草魚3種丙酮酸激酶和α-淀粉酶基因的結(jié)構(gòu)、表達(dá)分析和生長(zhǎng)相關(guān)標(biāo)記篩選
發(fā)布時(shí)間:2023-03-04 00:45
飼料中的糖類物質(zhì)是成本較低的供能物質(zhì),但與哺乳動(dòng)物相比,魚類對(duì)糖的利用率是較低的。本研究選取了魚類糖利用關(guān)鍵酶中的丙酮酸激酶(pyruvate kinase,PK)和α-淀粉酶(α-amylase,AMY)作為研究對(duì)象,分析了PK基因和AMY基因的c DNA序列,組織表達(dá)特征以及早期發(fā)育的表達(dá)譜,并將編碼這兩種酶的基因作為篩選草魚生長(zhǎng)相關(guān)SNPs的候選基因,以期對(duì)草魚飼料中糖類物質(zhì)的合理添加量提供一定的指導(dǎo),同時(shí)為草魚分子標(biāo)記輔助育種提供更多的標(biāo)記。具體研究?jī)?nèi)容如下:1.草魚三種丙酮酸激酶基因的c DNA序列分析、組織表達(dá)特征和早期發(fā)育的表達(dá)譜。c DNA序列分析結(jié)果顯示:草魚的PKL基因ORF長(zhǎng)1617bp,編碼538個(gè)氨基酸;PKMb基因ORF長(zhǎng)1587bp,編碼528個(gè)氨基酸;PK-like基因ORF長(zhǎng)1599bp,編碼532個(gè)氨基酸。應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR(real-time PCR)檢測(cè)了草魚三種類型的丙酮酸激酶基因PKL、PKMb和PK-like在不同組織和早期發(fā)育不同時(shí)期的相對(duì)表達(dá)量。組織表達(dá)定量分析結(jié)果顯示:PKL主要在肝臟、前腸、中腸和腎臟中表達(dá),PKMb在肌肉中表達(dá)量最...
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 魚類丙酮酸激酶(PK)的研究進(jìn)展
1.2 魚類a-淀粉酶的研究進(jìn)展
1.3 魚類生長(zhǎng)性狀相關(guān)SNP分子標(biāo)記的研究進(jìn)展
1.4 草魚研究簡(jiǎn)介
1.5 小結(jié)
1.6 本研究的目的與意義
第二章 草魚3種丙酮酸激酶基因的結(jié)構(gòu)和表達(dá)特征
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)魚和樣品準(zhǔn)備
2.1.2 總RNA的提取及cDNA的合成
2.1.3 熒光定量PCR
2.1.4 生物信息學(xué)分析
2.1.5 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 目的基因cDNA序列分析
2.2.2 草魚PKL、PKMb和PK-like相對(duì)組織定量
2.3 討論
2.3.1 草魚PKL、PKMb和PK-like的同工酶類型分析
2.3.2 草魚PKL、PKMb和PK-like在不同組織和早期發(fā)育的相對(duì)表達(dá)分析
第三章 草魚2種丙酮酸激酶基因SNP篩選及生長(zhǎng)關(guān)聯(lián)分析
3.1 2 種丙酮酸激酶基因SNP在隨機(jī)群體中與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
3.1.1 材料與方法
3.1.2 結(jié)果與分析
3.2 2 種丙酮酸激酶基因在不同糖水平下與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 材料與方法
3.2.2 結(jié)果與分析
3.3 討論
第四章 草魚 α -淀粉酶基因的結(jié)構(gòu)和表達(dá)特征
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)魚和樣品準(zhǔn)備
4.1.2 總RNA的提取及cDNA的合成
4.1.3 熒光定量PCR
4.1.4 生物信息學(xué)分析
4.1.5 數(shù)據(jù)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 草魚AMY基因cDNA序列及其編碼的氨基酸分析
4.2.2 草魚α -淀粉酶的相對(duì)組織定量
4.2.3 草魚α -淀粉酶基因在早期發(fā)育不同階段的表達(dá)
4.3 討論
第五章 草魚 α -淀粉酶基因SNP篩選及其與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
5.1 α -淀粉酶基因SNP在隨機(jī)群體中與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
5.1.1 材料與方法
5.1.2 結(jié)果與分析
5.2 α -淀粉酶基因SNP在不同糖水平下與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
5.2.1 材料與方法
5.2.2 結(jié)果與分析
5.3 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄1 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
本文編號(hào):3753411
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 魚類丙酮酸激酶(PK)的研究進(jìn)展
1.2 魚類a-淀粉酶的研究進(jìn)展
1.3 魚類生長(zhǎng)性狀相關(guān)SNP分子標(biāo)記的研究進(jìn)展
1.4 草魚研究簡(jiǎn)介
1.5 小結(jié)
1.6 本研究的目的與意義
第二章 草魚3種丙酮酸激酶基因的結(jié)構(gòu)和表達(dá)特征
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)魚和樣品準(zhǔn)備
2.1.2 總RNA的提取及cDNA的合成
2.1.3 熒光定量PCR
2.1.4 生物信息學(xué)分析
2.1.5 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 目的基因cDNA序列分析
2.2.2 草魚PKL、PKMb和PK-like相對(duì)組織定量
2.3 討論
2.3.1 草魚PKL、PKMb和PK-like的同工酶類型分析
2.3.2 草魚PKL、PKMb和PK-like在不同組織和早期發(fā)育的相對(duì)表達(dá)分析
第三章 草魚2種丙酮酸激酶基因SNP篩選及生長(zhǎng)關(guān)聯(lián)分析
3.1 2 種丙酮酸激酶基因SNP在隨機(jī)群體中與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
3.1.1 材料與方法
3.1.2 結(jié)果與分析
3.2 2 種丙酮酸激酶基因在不同糖水平下與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 材料與方法
3.2.2 結(jié)果與分析
3.3 討論
第四章 草魚 α -淀粉酶基因的結(jié)構(gòu)和表達(dá)特征
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)魚和樣品準(zhǔn)備
4.1.2 總RNA的提取及cDNA的合成
4.1.3 熒光定量PCR
4.1.4 生物信息學(xué)分析
4.1.5 數(shù)據(jù)分析
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 草魚AMY基因cDNA序列及其編碼的氨基酸分析
4.2.2 草魚α -淀粉酶的相對(duì)組織定量
4.2.3 草魚α -淀粉酶基因在早期發(fā)育不同階段的表達(dá)
4.3 討論
第五章 草魚 α -淀粉酶基因SNP篩選及其與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
5.1 α -淀粉酶基因SNP在隨機(jī)群體中與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
5.1.1 材料與方法
5.1.2 結(jié)果與分析
5.2 α -淀粉酶基因SNP在不同糖水平下與生長(zhǎng)的關(guān)聯(lián)分析
5.2.1 材料與方法
5.2.2 結(jié)果與分析
5.3 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
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本文編號(hào):3753411
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