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甜瓜染色體片段置換系的初步構(gòu)建及種子相關(guān)性狀QTL分析

發(fā)布時(shí)間:2020-04-02 19:33
【摘要】:甜瓜(Cucumis melo L.2n=24)作為葫蘆科作物之一,是人們?nèi)粘I畛S玫乃?甜瓜果肉含有很多營養(yǎng)物質(zhì)且藥用價(jià)值很高。種子是植物繁殖后代,延續(xù)遺傳物質(zhì)的載體,是物種延續(xù)不可或缺的組成部分,種子的大小關(guān)系到營養(yǎng)物質(zhì)的儲存以及種子的萌發(fā),因此,研究及定位控制甜瓜種子相關(guān)性狀的基因,對甜瓜遺傳育種及其種子相關(guān)生物學(xué)研究具有重要意義。染色體片段置換系具有遺傳背景純合、能夠穩(wěn)定遺傳、QTL分析及定位準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),是作物QTL及品種選育的理想材料。本研究的內(nèi)容主要分為兩個(gè)部分,一方面結(jié)合分子標(biāo)記輔助選擇,利用回交群體進(jìn)行染色體片段置換系的初步構(gòu)建,主要內(nèi)容為:以厚皮抗病甜瓜品種MR-1為母本材料,以普通栽培薄皮甜瓜品種M1-15為父本材料,通過雜交獲得F1代單株,以MR-1為輪回親本,進(jìn)行了兩代回交分別獲得了BC1P1和BC2P1代群體,結(jié)合MAS技術(shù),利用對父母本全基因組重測序的數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)開發(fā)CAPS分子標(biāo)記然后對每代回交群體進(jìn)行分子標(biāo)記輔助選擇,構(gòu)建染色體片段置換系。另一方面,利用BC1P1代群體的基因組和種子的相關(guān)性狀構(gòu)建遺傳連鎖圖譜并對甜瓜種子長度、寬度、百粒重以及種腔寬度等性狀進(jìn)行了QTL分析。從而為培育甜瓜優(yōu)良品種及分子輔助育種提供更理想的育種材料。主要研究結(jié)果如下:以高通量測序技術(shù)為基礎(chǔ),在兩親本間共開發(fā)出600對CAPS引物,經(jīng)引物篩選后共獲得具有多態(tài)性的CAPS標(biāo)記240對,多態(tài)率為40%,利用240對分子標(biāo)記,以及三個(gè)群體(包含兩個(gè)BC1P1群體和一個(gè)BC2P1群體)構(gòu)建了3張不同的圖譜,分別包含197,209和180對分子標(biāo)記覆蓋基因組長度分別為2231.09c M、1829.55c M和1264.70c M。通過對兩個(gè)回交世代染色體片段置換系初步構(gòu)建的結(jié)果統(tǒng)計(jì)觀察與分析,得出BC1P1群體和BC2P1群體中母本條帶和雜合條帶的數(shù)量基本符合1:1和3:1的比例,并計(jì)算出兩個(gè)回交世代中各單株的導(dǎo)入率,分別為接近于25%和12.5%。對GGT2.0軟件計(jì)算結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì),得到在兩個(gè)回交世代中均有初步建成的單片段置換系,數(shù)量分別為54和190。對BC1P1群體的種子長度、寬度、百粒重及種腔寬度進(jìn)行QTL分析,共獲得6個(gè)QTL位點(diǎn),分布于1、2、5、8號染色體上,其中1號染色體M1-14和M1-16兩個(gè)標(biāo)記之間同時(shí)存在分別和種子長度及種子百粒重相關(guān)的兩個(gè)QTL位點(diǎn);與種子寬度、種子長度相關(guān)的兩個(gè)QTL位點(diǎn)均位于5號染色體上M5-16與M5-17兩標(biāo)記之間;種腔寬度共獲得兩個(gè)QTL位點(diǎn)位于2號以及8號染色體上。四個(gè)性狀的定位距離分別為1.19cM、1.12cM、1.12c M、2.39c M、4.20c M、2.59c M,貢獻(xiàn)率均在9.86%-13.52%之間。
【圖文】:

照片,照片,方法


圖2-1兩親本照片

電泳圖,群體,電泳圖,基因組DNA


圖 3-2 群體基因組 DNA 電泳圖Fig. 3-2 The electrophoretogram of population genomic DNA1.3 分子標(biāo)記輔助選擇及遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建.3.1 CAPS 分子標(biāo)記的篩選本試驗(yàn)共設(shè)計(jì)了 600 對 CAPS 引物,通過篩選獲得具有多態(tài)性引物 240 對,多態(tài)率 40%態(tài)性表現(xiàn)如圖 3-3 所示。利用 240 對多態(tài)性引物對 BC1P1和 BC2P1群體內(nèi)各單株進(jìn)行基型,,圖 3-4 為其中一對多態(tài)性引物在 BC1P1群體各單株中的基因分型情況(由于本實(shí)驗(yàn)?zāi)副咀鳛檩喕赜H本,所以在回交群體中出現(xiàn)的帶型只有母本帶和雜合帶)。圖 3-3 引物多態(tài)性篩選情況Fig. 3-3 The situation of the markers polymorphism selected
【學(xué)位授予單位】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:S652

【參考文獻(xiàn)】

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7 王志偉;分子標(biāo)記輔助選擇構(gòu)建棉花種間單片段代換系及其遺傳評價(jià)[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

8 張書紅;玉米單片段代換系群體的構(gòu)建和玉米矮花葉病抗病基因的定位[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年



本文編號:2612354

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