用成分(齊墩果酸、熊果酸、綠原酸、原兒茶酸)的含量,以及測定了部分微量元素的含量,對皺皮木瓜藥用價值進行綜合分析與評價,探討并篩選了皺皮木瓜優(yōu)質(zhì)種質(zhì)資源;其次利用遮蔭和套袋技術(shù)手段探究其對皺皮木瓜果實中藥用成分的調(diào)控影響,為提高皺皮木瓜的藥用價值提供了試驗基礎(chǔ)。進而通過皺皮木瓜轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)、挖掘綠原酸生物合成途徑中的關(guān)鍵基因,為今后深層次開發(fā)皺皮木瓜基因提供了重要的科學(xué)依據(jù),同時為皺皮木瓜深度研究與資源的開發(fā)利用積累試驗材料。本研究主要結(jié)果如下:1.采用高效液相色譜法測定了皺皮木瓜果實中齊墩果酸、熊果酸、綠原酸、原兒茶酸四種化學(xué)成分。測定結(jié)果顯示,齊墩果酸含量最高,高達8.024 mg·g~(-1);其次是綠原酸,高達5.662 mg·g~(-1);同時各種質(zhì)間含量差異較大,齊墩果酸、熊果酸、綠原酸、原兒茶酸變異系數(shù)分別為44.30%、28.67%、32.27%、39.58%。14個種質(zhì)(M_1-M_(14))中四種成分含量之和最高的是M_(13)(15.530 mg·g~(-1)),最低的是M_6(4.281 mg·g~-1)。2.利用火焰原子吸收法測定Zn、Fe、Mn、Cu、Ca、Mg六種微量元素含量。結(jié)果顯示,14個種質(zhì)均含有較多人體必需的微量元素,其中Ca元素的含量遠高于其它元素,其次是Mg元素,Fe、Mn、Zn次之,Cu含量最低。其中六種元素含量之和最高的種質(zhì)是M_4,其Ca元素高達1606.80μg·g~(-1)。不同種質(zhì)間微量元素含量差異較為明顯,Zn、Fe、Mn、Cu、Ca、Mg元素的變異系數(shù)分別為27.12%、28.26%、8.28%、18.33%、23.17%、12.66%。3.根據(jù)齊墩果酸、熊果酸、綠原酸、原兒茶酸和六種微量元素的測定結(jié)果,進行了相關(guān)性分析和主成分分析。相關(guān)性結(jié)果顯示,Fe元素與齊墩果酸、綠原酸均呈極顯著負相關(guān),相關(guān)系數(shù)分別為-0.881、-0.753;與原兒茶酸呈顯著正相關(guān),相關(guān)系數(shù)為0.725。Zn元素與熊果酸含量呈顯著負相關(guān),相關(guān)系數(shù)為0.555;與原兒茶酸含量成顯著正相關(guān),相關(guān)系數(shù)是0.617。Ca元素與齊墩果酸呈顯著負相關(guān),相關(guān)系數(shù)為-0.579。Fe元素與Zn元素、Mg元素與Ca元素都成極顯著正相關(guān);齊墩果酸與綠原酸之間呈顯著正相關(guān),與原兒茶酸呈顯著負相關(guān),其他含量間相關(guān)性并不顯著。這表明通過測皺皮木瓜中這六種微量元素的含量,可推測出其四種酸含量的高低。4.利用遮蔭和套袋對皺皮木瓜果實進行試驗,旨在探索栽培技術(shù)能否提高其藥用成分含量。結(jié)果表明,通過30天透光70%遮蔭處理后,齊墩果酸含量和熊果酸含量明顯提高,綠原酸和原兒茶酸的含量則呈降低趨勢;經(jīng)30天套袋處理后,齊墩果酸、熊果酸、綠原酸和原兒茶酸含量均呈現(xiàn)不同程度的減少;說明套袋方式雖一定程度減少了病蟲害、農(nóng)藥殘留,但不利于藥用成分的合成與積累;總的來看,在皺皮木瓜栽培過程中,可進行適當程度遮蔭,使植株更加充分的利用光照,促進有機物質(zhì)的積累,以達到提高部分藥用成分的目的。5.本試驗利用Illumina sequencing測序平臺對皺皮木瓜果實部位進行轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得105,236,920條讀段(Reads),過濾后得到的有效讀段數(shù)據(jù)(clean reads)有102,531,308條,占比97.40%,2個樣品的高質(zhì)量clean reads比例均達97%以上;用Trinity對clean reads進行拼接,獲得非冗余的基因(unigene)數(shù)據(jù)109211條,GC含量為46.95%,Q30均大于93%,平均長度為1492bp,N50為1963bp。將這些unigenes序列進行了七大數(shù)據(jù)庫的基因功能注釋,包括:Nr,Nt,Pfam,COG/KOG,Swiss-prot,KO,GO。共有109211條Unigenes獲得功能注釋。GO數(shù)據(jù)庫注釋顯示63658條unigenes(58.28%)被注釋到生物過程、細胞組分、分子功能3個大類,25個子類;有27866條unigenes(25.51%)被注釋到了KOG數(shù)據(jù)庫26個功能分類中,其中注釋unigenes數(shù)量最多的是翻譯后修飾,蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換,分子伴侶功能;以KEGG數(shù)據(jù)庫為依據(jù),將27478條unigenes注釋到到129條代謝途徑中,其中unigene最多的途徑是碳代謝。這為皺皮木瓜分子生物學(xué)研究提供了一定數(shù)據(jù)支撐。6.在M_6 vs.M_8轉(zhuǎn)錄組分析中,一共有4254個差異表達基因,其中包括2388個上調(diào)基因和1866個下調(diào)基因?偣灿3313個差異表達基因被分配到分子功能、細胞組分和生物學(xué)過程的三大GO分類和41個功能子類中,其中上調(diào)表達差異基因有1405條,下調(diào)表達差異基因有1908條;將差異表達基因與KEGG數(shù)據(jù)庫的代謝通路進行比對,共有1938條Unigenes注釋到114個代謝通路,其中富集最多的KEGG通路是植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。7.綠原酸合成于苯丙烷生物合成途徑中,在皺皮木瓜轉(zhuǎn)錄組中涉及綠原酸合成的相關(guān)酶有四種,分別是苯丙氨酸脫氨酶(phenylalanin ammonia-lyase,PAL)、肉桂酸徑基化酶(cinnamate4-hydroxylase,CYP73A)、香豆酸-Co A連接酶(4-Coumarate:Coenzyme A Ligase,4CL)和莽草酸羥基肉桂酰轉(zhuǎn)移酶(shikimate hydroxycinnamoyl transferase,HCT);其中M_6 vs.M_8涉及綠原酸合成途徑的差異表達基因有6條,4條上調(diào)表達(Cluster-4.63242;Cluster-4.1656;Cluster-4.15617;Cluster-4.9557),2條下調(diào)表達(Cluster-4.34315;Cluster-4.43160);這為綠原酸的生物合成研究奠定了基礎(chǔ),為利用基因工程提高種質(zhì)的綠原酸含量提供了依據(jù)。
【圖文】:

