鯉皰疹病毒3型實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法的建立及囊膜蛋白108的表達(dá)免疫研究
發(fā)布時(shí)間:2024-05-15 02:17
錦鯉皰疹病毒病是由鯉皰疹病毒3型(Cyprinid herpesvirus3,CyHV-3)感染各日齡錦鯉、鯉魚包括鯉魚的普通變種(比如框鏡鯉),引起錦鯉、鯉魚爛鰓病和高死亡率的新病毒病,已引起世界各國(guó)的高度關(guān)注。錦鯉皰疹病毒病造成的魚類死亡率高達(dá)80-100%,具有高度的傳染性,是一類烈性傳染病,一旦爆發(fā)疫情難以控制。1998年此病在以色列首次發(fā)現(xiàn),隨后在全世界十幾個(gè)國(guó)家和地區(qū)傳播與流行,造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。鯉魚養(yǎng)殖是我國(guó)的傳統(tǒng)養(yǎng)殖項(xiàng)目,數(shù)量多,分布廣。錦鯉皰疹病毒病在國(guó)內(nèi)發(fā)病頻繁,加之運(yùn)輸和商業(yè)繁榮,若疫病一處暴發(fā),很快危及整個(gè)地區(qū)乃至全國(guó)的鯉魚養(yǎng)殖行業(yè),甚至其他淡水魚類的養(yǎng)殖,造成整個(gè)鯉魚養(yǎng)殖鏈的癱瘓,給我國(guó)的進(jìn)出口貿(mào)易和國(guó)民經(jīng)濟(jì)帶來的損失不可估量。2007年,國(guó)家質(zhì)檢總局發(fā)布預(yù)報(bào),加強(qiáng)對(duì)進(jìn)口錦鯉和鯉魚的監(jiān)測(cè)力度,要求在進(jìn)出口貿(mào)易活動(dòng)中把錦鯉皰疹病毒病作為必檢項(xiàng)目。 目前的研究成果顯示,免疫疫苗是防治錦鯉皰疹病毒病的有效方法,但是我國(guó)目前還沒有研制出確實(shí)、有效的疫苗,在錦鯉皰疹病毒病疫苗研制方面還處于摸索階段。文獻(xiàn)報(bào)道,該病的診斷方法有多種。臨床應(yīng)用比較普遍的是通過臨床癥狀以及剖...
【文章頁(yè)數(shù)】:104 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要 Abstract 第一章 前言
1 錦鯉皰疹病毒病研究進(jìn)展
1.1 鯉皰疹病毒 3 型病原學(xué)
1.2 錦鯉皰疹病毒病流行病學(xué)
1.3 臨床癥狀
1.4 病理變化
1.5 診斷方法
1.6 預(yù)防與控制
2 鯉皰疹病毒 3 型分子生物學(xué)研究進(jìn)展
2.1 基因組特點(diǎn)
2.2 開放閱讀框
2.3 毒株的進(jìn)化
2.4 鯉皰疹病毒 3 型與皰疹病毒的關(guān)系
3 原核表達(dá)系統(tǒng)
3.1 簡(jiǎn)介
3.2 原核表達(dá)系統(tǒng)在水產(chǎn)方面的應(yīng)用
4 研究目的和意義 第二章 SYBR GREEN I CYHV-3 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè)方法的建立
1 材料
1.1 病毒和細(xì)胞
1.2 主要試劑及耗材
1.3 主要儀器
2 方法
2.1 CyHV-3 的培養(yǎng)
2.2 CyHV-3DNA 的提取
2.3 PCR 陽(yáng)性標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的制備
2.4 標(biāo)準(zhǔn)品濃度的計(jì)算
2.5 重組質(zhì)粒的穩(wěn)定性檢驗(yàn)
2.6 SYBR Green I 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè)方法的建立
3 結(jié)果
3.1 PCR 擴(kuò)增目的基因
3.2 重組克隆載體的鑒定
3.4 重組質(zhì)粒濃度的測(cè)定
3.5 重組質(zhì)粒的穩(wěn)定性試驗(yàn)
3.6 熒光定量 PCR 循環(huán)條件和退火溫度的優(yōu)化
3.7 最佳引物濃度確定和融解曲線分析
3.8 標(biāo)準(zhǔn)曲線的生成
3.9 熒光定量 PCR 反應(yīng)體系
4 討論
4.1 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建
4.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立和回歸方程的設(shè)定
4.3 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 引物設(shè)計(jì)
