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陸海漸滲系纖維長(zhǎng)度QTL(qFL-12-2)精細(xì)定位與候選基因鑒定

發(fā)布時(shí)間:2024-03-12 00:26
  棉花是重要的經(jīng)濟(jì)作物,棉纖維是最大的天然纖維來源,重要的紡織工業(yè)原料,F(xiàn)代紡織工業(yè)的迅猛發(fā)展,對(duì)纖維品質(zhì)的要求越來越高,使棉花育種的重點(diǎn)由單純提高產(chǎn)量向產(chǎn)量與品質(zhì)同步提高發(fā)展。棉纖維長(zhǎng)度是衡量纖維品質(zhì)的重要指標(biāo),提高棉纖維長(zhǎng)度已成為棉花育種的重要目標(biāo)。在綜合評(píng)價(jià)課題組前期構(gòu)建的以海1為供體親本,中棉所45為輪回親本構(gòu)建的332個(gè)陸海漸滲系群體基礎(chǔ)上,選取纖維品質(zhì)性狀突出、產(chǎn)量性狀與輪回親本接近的漸滲系MBI7747與中棉所45進(jìn)一步構(gòu)建F2群體,然后隨機(jī)分別挑選一定數(shù)量的單株種植于兩個(gè)環(huán)境。以覆蓋棉花全基因組的2292個(gè)SSR標(biāo)記在親本間進(jìn)行多態(tài)性篩查,然后以其中的多態(tài)性標(biāo)記對(duì)F2群體進(jìn)行遺傳檢測(cè);結(jié)合表型檢測(cè)結(jié)果,利用Icimapping軟件挖掘MBI7747中的與纖維主要產(chǎn)量和品質(zhì)性狀相關(guān)的QTL位點(diǎn),在三個(gè)環(huán)境中共挖掘到與纖維產(chǎn)量與品質(zhì)相關(guān)QTL共23個(gè):1、與纖維產(chǎn)量相關(guān)的QTL有5個(gè),包括衣分相關(guān)的4個(gè),貢獻(xiàn)率為6.95-28.86%;鈴重有關(guān)的1個(gè),貢獻(xiàn)率為14.65%。2、與纖維品質(zhì)相關(guān)的QTL共18個(gè),包括纖維長(zhǎng)度相關(guān)的6個(gè),貢獻(xiàn)率為2.05%-20.99%;纖維整齊度...

【文章頁(yè)數(shù)】:123 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

圖2-1棉花染色體片段代換系的培育方案??Fig.2.1?The?cultivating?program?of?the?CSSLs??2.1.4基因組DNA提取??

圖2-1棉花染色體片段代換系的培育方案??Fig.2.1?The?cultivating?program?of?the?CSSLs??2.1.4基因組DNA提取??

實(shí)驗(yàn)的親本材料為優(yōu)質(zhì)漸滲系MBI7747和中棉所45?(表2-1)。MBI7747??是以陸地棉中棉所45為受體和海島棉海1為供體構(gòu)建的由332個(gè)染色體片??段漸滲系組成的群體(BC4F3:5)中選取的一個(gè)纖維品質(zhì)優(yōu)異漸滲系(圖2.1)。??中棉所45抗蟲性強(qiáng),產(chǎn)量高,纖維品質(zhì)性....


圖4-1生物信息分析流程圖??Fig?4-1?The?flow?chart?of?bioinformatics?analysis??4.1.4.2差異表達(dá)基因分析??[184]

圖4-1生物信息分析流程圖??Fig?4-1?The?flow?chart?of?bioinformatics?analysis??4.1.4.2差異表達(dá)基因分析??[184]

4.1.4生物信息學(xué)分析??研宄用的實(shí)驗(yàn)材料主要為陸地棉及陸地棉背景下的海陸漸滲系材料,故本研??宄后續(xù)分析以陸地棉基因組為參考基因組[157]。整個(gè)分析思路及流程見圖4-1。??4.1.4.1數(shù)據(jù)過濾與處理??利用Hiseq2000?v4測(cè)序平臺(tái)完成樣品的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,測(cè)序模式為....


圖4,3不同祥本間主成分分析

圖4,3不同祥本間主成分分析

Fig?4-3?The?principal?component?analysis?among?different?samples??結(jié)果顯示,在取樣的的6個(gè)時(shí)間點(diǎn)(7DPA、10DPA、15DPA、20DPA、25DPA),??2優(yōu)質(zhì)漸滲系MBI7747與MBI7561更多的聚合....


圖4-5纖維伸長(zhǎng)期4個(gè)階段差異基因交集

圖4-5纖維伸長(zhǎng)期4個(gè)階段差異基因交集

XLOC_025348與XLOC_026944,全為?LncRNA,這?2?個(gè)?LncRN還需要進(jìn)一步的研宄。另外,還可以看出,在纖維伸長(zhǎng)期的各階特有的差異基因的數(shù)量明顯高于與其它階段共有的差異基因,這纖維伸長(zhǎng)的調(diào)控是個(gè)動(dòng)態(tài)變化的過程。??1QDPA?15DPA??^^""""^....



本文編號(hào):3926254

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