轉(zhuǎn)化生長因子-β(Transforming growth factorβ,TGF-β)信號(hào)通路是一個(gè)包含眾多成員的大家族,主要由膜外的配體、膜上的受體以及胞內(nèi)的SMADs蛋白組成。該信號(hào)參與介導(dǎo)了多種生物學(xué)過程,尤其在胚胎、組織和器官的發(fā)育與形成等方面發(fā)揮著重要作用。目前的研究報(bào)道都局限于單個(gè)TGF-β信號(hào)通路成員或者單個(gè)亞家族成員在某些組織或者某個(gè)發(fā)育時(shí)期的表達(dá)或功能研究,且研究對(duì)象大多為人類、小鼠和斑馬魚等模式動(dòng)物,而大部分TGF-β信號(hào)通路成員在真骨魚類中的表達(dá)模式和功能仍不清楚。此外,TGF-β信號(hào)通路被認(rèn)為是動(dòng)物基因組進(jìn)化過程的良好標(biāo)記,但TGF-β信號(hào)通路成員在多數(shù)動(dòng)物類群中沒有被全面鑒定過,其演化還不清晰。近年來,研究表明TGF-β信號(hào)通路在真骨魚類性別決定、分化和性腺發(fā)育中也具有非常重要的作用,有多個(gè)成員被證實(shí)為魚類的性別決定基因,還有很多成員也參與了魚類的性別分化。本研究從全基因組水平鑒定了包括尼羅羅非魚在內(nèi)的24種代表性動(dòng)物的TGF-β信號(hào)通路成員,分析了該信號(hào)通路在無脊椎動(dòng)物進(jìn)化過程中以及脊椎動(dòng)物4次基因組復(fù)制過程中的系統(tǒng)演化。基于尼羅羅非魚成魚的8個(gè)不同組織轉(zhuǎn)錄...

【文章頁數(shù)】：109 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 文獻(xiàn)綜述
    1 生物信息學(xué)概述
        1.1 生物信息學(xué)的定義
        1.2 生物信息學(xué)的發(fā)展歷程
    2 復(fù)制基因研究概況
        2.1 復(fù)制基因定義
        2.2 基因家族
        2.3 全基因組復(fù)制
    3 TGF-β信號(hào)通路的研究
        3.1 TGF-β信號(hào)通路的概況
        3.2 TGF-β信號(hào)通路成員
            3.2.1 配體
            3.2.2 受體
            3.2.3 SMADs
        3.3 TGF-β信號(hào)的識(shí)別及作用方式
        3.4 TGF-β信號(hào)介導(dǎo)的生物學(xué)功能
            3.4.1 在發(fā)育中的作用
                3.4.1.1 在胚胎發(fā)育中的作用
                3.4.1.2 在骨骼發(fā)育中的作用
                3.4.1.3 在腫瘤發(fā)生中的作用
            3.4.2 在生殖中的作用
            3.4.3 在魚類性別決定與分化中的作用
                3.4.3.1 脊椎動(dòng)物性別決定基因的研究
                3.4.3.2 TGF-β信號(hào)參與魚類的性別決定與分化
                3.4.3.3 TGF-β信號(hào)參與魚類性別決定與分化的可能機(jī)制
    4 科學(xué)問題的提出和本研究的目的意義
第2章 TGF-β信號(hào)的起源和演化
    1 引言
    2 材料和方法
        2.1 數(shù)據(jù)庫本地Blast的構(gòu)建
        2.2 TGF-β信號(hào)通路成員序列的分離
        2.3 配體系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.4 受體系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.5 SMADs系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.6 TGF-β信號(hào)通路成員在基因組上的定位
    3 結(jié)果
        3.1 TGF-β信號(hào)通路成員在動(dòng)物界中的分離鑒定
        3.2 配體的系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.3 受體的系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.4 SMADs的系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.5 TGF-β信號(hào)通路成員的基因組定位分析
    4 討論
        4.1 TGF-β信號(hào)通路的起源與演化
        4.2 TGF-β信號(hào)通路成員的擴(kuò)張與基因組進(jìn)化的關(guān)系
        4.3 TGF-β信號(hào)通路成員的共線性
第3章 TGF-β信號(hào)通路成員在尼羅羅非魚中的表達(dá)研究
    1 引言
    2 材料和方法
        2.1 實(shí)驗(yàn)魚
        2.2 引物合成
        2.3 主要試劑
        2.4 實(shí)驗(yàn)方法
        2.5 主要儀器
        2.6 TGF-β信號(hào)通路成員的時(shí)空表達(dá)模式
        2.7 TGF-β信號(hào)通路成員表達(dá)模式的驗(yàn)證
    3 結(jié)果
        3.1 TGF-β信號(hào)通路成員在尼羅羅非魚8 個(gè)組織中的表達(dá)模式
        3.2 TGF-β信號(hào)通路成員在尼羅羅非魚各時(shí)期性腺轉(zhuǎn)錄組中的表達(dá)
        3.3 實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證TGF-β信號(hào)通路成員的表達(dá)模式
    4 討論
        4.1 TGF-β信號(hào)通路成員在尼羅羅非魚8 個(gè)組織中的表達(dá)及其可能作用
        4.2 TGF-β信號(hào)通路成員在尼羅羅非魚各時(shí)期性腺中的表達(dá)及其可能作用
        4.3 TGF-β信號(hào)通路成員在尼羅羅非魚性腺表達(dá)的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證與結(jié)果分析
第4章 結(jié)論
本研究的主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)
本研究的不足與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表論文
在讀期間參加科研情況
附表



本文編號(hào)：3827211