4.4 關(guān)于熒光域值的設(shè)定
4.5 關(guān)于實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 假陽(yáng)性和假陰性的問題
5 小結(jié) 第三章 錦鯉皰疹病毒病流行病學(xué)調(diào)查
1. 材料
2. 方法
2.1 樣品采集及處理
2.2 樣品基因組的提取
2.3 熒光定量 PCR 檢測(cè)
2.4 普通 PCR 對(duì)樣品的檢測(cè)
2.5 國(guó)家行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)對(duì)部分樣品的檢測(cè)
3 結(jié)果
3.1 流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果
3.2 國(guó)家行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)對(duì)部分樣品的 PCR 檢測(cè)結(jié)果
4 討論
5 小結(jié) 第四章 DNA 疫苗在鯉魚體內(nèi)組織代謝與分布
1 材料
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.2 病毒、細(xì)胞和質(zhì)粒
1.3 主要試劑
1.4 主要儀器
2 方法
2.1 重組質(zhì)粒的大量提取及純化
2.2 重組質(zhì)粒免疫鯉魚
2.3 熒光定量 PCR 檢測(cè)核酸疫苗的組織分布
3 結(jié)果
3.1 pIRES-ORF81 質(zhì)粒的組織分布
4 討論
4.1 DNA 疫苗在魚類免疫中的應(yīng)用
4.2 DNA 疫苗的免疫方法
4.3 DNA 疫苗在機(jī)體的分布與代謝
5 小結(jié) 第五章 CYHV-3 ORF108 的原核表達(dá)及免疫原性研究
1 材料
1.1 病毒和細(xì)胞
1.2 主要試劑及耗材
1.3 主要儀器
2 方法
2.1 引物設(shè)計(jì)
2.2 病毒基因組提取
2.3 ORF108 基因的擴(kuò)增
2.4 PCR 產(chǎn)物的克隆及鑒定
2.5 重組表達(dá)質(zhì)粒 pET32a-108 的構(gòu)建
2.6 重組質(zhì)粒的誘導(dǎo)表達(dá)
2.7 表達(dá)產(chǎn)物的 SDS-PAGE 分析
2.8 表達(dá)蛋白的回收與純化
2.9 表達(dá)蛋白的多克隆抗體的制備及抗體反應(yīng)原性鑒定
3 結(jié)果
3.1 ORF108 基因的 PCR 擴(kuò)增
3.2 ORF108 基因克隆質(zhì)粒的鑒定
3.3 重組表達(dá)質(zhì)粒 pET32a-ORF108 的鑒定
3.4 表達(dá)產(chǎn)物的 SDS-PAGE 分析
3.5 表達(dá)蛋白的抗體的制備及抗體反應(yīng)原性鑒定
4 討論
4.1 關(guān)于 ORF108 蛋白
4.2 關(guān)于原核表達(dá)載體
4.3 關(guān)于免疫學(xué)檢測(cè)方法
5 小結(jié) 結(jié)論 參考文獻(xiàn) 作者簡(jiǎn)介 致謝
本文編號(hào):3973751
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【學(xué)位級(jí)別】:博士
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摘要 Abstract 第一章 前言
1 錦鯉皰疹病毒病研究進(jìn)展
1.1 鯉皰疹病毒 3 型病原學(xué)
1.2 錦鯉皰疹病毒病流行病學(xué)
1.3 臨床癥狀
1.4 病理變化
1.5 診斷方法
1.6 預(yù)防與控制
2 鯉皰疹病毒 3 型分子生物學(xué)研究進(jìn)展
2.1 基因組特點(diǎn)
2.2 開放閱讀框
2.3 毒株的進(jìn)化
2.4 鯉皰疹病毒 3 型與皰疹病毒的關(guān)系
3 原核表達(dá)系統(tǒng)
3.1 簡(jiǎn)介
3.2 原核表達(dá)系統(tǒng)在水產(chǎn)方面的應(yīng)用
4 研究目的和意義 第二章 SYBR GREEN I CYHV-3 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè)方法的建立
1 材料
1.1 病毒和細(xì)胞
1.2 主要試劑及耗材
1.3 主要儀器
2 方法
2.1 CyHV-3 的培養(yǎng)
2.2 CyHV-3DNA 的提取
