目的:1.為進一步完善實驗紅鯽C1HD系遺傳背景研究,建立實驗紅鯽C1HD系的線粒體分子標記,開展了實驗紅鯽C1HD系線粒體DNA條形碼分析。2.為推廣實驗紅鯽在核輻射生物學效應方面的應用研究,探討了¹³⁷Cs輻射對實驗紅鯽HSP70表達的影響。方法:1.設計引物對驗紅鯽C1HD系、金魚、同源二倍體金魚和同源二倍體紅鯽、鯽和白鯽等6種魚類的鯽屬魚類線粒體COI、COIII、Cytb和D-loop基因進行PCR擴增,目的條帶經回收、轉化后進行測序,獲得測序結果。以鯉魚為外類群,結合NCBI中下載的序列,分別對每個基因的序列特征進行分析,并計算種間和種內遺傳距離,分析系統(tǒng)進化關系。2.通過測序得到實驗紅鯽、同源二倍體金魚、同源二倍體紅鯽和金魚線粒體基因組全序列,對實驗紅鯽線粒體基因組全序列的結構特征、堿基組成和密碼子使用頻率進行分析。最后,結合NCBI中下載的有關鯽屬魚類的線粒體基因組全序列構建系統(tǒng)進化樹。3.根據(jù)實驗紅鯽¹³⁷Cs輻射的LD_50/30,設計4.1Gy、6.1Gy、8.2Gy輻照劑量組與空白對照組,用輻照儀對...

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-16種鯽屬魚類不同標記基因PCR產物電泳檢測圖

V占總序列長度的15.5%，簡約信息位點（PI）為65個，自裔位點（S）80個。從堿基組成來看（見表2-5），COI序列中4種堿基的平均含量分別是T：29.3%、C：26.2%、A：26.9%、G：17.6%，G的所占比例明顯低于其他3種堿基的比例，且G+C的含....

圖3-1線粒體基因組結構圖

22個tRNA中有8個位于L鏈上，其他的結構進行分析顯示，其中21種tRNA基因的結形狀（圖3-2），只有tRNASer（GCT）因二氫尿嘧完整的三葉草結構(圖3-3)。

圖3一2實驗紅卿CllD〕系tRNA三葉草結構模型

其他密碼子的RSCU值均小于1，使用頻率較低，蛋白編碼基因在密碼子第三位點堿基的使用上也表現(xiàn)為明顯的AT偏向性。圖3-2實驗紅鯽C1HD系tRNA三葉草結構模型Figure3-2TheclassicalcloverleafstructureoftRNAge....

圖3一3實驗紅螂Clll】〕系tRNA加結構模型

其他密碼子的RSCU值均小于1，使用頻率較低，蛋白編碼基因在密碼子第三位點堿基的使用上也表現(xiàn)為明顯的AT偏向性。圖3-2實驗紅鯽C1HD系tRNA三葉草結構模型Figure3-2TheclassicalcloverleafstructureoftRNAge....

本文編號：3987423