黃顙魚性別差異基因的挖掘與驗證
發(fā)布時間:2020-04-10 15:52
【摘要】:魚類性別的決定和分化是由許多相關(guān)事件構(gòu)成的復(fù)雜的生物過程,在共同的遺傳物質(zhì)和生活環(huán)境下,魚類個體向相反的性別發(fā)育。黃顙魚是中國的小型經(jīng)濟魚類之一,其雄性比雌性生長快。在中國,黃顙魚是淡水經(jīng)濟魚類之一,具有較大的市場需求。本研究中,每天采樣觀察了3-60日齡人工養(yǎng)殖的黃顙魚Pelteobagrus fulvidraco性腺分化和發(fā)育的組織學(xué)。結(jié)果表明,在水溫(20±4)℃下,黃顙魚卵巢的分化明顯早于精巢,性腺的分化型為雌性異體型。孵出后14 d卵巢開始分化,原始性腺在橫切面出現(xiàn)組織突起,逐步形成卵巢腔;雄性分化始于孵出后54 d,主要標(biāo)志是形成輸精管原基,進而形成輸精管。利用Illumina對黃顙魚進行轉(zhuǎn)錄組測序,選取性腺發(fā)育的關(guān)鍵時期,孵出后3d隨機取3條未知性別的黃顙魚幼魚混樣(記為B)作為對照,選取卵巢分化關(guān)鍵時期孵化后14d和精巢分化關(guān)鍵時期孵化后54d,孵化90d可辨別雌雄黃顙魚。實時定量PCR驗證挖掘出性別基因變化的情況。將RNA-Seq測序所得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與基因組進行比對,結(jié)果表明在雌雄性腺總共表達(dá)從9個轉(zhuǎn)錄組中共獲得203,660,437 Raw reads,得到過濾后的Clean reads為191,297,677。質(zhì)量控制之后的reads進行FPKM計算,在得到所有基因的FPKM值中,尋找表達(dá)值具有較大差異的基因,結(jié)果顯示以B為分界點,在B之前的14、15、54、Y和55為雄性,其FPKM值相對雌性較低;在B以后為雌性,分別為13和53的。將未知性別的黃顙魚在轉(zhuǎn)錄水平中鑒別出來。與nr庫進行比對,結(jié)果顯示,在雌雄黃顙魚中找到5個與黃顙魚性別相關(guān)的差異表達(dá)基因,這些基因均為同一基因ZP3(卵透明樣精子結(jié)合蛋白3)。利用實時熒光定量PCR方法對轉(zhuǎn)錄組測序的結(jié)果進行驗證,對ZP3基因表達(dá)變化量的研究結(jié)果顯示,表達(dá)趨勢與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果相似。
【學(xué)位授予單位】:哈爾濱師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S917.4
本文編號:2622418
【學(xué)位授予單位】:哈爾濱師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S917.4
【參考文獻(xiàn)】
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1 楊興麗,周曉林,常東洲,葉新太,申秀英,穆慶華,楊慧,高艷云;池養(yǎng)與野生黃顙魚肌肉營養(yǎng)成分分析[J];水利漁業(yè);2004年05期
,本文編號:2622418
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