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草魚腫瘤壞死因子配體15(TNFSF15/TL1A)及其受體25(TNFRSF25)的進化與表達分析

發(fā)布時間:2021-01-01 21:05
  腫瘤壞死因子配體(TNFSF)和受體(TNFRSF)超家族在機體免疫炎癥,增殖分化和造血功能中發(fā)揮著多種作用。迄今為止,在人類中已經鑒定出19種配體超家族和29種受體超家族成員;在硬骨魚中先后鑒定出14種配體超家族成員。TNFSF15/TL1A基因是在2002年由Migone等人首次報道,是由四個外顯子和三個內含子組成。TNFRSF25(又名DR3、Wsl-1、TR3、Apo-3、TRAMP、TNFRSF12)是在1996年由Kitson等人在人類基因組中挖掘與TNFR1同源并含有死亡結構域的序列時被首次報道。草魚在我國養(yǎng)殖歷史悠久,是最重要的經濟魚類。然而,我國養(yǎng)殖產業(yè)一直備受草魚疾病的困擾。研究草魚免疫炎癥無論是對實際生產養(yǎng)殖還是對免疫理論的發(fā)展都有重要意義。本研究克隆了草魚TNFSF15/TL1A及TNFRSF25基因,分析其序列。并用柱狀黃桿菌(F.cloumnare)和草魚出血病病毒(GCRV)對健康的草魚進行感染,檢測TNFSF15/TL1A及TNFRSF25基因在草魚不同組織中的表達情況。利用大腸桿菌原核表達技術表達并純化了目的基因的重組蛋白。取得了以下成果:1.分別克隆... 

【文章來源】:上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】:101 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

草魚腫瘤壞死因子配體15(TNFSF15/TL1A)及其受體25(TNFRSF25)的進化與表達分析


TNFSF15/TL1A和TNFRSF25結合誘導兩種不同的信號轉導途徑Fig.1-1LigationofTNFSF15/TL1AtoTNFRSF25activatestwodistinctdownstreamsignaling

氨基酸序列分析,草魚,核苷酸,電鰻


237) 的TNF家族同源結構域THD。如圖2-1中分別用黃色高亮和灰色陰影標出TM和THD區(qū)域。Disphos預測CiTNFSF15/TL1A蛋白序列中存在一個絲氨酸磷酸化位點 (phosphorylatedserines site) 位于Ser82,在圖2-1中用紅色標記。圖 2-1 草魚 TNFSF15/TL1A 核苷酸和氨基酸序列分析Fig 2-1 Nucleotide and amino acid cequence analysis of CiTNFSF15/TL1A.在NCBI及Ensembl中搜索人、鼠、雞和斑馬魚的TNFSF15/TL1A及電鰻、虹鱒TNFSF15-like (TNFSF15L) 的基因序列并進行氨基酸序列比對。表 2-1 顯示CiTNFSF15/TL1A 與 人 、 雞 和 小 鼠 的 TNFSF15/TL1A 蛋 白 序 列 一 致 性 較 低(18%-21%)。同樣CiTNFSF15/TL1A與電鰻和虹鱒的TNFSF15L蛋白的序列一致性也低于30%。而斑馬魚TNFSF15/TL1A與草魚TNFSF15/TL1A蛋白序列一致性可達53.3%。圖2-2的氨基酸多序列比對結果同樣清晰的證明,CiTNFSF15/TL1A蛋白序

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同樣CiTNFSF15/TL1A與電鰻和虹鱒的TNFSF15L蛋白的序列一致性也低于30%。而斑馬魚TNFSF15/TL1A與草魚TNFSF15/TL1A蛋白序列一致性可達53.3%。圖2-2的氨基酸多序列比對結果同樣清晰的證明,CiTNFSF15/TL1A蛋白序

【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同水溫下柱狀黃桿菌對草魚感染力的研究[J]. 陳霞,盧伶俐,溫周瑞,葉嶸,李丹,李文華.  養(yǎng)殖與飼料. 2017(07)
[2]草魚呼腸病毒研究進展[J]. 李賢,曾偉偉,王慶,王英英,李瑩瑩,石存斌,吳淑勤.  動物醫(yī)學進展. 2016(07)
[3]嗜水氣單胞菌和大腸桿菌LPS對草魚免疫相關基因表達的影響[J]. 彭小云,劉紅,陳孝煊,張棋,袁娟,劉佳佳,吳志新.  華中農業(yè)大學學報. 2014(01)
[4]水生動物致病菌——柱狀黃桿菌研究進展[J]. 黃錦爐,汪開毓,黃藝丹,陳德芳.  中國水產. 2009(10)
[5]一株新的草魚出血病病毒分離物的特性[J]. 柯麗華,方勤,蔡宜權.  水生生物學報. 1990(02)

碩士論文
[1]長牡蠣腫瘤壞死因子(CgTNF-1)免疫調節(jié)機制的初步研究[D]. 孫穎.中國科學院研究生院(海洋研究所) 2014



本文編號:2951992

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