鳙魚蛋白磷酸酶(PP1)基因家族的克
發(fā)布時間:2023-05-03 11:43
鱖魚是我國主要的名貴經(jīng)濟(jì)魚類之一,具有無肌間刺,肉質(zhì)鮮美等特點(diǎn)。在野生自然環(huán)境中,鱖魚從一開口就只攝食活的餌料魚,拒絕攝食死餌料魚和人工飼料。但是,當(dāng)通過適當(dāng)方法進(jìn)行人工馴養(yǎng)后,部分鱖魚可以攝食冰鮮餌料魚,甚至是人工飼料。目前對鱖魚馴食人工飼料個體差異的分子機(jī)制還很少有文章報道。本課題組通過對易馴食和不易馴食冰鮮的鱖魚轉(zhuǎn)錄組分析,發(fā)現(xiàn)鱖魚馴食與視覺、食欲、節(jié)律、學(xué)習(xí)記憶等相關(guān)通路有著重要的關(guān)系。絲氨酸/蘇氨酸蛋白磷酸酶1(Serine/threonine protein phosphatase,PP1)是學(xué)習(xí)記憶通路中一個重要的蛋白磷酸酶。許多研究已表明PP1在哺乳動物腦中具有抑制學(xué)習(xí)和長時程記憶的作用。在本研究中,我們探究鱖魚PP1家族中四個亞型基因與鱖魚接受人工飼料個體差異的關(guān)系,試圖為研究鱖魚接受人工飼料個體差異的分子機(jī)制提供理論知識。我們采用了PCR和RACE技術(shù)克隆了鱖魚四個PP1亞型PP1caa、PP1cab、PP1cb和PP1cc基因的c DNA序列。通過序列分析發(fā)現(xiàn),PP1caa基因c DNA序列3131bp,編碼325個氨基酸;PP1cab基因cDNA序列1336bp...
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
中英文縮寫對照表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1. 研究背景
1.1 鱖魚的養(yǎng)殖現(xiàn)狀及養(yǎng)殖中的問題
1.2 鱖魚馴食研究現(xiàn)狀
2. 學(xué)習(xí)記憶與攝食的關(guān)系研究進(jìn)展
2.1 學(xué)習(xí)記憶的研究進(jìn)展以及與攝食的關(guān)系
2.2 學(xué)習(xí)記憶與鱖魚攝食行為的關(guān)系研究進(jìn)展
3. 蛋白磷酸酶(PP1)基因家族研究進(jìn)展
3.1 PP1成員類型及生理功能
3.2 PP1與學(xué)習(xí)記憶的關(guān)系
4. 單核苷酸多態(tài)性
4.1 SNP及其檢測技術(shù)
4.2 SNP與性狀的關(guān)系
4.3 SNP在輔助育種上的應(yīng)用
5. 本文研究目的與意義
第二章 材料與方法
1. 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 主要試劑
1.2 主要儀器
1.3 實(shí)驗(yàn)魚
2. 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 鱖魚馴化與取樣
2.2 DNA的提取與檢測
2.3 RNA的提取與檢測
2.4 鱖魚PP1基因核心片段擴(kuò)增
2.4.1 cDNA第一條鏈的合成
2.4.2 PP1基因核心片段PCR擴(kuò)增
2.4.3 切膠純化基因片段
2.5 PP1cab基因 3’- RACE克隆
2.5.1 引物設(shè)計和合成特異性cDNA第一鏈
2.5.2 3’-RACE擴(kuò)增
2.5.3 目的片段的連接轉(zhuǎn)化
2.5.4 序列拼接與分析
2.6 鱖魚PP1基因mRNA表達(dá)水平分析
2.6.1 特異性引物的設(shè)計
2.6.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
2.6.3 熒光定量PCR檢測
2.7 鱖魚PP1基因組SNP位點(diǎn)篩查
2.7.1 鱖魚PP1四個亞型基因組序列的克隆
2.7.2 鱖魚PP1四個亞型基因組SNP位點(diǎn)篩查
2.7.3 鱖魚PP1caa和PP1cb基因SNP位點(diǎn)的分型
2.7.4 SNP位點(diǎn)與鱖魚馴食性狀的相關(guān)性分析
2.8 PP1caa和PP1cb突變位點(diǎn)轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測分析
第三章 結(jié)果與分析
