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擬緣(魚央)(Liobagrus marginatoides)遺傳多樣性及其種群結(jié)構(gòu)分析

發(fā)布時間:2024-02-24 12:13
  擬緣魚央(Liobagrus marginatoides),隸屬硬骨魚綱(Teleostei)、鲇形目(Siluriformes)、鈍頭鮠科(Amblycipitidae)、魚央屬(Liobagrus),是我國長江上游水系特有的一種小型魚類。通常長江上游水系,包括:長江干流、金沙江、岷江、嘉陵江等,近年來長江上游水系大規(guī)模興建了一系列的梯級水電工程以及水體污染等因素,在很大程度上改變了擬緣魚央生存流域的環(huán)境。因此,為了了解擬緣魚央遺傳多樣性及其種群遺傳結(jié)構(gòu)情況,本文從核基因組和線粒體基因組入手,利用自開發(fā)的微衛(wèi)星分子標記和線粒體基因組DNA分子標記,對采集于長江上游水系的擬緣魚央6個地理種群進行數(shù)據(jù)分析,主要的研究結(jié)果有如下幾方面: 1.利用線粒體DNA對擬緣魚央進行種群遺傳結(jié)構(gòu)分析 (1)通過對魚央屬4種魚:黑尾魚央、白緣魚央、金氏魚央、擬緣魚央,線粒體基因組序列進行比對分析,篩選出16SRNA、D-loop、Cytb基因作為擬緣魚央遺傳結(jié)構(gòu)分析的分子標記。利用16SRNA分子標記對142條擬緣魚央序列進行分析,共檢測出26個變異位點、11個單倍型,單倍型多樣性(Hd)和核苷酸多樣性...

【文章頁數(shù)】:70 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1擬緣魚央采樣圖

圖1-1擬緣魚央采樣圖

群體遺傳結(jié)構(gòu)往往能提供非常豐富的遺傳變異數(shù)據(jù);16sRNA進化速大多用于種間的遺傳學分析。此,本研究擬采用Cytb、D-loop、16sRNA這三個線粒體片段來進傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)分析。料和方法材料批6個群體的擬緣魚央樣本采集于2011年3月到20....


圖2-3基于mtDNA16sRNA基因構(gòu)建的擬緣魚央單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖

圖2-3基于mtDNA16sRNA基因構(gòu)建的擬緣魚央單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖

重慶師范大學碩士學位論文第二章擬緣魚央線粒體DN使用Network4.6.1軟件的Median-joining方法構(gòu)建擬緣網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖,該單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖顯示了單倍型在擬緣魚央6個群體況。H-1共有115個個體,位于網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖輻射的中心位置,在有分布,因此分....


圖2-6擬緣魚央D-loop單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖,圓圈面積表示單倍型分布頻率

圖2-6擬緣魚央D-loop單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖,圓圈面積表示單倍型分布頻率

圖2-6擬緣魚央D-loop單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖,圓圈面積表示單倍型分布頻率Fig.2-6HaplotypenetworkofL.MarginatoidesbasedonD-loopofmtDNA用DNASP5.10軟件分析基因滲透對擬緣魚央各群體遺傳....


圖2-7基于D-loop擬緣魚央群體Mismatch分布圖

圖2-7基于D-loop擬緣魚央群體Mismatch分布圖

圖2-7基于D-loop擬緣魚央群體Mismatch分布圖Fig.2-7MismatchdistributionofL.MarginatoidesbasedonD-loop2.3.3線粒體cytb2.3.3.1遺傳多樣性145尾擬緣魚央線粒體....



本文編號:3908975

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