2.3 PCR 陽(yáng)性標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的制備
2.4 標(biāo)準(zhǔn)品濃度的計(jì)算
2.5 重組質(zhì)粒的穩(wěn)定性檢驗(yàn)
2.6 SYBR Green I 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè)方法的建立
3 結(jié)果
3.1 PCR 擴(kuò)增目的基因
3.2 重組克隆載體的鑒定
3.4 重組質(zhì)粒濃度的測(cè)定
3.5 重組質(zhì)粒的穩(wěn)定性試驗(yàn)
3.6 熒光定量 PCR 循環(huán)條件和退火溫度的優(yōu)化
3.7 最佳引物濃度確定和融解曲線分析
3.8 標(biāo)準(zhǔn)曲線的生成
3.9 熒光定量 PCR 反應(yīng)體系
4 討論
4.1 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建
4.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立和回歸方程的設(shè)定
4.3 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 引物設(shè)計(jì)
4.4 關(guān)于熒光域值的設(shè)定
4.5 關(guān)于實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 假陽(yáng)性和假陰性的問題
5 小結(jié) 第三章 錦鯉皰疹病毒病流行病學(xué)調(diào)查
1. 材料
2. 方法
2.1 樣品采集及處理
2.2 樣品基因組的提取
2.3 熒光定量 PCR 檢測(cè)
2.4 普通 PCR 對(duì)樣品的檢測(cè)
2.5 國(guó)家行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)對(duì)部分樣品的檢測(cè)
3 結(jié)果
3.1 流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果
3.2 國(guó)家行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)對(duì)部分樣品的 PCR 檢測(cè)結(jié)果
4 討論
5 小結(jié) 第四章 DNA 疫苗在鯉魚體內(nèi)組織代謝與分布
1 材料
1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.2 病毒、細(xì)胞和質(zhì)粒
1.3 主要試劑
1.4 主要儀器
2 方法
2.1 重組質(zhì)粒的大量提取及純化
2.2 重組質(zhì)粒免疫鯉魚
2.3 熒光定量 PCR 檢測(cè)核酸疫苗的組織分布
3 結(jié)果
3.1 pIRES-ORF81 質(zhì)粒的組織分布
4 討論
4.1 DNA 疫苗在魚類免疫中的應(yīng)用
4.2 DNA 疫苗的免疫方法
4.3 DNA 疫苗在機(jī)體的分布與代謝
5 小結(jié) 第五章 CYHV-3 ORF108 的原核表達(dá)及免疫原性研究
1 材料
1.1 病毒和細(xì)胞
1.2 主要試劑及耗材
1.3 主要儀器
2 方法
2.1 引物設(shè)計(jì)
2.2 病毒基因組提取
2.3 ORF108 基因的擴(kuò)增
2.4 PCR 產(chǎn)物的克隆及鑒定
2.5 重組表達(dá)質(zhì)粒 pET32a-108 的構(gòu)建
2.6 重組質(zhì)粒的誘導(dǎo)表達(dá)
2.7 表達(dá)產(chǎn)物的 SDS-PAGE 分析
2.8 表達(dá)蛋白的回收與純化
2.9 表達(dá)蛋白的多克隆抗體的制備及抗體反應(yīng)原性鑒定
3 結(jié)果
3.1 ORF108 基因的 PCR 擴(kuò)增
3.2 ORF108 基因克隆質(zhì)粒的鑒定
3.3 重組表達(dá)質(zhì)粒 pET32a-ORF108 的鑒定
3.4 表達(dá)產(chǎn)物的 SDS-PAGE 分析
3.5 表達(dá)蛋白的抗體的制備及抗體反應(yīng)原性鑒定
4 討論
4.1 關(guān)于 ORF108 蛋白
4.2 關(guān)于原核表達(dá)載體
4.3 關(guān)于免疫學(xué)檢測(cè)方法
5 小結(jié) 結(jié)論 參考文獻(xiàn) 作者簡(jiǎn)介 致謝
本文編號(hào):3973751
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