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基于線粒體控制區(qū)序列的中國沿海3種鯛科魚類遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2020-05-29 22:54
【摘要】:鯛科(Sparidae)魚類隸屬硬骨魚綱(Osteichthyes)鱸形目(Perciformes)鱸亞目(Percoidei),廣泛分布于溫帶及熱帶沿海,不僅捕撈量大,養(yǎng)殖產(chǎn)量高,且多數(shù)種類肉質(zhì)鮮美,營養(yǎng)價值高,是世界重要的經(jīng)濟魚類。鯛科魚類是中國東南沿海底拖網(wǎng)漁業(yè)的重要捕撈對象,其中真鯛(Pagrus major)是我國海洋“四大名魚”之一,與黑鯛(Acanthopagrus schlegeli)、平鯛(Rhabdosargus sarba)等同為我國近海重要的養(yǎng)殖對象,但近年來真鯛已不能形成魚汛,黑鯛、平鯛野生資源急劇下降。為此,本文分析了中國沿海11個群體238尾真鯛(含1韓國群體),12個群體266尾黑鯛及6個群體137尾平鯛線粒體DNA控制區(qū)序列,旨在了解中國鯛科魚類的遺傳背景,為其種質(zhì)資源的有效保護和合理利用提供更多的參考依據(jù),結(jié)果如下:1.真鯛:1)總體表現(xiàn)為高單倍型多樣性和高核苷酸多樣性(Hd=0.996±0.001,π=0.022±0.0004),其中萊州群體遺傳多樣性(Hd=0.533±0.032,π=0.009±0.0043)明顯低于其余10個群體(Hd:0.989~1.000,π:0.020~0.023)。2)在鄰接樹上聚為3個分支,但沒有較明顯的地理結(jié)構(gòu);分支間分歧時間約為50.0~13.0萬年前(中更新世時期),可能是受到更新世冰期循環(huán)的影響。萊州群體與其余10個群體間存在高度分化(Fst值為0.240~0.399,P0.01);北部灣北海群體與除萊州群體外的東港、嶗山、韓國群體及大亞灣群體間存在低度分化(Fst值為0.058~0.110,P0.05),可能是由于瓊州海峽及雷州半島形成了一定程度的阻隔。真鯛整體及3個分支的中性檢驗、不配對分析和R2檢測均表明歷史上發(fā)生過種群擴張,擴張時間為30.3~7.8萬年前,推測是受到海平面變化時海侵的影響。3)廣東沿海真鯛產(chǎn)量相對較高,其中大亞灣是真鯛產(chǎn)卵場之一,且遺傳多樣性較高,建議優(yōu)先保護;渤海萊州群體遺傳多樣性遠遠低于其余群體,為避免種群不斷縮小最終滅絕,也需要加以保護。2.黑鯛:1)總體遺傳多樣性較真鯛低,表現(xiàn)出高單倍型多樣性低核苷酸多樣性(Hd=0.994±0.001,π=0.0074±0.0002)特征,其中營口群體遺傳多樣性(Hd=0.934±0.051,π=0.0050±0.0006)最低,大亞灣群體遺傳多樣性最高(Hd=0.986±0.013,π=0.0085±0.0005)。2)在鄰接樹上沒有明顯的譜系結(jié)構(gòu)和地理結(jié)構(gòu);黃渤海群體間,東海和南海群體間不存在明顯分化,但二者間有中低度分化(Fst值為0.040~0.213,P0.05),推測長江沖淡水對中國沿海黑鯛群體有重要影響。黑鯛總體中性檢驗、不配對分析和R2檢驗均表明整體未顯著偏離預(yù)期模型、核苷酸歧點分布圖呈現(xiàn)明顯單峰形狀,推測黑鯛群體于12.4~3.7萬年前(晚更新世時期)經(jīng)歷過種群快速擴張事件,可能與其生活習(xí)性和更新世冰期與間冰期的交替循環(huán)導(dǎo)致的海平面變化有關(guān)。3)大亞灣群體遺傳多樣性最高,建議優(yōu)先保護;渤海營口群體的遺傳多樣性最低,且位于分布區(qū)的最北端,也需重點保護。3.平鯛:1)總體遺傳多樣性與黑鯛相近,呈現(xiàn)出與黑鯛相同的高單倍型多樣性(0.993~1.000)低核苷酸多樣性(0.0063~0.0083)特征,其中博鰲群體遺傳多樣性(Hd=1.000±0.020,π=0.0063±0.0006)最低,惠來群體遺傳多樣性最高(Hd=1.000±0.011,π=0.0083±0.0009)。2)在NJ系統(tǒng)進化樹上,與黑鯛一樣沒有明顯地理結(jié)構(gòu)和譜系分支,且群體整體歷史擴張時間(12.21~3.66萬年前)與黑鯛相近,可能受到與黑鯛擴張相同的歷史地質(zhì)事件影響。博鰲群體與福州群體間存在一定程度的分化(Fst=0.031,P0.01),可能是受洋流和沿岸流的交互影響。3)東海福清群體和南;輥砣后w遺傳多樣性相對豐富,建議優(yōu)先保護。
【學(xué)位授予單位】:暨南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S917.4

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