發(fā)布時間：2024-02-02 14:27

　　黃姑魚[Nibea albiflora(Richardson)]屬鱸形目(Perciformes),石首魚科(Sciaenidae),黃姑魚屬(Nibea),是我國近海重要經(jīng)濟魚類。本文通過黃姑魚轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)開發(fā)黃姑魚的微衛(wèi)星標(biāo)記,并將所得的微衛(wèi)星標(biāo)記應(yīng)用于3個黃姑魚群體的遺傳多樣性分析。同時,利用微衛(wèi)星標(biāo)記對雌核發(fā)育一代和二代的純合度進行分析。結(jié)果如下:1、利用MISA軟件對黃姑魚轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)進行分析,共檢索到SSR位點12254個,其中單堿基重復(fù)約占42.70%,二堿基重復(fù)和三堿基重復(fù)分別約占32.11%和23.44%,四堿基、五堿基和六堿基重復(fù)僅分別約占1.60%、0.09%和0.06%。隨機選出120個2⁶堿基重復(fù)SSR設(shè)計PCR引物,有78對引物可擴增獲得目的條帶。利用南海海區(qū)野生黃姑魚樣本對其中的39個具有多態(tài)性的SSR位點進行擴增效果驗證和評價,結(jié)果顯示:從39個位點共檢測到等位基因243個,平均等位基因數(shù)6.23個;平均有效等位基因3.630個;其中有26個位點表現(xiàn)出高多態(tài)性。2、選用黃姑魚轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)開發(fā)的高多態(tài)性微衛(wèi)星分子標(biāo)記18個,對3...

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-1部分組織RNA提取電泳圖

圖2-1部分組織RNA提取電泳圖.2-1ElectrophoresisoftotalRNAextractedfrompartialorganiz；4~6腎臟；7~9脾臟er;4~6Kidney;7~9Spleen標(biāo)準(zhǔn)的組織RNA樣品進行補....

圖2-2從黃姑魚轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中獲得的微衛(wèi)星位點數(shù)Fig.2-2MicrosatellitelocifromtranscriptomeofN.albiflora

圖2-2從黃姑魚轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中獲得的微衛(wèi)星位點數(shù)Fig.2-2MicrosatellitelocifromtranscriptomeofN.albiflora基重復(fù)類型微衛(wèi)星中，AC/GT基序為最主要的重復(fù)單元，共2其次是AG/CT，1024個（占26.....

圖2-3微衛(wèi)星引物YD-54、YD-13、YD-25在三個SOYD個體上擴增的電泳圖

微衛(wèi)星引物YD-54、YD-13、YD-25在三個SOYD個體上擴增ThePCRamplificationresultsofSSRprimersetsYD-54,YD-13aD-54；4~6YD-13；7~9YD-25-54;4~6YD-13....

圖2-4部分位點在混合DNA中的擴增情況

圖2-4部分位點在混合DNA中的擴增情況Fig.2-4ThePCRproductofsomemicrosatellitelociinmixedDNAYD-13；2YD-14；3YD-19；4YD-22；5YD-52；6YD-56；7YD-....

本文編號：3892814