日本鰻鱺Caspase6基因的克隆和表達分析
發(fā)布時間:2021-02-04 17:53
本研究首次獲得了日本鰻鱺(Anguilla japonica)Caspase6基因cDNA全長序列,命名為AjCasp6(GenBank號KJ726738)。該基因全長為1524 bp,其中開放閱讀框(Open Reading Frame,ORF)為903 bp,編碼300個氨基酸。其蛋白三維空間結構圖與人類Caspase6十分相似,具有Caspase家族典型的CASc結構域,包括一個P20結構域(54aa-178 aa)和一個P10結構域(204 aa-298 aa),半胱氨酸活性位點“KPKIFIFQACRG”及組氨酸活性位點“HADADCFVCVFLSHG”。同源性分析顯示AjCasp6氨基酸序列與虹鱒(Oncorhynchus mykiss)相似性最高,為75%,與其他魚類相似性在61%75%之間。系統(tǒng)發(fā)育樹表明,AjCasp6與其他魚類Caspase6聚為一支,而哺乳類以及兩棲類Caspase6聚為一支。實時熒光定量PCR(qRT-PCR)結果表明:AjCasp6基因在日本鰻鱺各組織中均有表達,其中鰓中表達量最高,腸、肝臟、腎臟、皮膚和血細胞中也有較高表...
【文章來源】:集美大學福建省
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
RACE-PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳結果
日本鰻第 3 章 結果組織總 RNA 的提取結果檢測 RNA 的濃度及純度,結果表明明 RNA 樣品的純度較高? RNA 樣且完整的 28 S 和 18 S rRNA 電泳條量良好,可用于后續(xù)試驗。
學碩士學位論文 日本鰻鱺 Caspase6 基因的克隆和表 AjCasp6 基因在日本鰻鱺各組織中表達分析.1 AjCasp6 基因在天然狀態(tài)下的組織表達分析光定量 PCR 檢測結果表明:在天然狀況下,日本鰻鱺 Caspase6 在各組織中表達水平差異較大。其中鰓中的表達量最高,腸、肝臟、腎臟、皮膚和血細的表達水平,但在心臟和肌肉中表達量相對較低(圖 3-7)。其中,**表示 鰓中表達存在極顯著性差異(P<0.01);*表示 AjCasp6 基因在腸和皮膚組織異(P<0.05)。AjCasp6 基因在體內(nèi)和體外表達分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]團頭魴(Megahbrama amblycephala) Caspase 9基因全長cDNA的克隆及在氨氮脅迫下的表達分析[J]. 章瓊,孫盛明,李冰,蔣高中,朱健,戈賢平. 漁業(yè)科學進展. 2016(01)
[2]歐洲鰻鱺Anguilla anguilla尾鰭細胞系的建立以及不同生長因子對其增殖的影響[J]. 莊道華,陳蕓,張子平,王藝磊. 中國細胞生物學學報. 2013(06)
[3]海水魚類細胞系建立、鑒定及應用[J]. 魏云波,劉書花,張瑞凌,李福偉,王興民. 科技創(chuàng)新導報. 2011(31)
[4]鰻鱺細菌性疾病的研究概況[J]. 郭松林. 科學養(yǎng)魚. 2011(07)
[5]大黃魚鰭細胞系的建立及久效磷對其毒性作用的研究[J]. 樊廷俊,孫愛,楊秀霞,姜國建,徐曉輝,郭雪陽. 中國海洋大學學報(自然科學版). 2010(12)
[6]條斑星鰈連續(xù)性鰭細胞系的建立與鑒定[J]. 樊廷俊,徐曉輝,姜國建,郭雪陽,孫愛,徐彬. 山東大學學報(理學版). 2010(05)
[7]Caspase Family Proteases and Apoptosis[J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[8]人重構型caspase-6基因在Hep-2細胞中的表達[J]. 許彥鳴,王立鋒,劉大慶,張瑞,王成濟,楊安鋼. 第四軍醫(yī)大學學報. 2003(24)
[9]caspase-6基因誘導成骨肉瘤細胞凋亡[J]. 丁勇,范清宇,崔大祥,張殿忠,殷劍寧. 中國腫瘤生物治療雜志. 2002(04)
