半枝蓮Scutella barbata 和夏枯草Prunella vulgaris屬于唇形科植物。半枝蓮是一種重要的藥用植物,廣泛應(yīng)用于中國、韓國、印度等亞洲國家。新克羅烷型二萜類化合物是半枝蓮中主要的活性成分,對多種癌細胞具有良好的細胞毒性。夏枯草是唇形科分布最廣泛的物種,是一種常用的中藥材及草藥制劑。三萜類化合物是夏枯草的主要活性成分。本論文通過對半枝蓮和夏枯草不同組織進行Illumina測序及分析,系統(tǒng)克隆萜類化合物生物合成途徑中的基因,并對部分二萜合酶基因進行了功能鑒定,為唇形科植物萜類化合物多樣性的產(chǎn)生機制以及特定萜類化合物的生物合成途徑研究奠定了基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1、首先對半枝蓮和夏枯草的不同組織進行轉(zhuǎn)錄組測序及組裝。提取半枝蓮的根(BZLR)、莖葉(BZLS)、花(BZLF)三個組織的RNA;夏枯草的根(XKCR)、莖葉(XKCS)、花穗(XKCF)以及未成熟的種子(XKCZ)四個組織的RNA。每個組織分別進行兩次重復(fù)。將半枝蓮中121,958,564條clean RNA-sequence reads 組裝成 88,980 個轉(zhuǎn)錄本,共計 52,211 個 unig...

【文章頁數(shù)】：78 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－３．半枝蓮主要的具有藥用活性的二萜類化合物

和灌木［３８］�！吨袊幍洹罚郏常梗菔珍浟税胫ι彛椋樱悖鳎妫澹冢幔颍妫�?和黃岑５１．?Ａａ／ｃａ／ｅｒａｈ??兩種植物，并從該屬植物中分離出１５０多種新克羅烷型二萜。這些新克羅烷型二萜??類化合物對多種癌細胞系具有明顯的細胞毒性［４０－４４］。Ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ａ?（圖１....

圖１－４．夏枯草植物及其代表性蔽類化合物

?ＳｃｕｔｅｂａｒｂａｔｉｎＥ?ＳｃｕｔｅｂａｒｂａｔｉｎＦ??圖１－３．半枝蓮主要的具有藥用活性的二萜類化合物。Ａ：典型的新克羅烷型二萜類化合物??ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ａ，?ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ｂ，ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ｃ?和?ｓｃｕｔｅｂａｔｉｎ?Ｄ。Ｂ：新克羅院型二￥５....

圖３－１．半枝蓮、夏枯草植株及總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳圖??Ｆｉｇｕｒｅ?３－１．?Ｔｈｅ?ｐｌａｎｔ?ａｎｄ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ?ｏｆ?Ｓ．?ｂａｒｂａｔａ?ａｎｄ?Ｐ．?ｖｕｌｇａｒｉｓ??

圖３－１．半枝蓮、夏枯草植株及總ＲＮＡ瓊脂糖凝膠電泳圖??Ｆｉｇｕｒｅ?３－１．?Ｔｈｅ?ｐｌａｎｔ?ａｎｄ?ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ?ｏｆ?Ｓ．?ｂａｒｂａｔａ?ａｎｄ?Ｐ．?ｖｕｌｇａｒｉｓ??總ＲＮＡ進行瓊脂糖凝膠電泳檢測可見除個別樣品外，總ＲＮＡ基本完整（圖??３－１．Ｃ）。隨....

圖３－３．半枝蓮（Ａ）和夏枯草（Ｂ）的ＧＯ注釋結(jié)果??Ｆｉｕｒｅ３－３．?Ｓｕｍｍａｒｏｆ?Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏａｎｎｏｔａｔｉｏｎ?ｆｏｒ?ａｌｌ?ＵｎｉＧｅｎｅｓ??

??３３３２３個ｕｎｉｇｅｎｅｓ?（５４．４７％）至少在其中的某一個數(shù)據(jù)庫中得到了注釋（圖３－２Ｂ，??３－３Ｂ）?〇??表３－３．夏枯草組裝ｄｅ?ｎｏｖｏ組裝結(jié)果??Ｔａｂｌｅ?３－３．?Ｓｔａｔｓ?ｆｏｒ?ａｌｌ?ｄｅ?ｎｏｖｏ?ａｓｓｅｍｂｌｅｄ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔ?ｃｏ....

本文編號：3959332