草魚α-淀粉酶基因5′側(cè)翼序列研究
發(fā)布時間:2024-05-16 04:19
α-淀粉酶是生物獲取能量所需要的重要酶類,在江河生態(tài)系統(tǒng)中,魚類由不同的食性構(gòu)成食物鏈體系,不同魚類的能量獲取途徑不同,但進化過程中卻保持著相似的α-淀粉酶基因序列;研究魚類α-淀粉酶基因的表達調(diào)控序列,對揭示魚類食性功能群機制具有意義。 本研究應用染色體步移方法,克隆獲得草魚的α-淀粉酶基因5′側(cè)翼序列,長度為2,063bp。使用網(wǎng)絡生物信息學預測軟件對草魚α-淀粉酶基因的5′側(cè)翼序列進行分析,預測草魚α-淀粉酶基因的啟動子區(qū)域位于-252~-2bp處;草魚α-淀粉酶基因轉(zhuǎn)錄起始位點(TSS)處于起始密碼子(ATG)上游30bp處;預測的草魚α-淀粉酶基因啟動子區(qū)域包含有基本的啟動子結(jié)構(gòu)元件:TATA盒和CAAT盒。轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點分析顯示,草魚α-淀粉酶基因5′側(cè)翼-385bp位點存在HNF3調(diào)控元件,序列為:“5-TTTTTTTGT-3”;另外,還發(fā)現(xiàn)有5個GR調(diào)控元件,其中有一個具有回文結(jié)構(gòu),序列為“AGTTCTtgttgtTGTTCT”,可能具有應答糖皮質(zhì)激素誘導的作用。 采用相同的方法,克隆得到鱤、鯪和廣東魴α-淀粉酶基因5′側(cè)翼序列,長度分別2,268bp、1,635bp...
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3974680
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圖1-1實驗原理簡易圖
圖1-1實驗原理簡易圖1:α-淀粉酶基因5′側(cè)翼區(qū)域;2:α-淀粉酶基因外顯子;“”:未知的序列;“”:獲得的序列。Fig.1-1Thesimplediagramoftheprinciple1:α-amylasegene5′flankingseq....
圖2-2草魚α-淀粉酶基因外顯子部分及推導的氨基酸序列
的α-淀粉酶結(jié)構(gòu)一樣,魚類α-淀粉酶包含有8個α螺旋和8個β折疊;魚類α-淀粉酶的氨基酸序列中參與形成二硫鍵的半胱氨酸(Cys)殘基位點在不同物種中高度保守。獲得的草魚α-淀粉酶基因部分外顯子序列推導的氨基酸序列中,包含有2個α螺旋:α1、α2,和....
圖3-2輪步移PCR產(chǎn)物電泳圖
_v3/promo/promoinit.cgi?dirDlation.com/pub/programs.html)b/programs/alibaba2/index.htmttp://www.urogene.org/cgi-bin/m基因5′側(cè)翼序列的克隆,以草魚基因....
圖4-2α-淀粉酶基因5′側(cè)翼近端序列比對Figure4-2Sequencealignmentof5′flankingproximalsequencesofα-amylasegene
斑馬魚草魚鳡鯪廣東魴河鲀-1河鲀-2河鲀-3尖吻鱸馬魚1004340444137383935魚10085817135413842鳡100836936403841鯪1006834413842東魴....
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