【摘要】：南瓜(Cucurbita spp.)起源地被認(rèn)為是美洲大陸,是人類最早栽培的古老作物之一。病毒病是南瓜的一種重要的病害,由于南瓜的種植面積不斷擴(kuò)大,南瓜上的病害每年加重,導(dǎo)致南瓜的產(chǎn)量與品質(zhì)急劇下降,同時(shí)造成較大的經(jīng)濟(jì)損失,故南瓜病毒病已經(jīng)引起人們的關(guān)注。本論文引述的病毒病侵染南瓜后的4種表型為:皺縮型、花葉型、黃化型和褪綠型。1.根據(jù)全基因組序列設(shè)計(jì)特異性引物,檢測(cè)采自湖南長(zhǎng)沙、岳陽(yáng)、益陽(yáng)和常德具有明顯癥狀的224份病毒的南瓜葉片樣品,檢出的病毒有ZYMV、CCYV、WMV、CMV、PVY和PMMoV,陽(yáng)性率分別為36.2%、7.6%、6.7%、2.7%、1.3%和0.9%。南瓜病毒病以單病毒感染為主,ZYMV、CCYV、WMV、CMV的單病毒侵染率分別為31.7%、6.3%、3.1%和1.8%;雙病毒感染率為4.4%,其中ZYMV與WMV比較容易發(fā)生復(fù)合侵染,侵染率為2.7%;三雙病毒感染率為0.4%。2.通過(guò)克隆、測(cè)序、拼接得到ZYMV、WMV以及CCYV湖南分離物的外殼蛋白全序列,利用NCBI上登錄的序列數(shù)據(jù)進(jìn)行分子進(jìn)化分析。3.三個(gè)病毒CP基因都沒(méi)有明顯的重組,重組不是其分子進(jìn)化的顯著作用力。ZYMV可以明顯地按照地理來(lái)源劃分出3個(gè)主要譜系;WMV可以劃分3個(gè)主要譜系;CCVY可以劃分4個(gè)主要譜系。突變和負(fù)選擇作用是驅(qū)動(dòng)ZYMV、WMV以及CCYV進(jìn)化的主要作用力,大部分分離物種群間的遺傳變異顯著,受到遺傳漂變的影響,種群結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定都處于擴(kuò)張的趨勢(shì)中,基因變異程度低。
【圖文】：

第二章 湖南南瓜主要病毒的分子鑒定于分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)有較好的重復(fù)性、檢測(cè)時(shí)間短、靈敏度高章采用病毒相對(duì)保守的外殼蛋白基因設(shè)計(jì)特異性引物，成功建R 檢測(cè)技術(shù)。料品采集及處理究所用樣品均是于2016年9月在湖南省各地區(qū)采集224份南瓜樣樣品均有明顯的病毒癥狀，如斑駁、花葉、皺縮、矮化、畸形、圖 2-1）。為更好地保存更好的 RNA，采集樣品時(shí)將樣品置于自袋的保溫箱中進(jìn)行低溫處理，再移至超低溫冰箱中保存。

ucurbit chlorotic yellows virus RNA 2 15.92 hamonda virus segment S 13.93 atermelon mosaic virus 13.53 ucurbit chlorotic yellows virus RNA 1 9.60 epper mild mottle virus 1.77 oybean mosaic virus 1.48 ucumber mosaic virus RNA 3 1.25 am bean mosaic virus 1.19 elosma mosaic virus 1.02 coverage（X）:sRNA 對(duì)該病毒序列的平均覆蓋度，，用比對(duì)到該病毒的 reads 總長(zhǎng) sRNA:比對(duì)到該病毒的 reads 數(shù)。erage（X）:sRNA on the viral population of the average coverage, with the ratio of the vided by the length of the virus sequence；mapped sRNA:Compare the number of readsA 質(zhì)量檢測(cè)有的總 RNA 采用 1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè) RNA 的完整性（
【學(xué)位授予單位】：湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S436.429

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2631515