1. 基因組DNA提取以及檢測
2. 總RNA提取以及反轉(zhuǎn)錄
3. 鱖魚PP1基因cDNA的克隆
4. 鱖魚PP1基因序列分析
5. 鱖魚PP1基因mRNA的組織分布
6. 在易馴食和不易馴食鱖魚中PP1基因mRNA表達(dá)分析
7. 鱖魚PP1caa和PP1cb基因SNP篩查和分型
8. 鱖魚PP1caa和PP1cb基因突變位點(diǎn)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合預(yù)測分析
第四章 討論
第五章 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
碩士期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號:3806725
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ABSTRACT
中英文縮寫對照表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1. 研究背景
1.1 鱖魚的養(yǎng)殖現(xiàn)狀及養(yǎng)殖中的問題
1.2 鱖魚馴食研究現(xiàn)狀
2. 學(xué)習(xí)記憶與攝食的關(guān)系研究進(jìn)展
2.1 學(xué)習(xí)記憶的研究進(jìn)展以及與攝食的關(guān)系
2.2 學(xué)習(xí)記憶與鱖魚攝食行為的關(guān)系研究進(jìn)展
3. 蛋白磷酸酶(PP1)基因家族研究進(jìn)展
3.1 PP1成員類型及生理功能
3.2 PP1與學(xué)習(xí)記憶的關(guān)系
4. 單核苷酸多態(tài)性
4.1 SNP及其檢測技術(shù)
4.2 SNP與性狀的關(guān)系
4.3 SNP在輔助育種上的應(yīng)用
5. 本文研究目的與意義
第二章 材料與方法
1. 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 主要試劑
1.2 主要儀器
1.3 實(shí)驗(yàn)魚
2. 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 鱖魚馴化與取樣
2.2 DNA的提取與檢測
2.3 RNA的提取與檢測
2.4 鱖魚PP1基因核心片段擴(kuò)增
2.4.1 cDNA第一條鏈的合成
2.4.2 PP1基因核心片段PCR擴(kuò)增
2.4.3 切膠純化基因片段
2.5 PP1cab基因 3’- RACE克隆
2.5.1 引物設(shè)計和合成特異性cDNA第一鏈
2.5.2 3’-RACE擴(kuò)增
2.5.3 目的片段的連接轉(zhuǎn)化
2.5.4 序列拼接與分析
2.6 鱖魚PP1基因mRNA表達(dá)水平分析
2.6.1 特異性引物的設(shè)計
2.6.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
2.6.3 熒光定量PCR檢測
2.7 鱖魚PP1基因組SNP位點(diǎn)篩查
2.7.1 鱖魚PP1四個亞型基因組序列的克隆
2.7.2 鱖魚PP1四個亞型基因組SNP位點(diǎn)篩查
2.7.3 鱖魚PP1caa和PP1cb基因SNP位點(diǎn)的分型
2.7.4 SNP位點(diǎn)與鱖魚馴食性狀的相關(guān)性分析
2.8 PP1caa和PP1cb突變位點(diǎn)轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測分析
第三章 結(jié)果與分析
1. 基因組DNA提取以及檢測
2. 總RNA提取以及反轉(zhuǎn)錄
3. 鱖魚PP1基因cDNA的克隆
4. 鱖魚PP1基因序列分析
5. 鱖魚PP1基因mRNA的組織分布
6. 在易馴食和不易馴食鱖魚中PP1基因mRNA表達(dá)分析
7. 鱖魚PP1caa和PP1cb基因SNP篩查和分型
8. 鱖魚PP1caa和PP1cb基因突變位點(diǎn)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合預(yù)測分析
第四章 討論
第五章 小結(jié)
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