建庫流程,套袋技術(shù),轉(zhuǎn)錄組學(xué)


木瓜種質(zhì)藥用成分對遮蔭和套袋技術(shù)的響應(yīng)及轉(zhuǎn)錄組學(xué)ragmentation Buffer 中用二價陽離子將得版,隨機寡核苷酸為引物,,在 M-MuL用 RNaseH 降解 RNA 鏈,并在 DNAA 第二條鏈。純化后的雙鏈 cDNA 經(jīng)過序接頭,用 AMPure XP beads 篩選 200 MPure XP beads 純化 PCR 產(chǎn)物,最終獲先使用 Qubit2.0 Fluorometer 進行初步t 2100 bioanalyzer 對文庫的 insert size 進庫有效濃度進行準確定量(文庫有效濃理如圖 1所示。

序列,轉(zhuǎn)錄組,實驗流程


圖 2 轉(zhuǎn)錄組實驗流程圖. 2 The experimental procedure of transcriptiSeqTM)得到的原始圖像數(shù)據(jù)始測序序列(Sequenced Reads fq)文件格式存儲,其中包含(Sequenced Reads)或者 raw re保證信息分析質(zhì)量,必須對 eads。數(shù)據(jù)處理的步驟如下:reads;堿基信息)的比例大于 10%的 值 Qphred<=20 的堿基數(shù)占
【學(xué)位授予單位】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S661.6

【參考文獻】

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本文編號:2633283

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