通過PCR擴增并測序,獲得并分析了對蝦科（Penaeidae）15個種類的線粒體基因組（mtDNA）中細胞色素C氧化酶亞基I基因（COI）部分序列,分析了基于COI基因的DNA條形碼在鑒別對蝦科蝦類中的應(yīng)用。并應(yīng)用核蛋白編碼基因PEPCK基因和NaK基因?qū)ξr科15種蝦類的分子系統(tǒng)進化進行了研究,主要結(jié)果如下:1、在對蝦科15種蝦類137個個體的長度為634bp的COI基因部分序列中,共檢測到了 324個多態(tài)位點,其中有235個簡約信息位點�；贑OI基因序列的對蝦科15個種類DNA條形碼研究結(jié)果顯示,對蝦科物種的種間遺傳距離平均值是0.223,是種內(nèi)平均遺傳距離（0.0185）的12倍以上,符合Hebert提出的利用COI基因序列有效鑒別物種的標(biāo)準(zhǔn)。所構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹表明,基于COI基因的DNA條形碼適用于對蝦科物種的分類鑒別。2、15種蝦類的PEPCK基因序列長度為549bp,存在堿基的插入和缺失,在549bp堿基中,共檢測到204個多態(tài)位點,簡約信息位點163個�；赑EPCK基因所構(gòu)建的MP、ML和NJ系統(tǒng)發(fā)育樹的分支結(jié)構(gòu)圖的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本一致,MP、ML和NJ系統(tǒng)發(fā)育樹中同種蝦... 

【文章來源】：廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：80 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

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【參考文獻】：
期刊論文
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[3]海參DNA條形碼的構(gòu)建及應(yīng)用[J]. 律迎春,左濤,唐慶娟,段高飛,王春霞,李晉,徐潔,薛長湖.  中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(04)
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[9]DNA條形碼技術(shù)的研究進展及其應(yīng)用[J]. 彭居俐,王緒楨,何舜平.  水生生物學(xué)報. 2008(06)
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碩士論文
[1]東亞特有鯉科類群的DNA條形碼研究及其系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 彭居俐.中國科學(xué)院研究生院（水生生物研究所） 2007



本文編號：3099590