通過(guò)分析大豆細(xì)胞質(zhì)雄性不育系及其同型保持系盛花期花苞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),以期闡明大豆細(xì)胞質(zhì)雄性不育發(fā)生機(jī)制,為大豆細(xì)胞質(zhì)雄性不育在不育化制種中的利用提供理論依據(jù)。以細(xì)胞質(zhì)雄性不育系JLCMS116A及其同型保持系JLCMS116B為材料,對(duì)兩種材料盛花期花苞進(jìn)行碳水化合物、可溶性蛋白、內(nèi)源激素和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序進(jìn)行分析研究。所有材料的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)共產(chǎn)生40.53Gb的序列數(shù)據(jù),共得到1866個(gè)基因,在不育系和保持系之間共篩選出229個(gè)差異基因。1.GO注釋分析顯示229個(gè)差異基因中的157個(gè)(68.6%)被注釋到42個(gè)功能分類中,包括19個(gè)生物學(xué)分類(BP)、12個(gè)細(xì)胞組分分類(CC)和11個(gè)分子功能分類(MF)。2.KEGG富集顯示,不育系和保持系間的DEGs顯著富集的通路有戊糖和葡萄糖醛酸的相互轉(zhuǎn)化通路(ko00040)、淀粉和蔗糖代謝(ko00500)、植物病原互作(ko04626)、鞘脂代謝(ko00600)和醚脂代謝(ko00565),其中戊糖和葡萄糖醛酸的相互轉(zhuǎn)化通路(ko00040)、淀粉和蔗糖代謝(ko00500)、鞘脂代謝(ko00600)和醚脂代謝(ko00565)與育性有關(guān)。3...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１轉(zhuǎn)錄組測(cè)序流程圖??Ｆｉｇｕｒｅ?１?ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ??２．４轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控與ｒｅｓｄｓ比對(duì)及功能富集分析??

１０?大豆細(xì)胞質(zhì)雄性不育系ＪＬＣＭＳ１１６Ａ及其保持系ＪＬＣＭＳ１１６Ｂ的轉(zhuǎn)錄組分析???一??ｉ??圖１轉(zhuǎn)錄組測(cè)序流程圖??Ｆｉｇｕｒｅ?１?ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ??２．４轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控與ｒｅｓｄｓ比對(duì)及功能富集分析?....

圖２?ＦＰＫＭ密度分布對(duì)比圖??Ｆｉｇｕｒｅ２?ＦＰＫＭ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｓ?ｏｆ?ａｌｌ?ｓａｍｐｌｅｓ??

據(jù)和所占據(jù)的比??值；（６）?Ｒｅａｄｓ?Ｍａｐ?ｔｏ?Ｖ：反映到供參基因組上面＋鏈位置的數(shù)據(jù)和所占據(jù)的比值；（７）?Ｒｅａｄｓ?Ｍａｐ?ｔｏ??反映到供參基因組上面－鏈位置的數(shù)據(jù)和所占據(jù)的比值。??３．４．２樣品基因表達(dá)量總體分布??利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)檢測(cè)基因表達(dá)具有較高的靈敏度，....

圖３?ＦＰＫＭ箱線圖??ＦｉｇｕｒｅＢ?ＦＰＫＭ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?ａｌｌ?ｇｒｏｕｐｓ??注：圖中橫坐標(biāo)代表不同的樣品；縱坐標(biāo)表示樣品表達(dá)量ＦＰＫＭ的對(duì)數(shù)值

?白?Ｃ－１１６Ａ－５??＆?＿?Ｃ－１１６Ａ－６??三?ＩＩ?串?Ｃ－１１６Ｂ－４??蒼－２－?Ｉ?＾?Ｃ－１?１６Ｂ－５??｜?ｉ?Ｉ?｜?Ｉ?Ｌ￣￣?ｉ?０－１?１６Ｂ－６??丨?５??參霉?■黧?參攀??．?？?？?＿?？?？??ｍ??？?？?：??－６?—?？?？???....

圖５差異表達(dá)火山圖??Ｆｉｇｕｒｅ５?Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ?ｏｆ?ＤＥＧｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ?ｃｏｍｐａｒｅｄ?ｇｒｏｕｐｓ??

ｅｎ?ｔｗｏ?ｓａｍｐｌｅｓ??３．４．４差異表達(dá)基因統(tǒng)計(jì)??火山圖也可直觀的表達(dá)組間的ＤＥＧｓ情況。這些基因的差異表達(dá)可能是導(dǎo)致??兩個(gè)材料出現(xiàn)育性差異的原因，因此后續(xù)需對(duì)這些ＤＥＧｓ進(jìn)行了更深入的分析。???Ｖｏｌｃａｎｏ?ｐｌｏｔ???２０?－??１５?－??ｆｐ?Ｓｉｇｎ....

本文編號(hào)：3961657