許氏平鲉(Sebastes schlegelii)EST-SSR標(biāo)記開發(fā)及快速生長(zhǎng)選育系遺傳結(jié)構(gòu)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-12-27 18:45
許氏平鲉(Sebastes schlegelii)是我國(guó)北方近海重要的巖礁性魚類,由于具有廣溫廣鹽習(xí)性,可以自然越冬,也是我國(guó)北方沿海深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖和增殖放流的適宜經(jīng)濟(jì)魚種,但近年來其漁業(yè)資源減少嚴(yán)重,因此進(jìn)行許氏平鲉人工繁育及良種選育具有重要的經(jīng)濟(jì)效益和社會(huì)效益。微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)能夠?yàn)樵S氏平鲉良種選育提供一定的技術(shù)支持,尤其是在分子標(biāo)記輔助育種等方面。EST-SSR開發(fā)成本低,且在不同物種間具有一定的通用性,已經(jīng)成為新型高效的開發(fā)微衛(wèi)星標(biāo)記的途徑。許氏平鲉是卵胎生魚類,具有一雌多雄的交配模式,對(duì)其選育系的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行監(jiān)測(cè)、分析其遺傳多樣性以及遺傳分化情況具有十分重要的實(shí)踐意義。本研究首次利用已發(fā)表的許氏平鲉EST序列進(jìn)行EST-SSR標(biāo)記開發(fā),以期為許氏平鲉良種選育提供更多標(biāo)記選擇,同時(shí)選用8對(duì)擴(kuò)增效果好、多態(tài)性豐富的微衛(wèi)星引物對(duì)17個(gè)許氏平鲉快速生長(zhǎng)選育系的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,以期為許氏平鲉種質(zhì)資源保護(hù)、良種選育等工作提供支持。1、許氏平鲉EST-SSR標(biāo)記的開發(fā)及通用性檢測(cè)從NCBI公共數(shù)據(jù)庫(kù)下載的1980條EST序列經(jīng)拼接、SSR位點(diǎn)查找后,發(fā)現(xiàn)EST-SSR位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)率為9.14%...
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
引言
1 許氏平鲉概況
1.1 許氏平鲉的生物學(xué)特征
1.2 許氏平鲉良種選育概況
1.3 許氏平鲉研究進(jìn)展
2 微衛(wèi)星標(biāo)記概述
2.1 微衛(wèi)星標(biāo)記的發(fā)展歷程
2.2 微衛(wèi)星標(biāo)記的特征及形成原理
2.3 微衛(wèi)星標(biāo)記的類型
2.4 微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)
3 微衛(wèi)星標(biāo)記在經(jīng)濟(jì)魚類研究中的應(yīng)用
3.1 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
3.2 遺傳多樣性檢測(cè)
3.3 遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.4 親緣關(guān)系鑒定(家系鑒定和親子鑒定)
4 本研究目的與意義
第一章 許氏平鲉(SEBASTES SCHLEGELII)EST-SSR標(biāo)記篩選
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組DNA的提取結(jié)果
2.2 許氏平鲉EST序列中SSR位點(diǎn)種類、數(shù)量及出現(xiàn)頻率
2.3 引物篩選與優(yōu)化
3 討論
第二章 許氏平鲉EST-SSR引物多態(tài)性和通用性檢測(cè)
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 許氏平鲉野生群體多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
2.2 EST-SSR位點(diǎn)在野生群體中的多態(tài)性評(píng)價(jià)
2.3 許氏平鲉多態(tài)性微衛(wèi)星引物的通用性檢測(cè)結(jié)果
3 討論
第三章 許氏平鲉17個(gè)快速生長(zhǎng)選育系的遺傳結(jié)構(gòu)分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 引物篩選結(jié)果
2.2 PCR擴(kuò)增和SSR分型結(jié)果
2.3 8 個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)性分析
2.4 選育系遺傳多樣性分析
2.5 選育系遺傳結(jié)構(gòu)分析
3 討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
發(fā)表文章
項(xiàng)目支持
致謝
本文編號(hào):3875698
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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1 許氏平鲉概況
1.1 許氏平鲉的生物學(xué)特征
1.2 許氏平鲉良種選育概況
1.3 許氏平鲉研究進(jìn)展
2 微衛(wèi)星標(biāo)記概述
2.1 微衛(wèi)星標(biāo)記的發(fā)展歷程
2.2 微衛(wèi)星標(biāo)記的特征及形成原理
2.3 微衛(wèi)星標(biāo)記的類型
2.4 微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)
3 微衛(wèi)星標(biāo)記在經(jīng)濟(jì)魚類研究中的應(yīng)用
3.1 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
3.2 遺傳多樣性檢測(cè)
3.3 遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.4 親緣關(guān)系鑒定(家系鑒定和親子鑒定)
4 本研究目的與意義
第一章 許氏平鲉(SEBASTES SCHLEGELII)EST-SSR標(biāo)記篩選
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組DNA的提取結(jié)果
2.2 許氏平鲉EST序列中SSR位點(diǎn)種類、數(shù)量及出現(xiàn)頻率
2.3 引物篩選與優(yōu)化
3 討論
第二章 許氏平鲉EST-SSR引物多態(tài)性和通用性檢測(cè)
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 許氏平鲉野生群體多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果
2.2 EST-SSR位點(diǎn)在野生群體中的多態(tài)性評(píng)價(jià)
2.3 許氏平鲉多態(tài)性微衛(wèi)星引物的通用性檢測(cè)結(jié)果
3 討論
第三章 許氏平鲉17個(gè)快速生長(zhǎng)選育系的遺傳結(jié)構(gòu)分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 引物篩選結(jié)果
2.2 PCR擴(kuò)增和SSR分型結(jié)果
2.3 8 個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記的多態(tài)性分析
2.4 選育系遺傳多樣性分析
2.5 選育系遺傳結(jié)構(gòu)分析
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