[10]Caspase-6誘導腎癌細胞株GRC-1細胞凋亡的研究[J]. 劉賀亮,崔大祥,陳勇,王禾,陳寶琦,邵國興,陳長生. 疾病控制雜志. 2002(03)
博士論文
[1]大黃魚(Pseudosciaena crocea)三種組織細胞系的建立、鑒定及其應用的初步研究[D]. 孫愛.中國海洋大學 2010
[2]幾種重要海水養(yǎng)殖魚類細胞系的建立、鑒定及應用[D]. 任國誠.中國海洋大學 2007
碩士論文
[1]大黃魚HSP及caspase家族部分基因對溫度脅迫的響應[D]. 楊啟蓮.集美大學 2011
本文編號:3018705
【文章來源】:集美大學福建省
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
RACE-PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳結果
日本鰻第 3 章 結果組織總 RNA 的提取結果檢測 RNA 的濃度及純度,結果表明明 RNA 樣品的純度較高? RNA 樣且完整的 28 S 和 18 S rRNA 電泳條量良好,可用于后續(xù)試驗。
學碩士學位論文 日本鰻鱺 Caspase6 基因的克隆和表 AjCasp6 基因在日本鰻鱺各組織中表達分析.1 AjCasp6 基因在天然狀態(tài)下的組織表達分析光定量 PCR 檢測結果表明:在天然狀況下,日本鰻鱺 Caspase6 在各組織中表達水平差異較大。其中鰓中的表達量最高,腸、肝臟、腎臟、皮膚和血細的表達水平,但在心臟和肌肉中表達量相對較低(圖 3-7)。其中,**表示 鰓中表達存在極顯著性差異(P<0.01);*表示 AjCasp6 基因在腸和皮膚組織異(P<0.05)。AjCasp6 基因在體內(nèi)和體外表達分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]團頭魴(Megahbrama amblycephala) Caspase 9基因全長cDNA的克隆及在氨氮脅迫下的表達分析[J]. 章瓊,孫盛明,李冰,蔣高中,朱健,戈賢平. 漁業(yè)科學進展. 2016(01)
[2]歐洲鰻鱺Anguilla anguilla尾鰭細胞系的建立以及不同生長因子對其增殖的影響[J]. 莊道華,陳蕓,張子平,王藝磊. 中國細胞生物學學報. 2013(06)
[3]海水魚類細胞系建立、鑒定及應用[J]. 魏云波,劉書花,張瑞凌,李福偉,王興民. 科技創(chuàng)新導報. 2011(31)
[4]鰻鱺細菌性疾病的研究概況[J]. 郭松林. 科學養(yǎng)魚. 2011(07)
[5]大黃魚鰭細胞系的建立及久效磷對其毒性作用的研究[J]. 樊廷俊,孫愛,楊秀霞,姜國建,徐曉輝,郭雪陽. 中國海洋大學學報(自然科學版). 2010(12)
[6]條斑星鰈連續(xù)性鰭細胞系的建立與鑒定[J]. 樊廷俊,徐曉輝,姜國建,郭雪陽,孫愛,徐彬. 山東大學學報(理學版). 2010(05)
[7]Caspase Family Proteases and Apoptosis[J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[8]人重構型caspase-6基因在Hep-2細胞中的表達[J]. 許彥鳴,王立鋒,劉大慶,張瑞,王成濟,楊安鋼. 第四軍醫(yī)大學學報. 2003(24)
[9]caspase-6基因誘導成骨肉瘤細胞凋亡[J]. 丁勇,范清宇,崔大祥,張殿忠,殷劍寧. 中國腫瘤生物治療雜志. 2002(04)
[10]Caspase-6誘導腎癌細胞株GRC-1細胞凋亡的研究[J]. 劉賀亮,崔大祥,陳勇,王禾,陳寶琦,邵國興,陳長生. 疾病控制雜志. 2002(03)
博士論文
[1]大黃魚(Pseudosciaena crocea)三種組織細胞系的建立、鑒定及其應用的初步研究[D]. 孫愛.中國海洋大學 2010
[2]幾種重要海水養(yǎng)殖魚類細胞系的建立、鑒定及應用[D]. 任國誠.中國海洋大學 2007
碩士論文
[1]大黃魚HSP及caspase家族部分基因對溫度脅迫的響應[D]. 楊啟蓮.集美大學 2011
本文編號:3018705
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