全球氣候變化導(dǎo)致的珊瑚白化和死亡現(xiàn)象,嚴(yán)重影響了海洋生態(tài)系統(tǒng)的平衡,已經(jīng)成為世界最廣泛關(guān)注的問題之一,如若情況繼續(xù)惡化,將會給人類帶來不可估量的損失和災(zāi)難。珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)在海洋生態(tài)系統(tǒng)中起著重要的作用,但到目前為止,人們對珊瑚白化的機制和機理知之尚少。為了更好的了解珊瑚在溫度脅迫下表達調(diào)控規(guī)律和分子機制,本研究以廣東徐聞珊瑚礁國家級自然保護區(qū)較為常見的盔形珊瑚屬（GalaxeaOken）中的稀杯盔形珊瑚（Galaxea astreata）為研究對象,應(yīng)用Illumina HiSeqTM2000高通量測序技術(shù)對不同溫度脅迫下的稀杯盔形珊瑚進行轉(zhuǎn)錄組測序,并利用生物信息學(xué)知識對其進行相關(guān)的分析,結(jié)果如下:1稀杯盔形珊瑚在溫度脅迫12h后發(fā)現(xiàn),對照組即正常溫度組的（27℃）珊瑚觸手全部伸展且生活狀況良好;高溫組（35℃）和低溫組（14℃）珊瑚的觸手都已全部完全縮回,部分珊瑚出現(xiàn)很明顯的變白現(xiàn)象,有些甚至已經(jīng)死亡。2通過Illumina HiSeq TM2000測序,三個樣本總共獲得135,781,662條reads（短序列）,經(jīng)過組裝共獲得94,002條基因。通過功能注釋共得到42,240條... 

【文章來源】：廣東海洋大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 珊瑚及珊瑚礁
        1.1.1 珊瑚
        1.1.2 珊瑚礁
    1.2 珊瑚的研究進展
        1.2.1 珊瑚白化的研究
        1.2.2 珊瑚在功能基因方面的研究
        1.2.3 珊瑚轉(zhuǎn)錄組和基因組的研究
    1.3 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的研究進展
        1.3.1 轉(zhuǎn)錄組的含義
        1.3.2 轉(zhuǎn)錄組測序的發(fā)展
        1.3.3 轉(zhuǎn)錄組測序的應(yīng)用
    1.4 本研究的目的及意義
2 材料、設(shè)備與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 樣品采集及處理
        2.1.2 試劑
    2.2 儀器及設(shè)備
    2.3 實驗方法
        2.3.1 溫度脅迫
        2.3.2 珊瑚RNA的提取
        2.3.3 轉(zhuǎn)錄組測序及生物信息學(xué)分析
        2.3.4 基因克隆
        2.3.5 熒光定量驗證
3 實驗結(jié)果與分析
    3.1 珊瑚溫度脅迫
    3.2 轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果與分析
        3.2.1 樣品質(zhì)檢
        3.2.2 轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果分析
    3.3 基因克隆結(jié)果與分析
        3.3.0 RNA提取
        3.3.1 稀杯盔形珊瑚Hsp70基因克隆結(jié)果
        3.3.2 稀杯盔形珊瑚Hsp40基因克隆結(jié)果
    3.4 實時熒光定量結(jié)果與分析
4 討論
    4.1 溫度脅迫的研究
    4.2 轉(zhuǎn)錄組分析
        4.2.1 Unigene功能注釋及分析
        4.2.2 Unigene富集分析
    4.3 基因克隆與分析
        4.3.1 基因比對與分析
        4.3.2 Hsp40與Hsp70基因分析
    4.4 熒光定量PCR分析與驗證
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
作者簡介
導(dǎo)師簡介


【參考文獻】：
期刊論文
[1]澄黃濱珊瑚ferritin基因部分cDNA序列的獲得及分析[J]. 許昌有,黃暉,練健生,尤豐,袁濤,周國偉.  科學(xué)通報. 2013(17)
[2]四種環(huán)境因子對澄黃濱珊瑚和斯氏角孔珊瑚脅迫作用研究[J]. 劉麗,李澤鵬,申玉春,楊小東.  熱帶海洋學(xué)報. 2013(03)
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[4]基于線粒體基因的石珊瑚分子系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 劉麗,李曉娜,陳育盛,劉楚吾.  海洋與湖沼. 2012(04)
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[6]徐聞珊瑚礁的現(xiàn)狀與保護性開發(fā)[J]. 劉金祥.  湛江師范學(xué)院學(xué)報. 2006(03)
[7]珊瑚礁區(qū)的生物多樣性及其生態(tài)功能[J]. 趙美霞,余克服,張喬民.  生態(tài)學(xué)報. 2006(01)
[8]人類活動對徐聞燈樓角珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)的影響[J]. 王麗榮,趙煥庭,宋朝景.  海洋開發(fā)與管理. 2006(01)
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碩士論文
[1]盔形珊瑚屬HSP90、Ferritin、CuZnSOD基因的克隆與表達分析[D]. 徐秀菊.廣東海洋大學(xué) 2015



本文編號：3071965