陸海漸滲系纖維長(zhǎng)度QTL(qFL-12-2)精細(xì)定位與候選基因鑒定
【文章頁(yè)數(shù)】:123 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
圖2-1棉花染色體片段代換系的培育方案??Fig.2.1?The?cultivating?program?of?the?CSSLs??2.1.4基因組DNA提取??
實(shí)驗(yàn)的親本材料為優(yōu)質(zhì)漸滲系MBI7747和中棉所45?(表2-1)。MBI7747??是以陸地棉中棉所45為受體和海島棉海1為供體構(gòu)建的由332個(gè)染色體片??段漸滲系組成的群體(BC4F3:5)中選取的一個(gè)纖維品質(zhì)優(yōu)異漸滲系(圖2.1)。??中棉所45抗蟲性強(qiáng),產(chǎn)量高,纖維品質(zhì)性....
圖4-1生物信息分析流程圖??Fig?4-1?The?flow?chart?of?bioinformatics?analysis??4.1.4.2差異表達(dá)基因分析??[184]
4.1.4生物信息學(xué)分析??研宄用的實(shí)驗(yàn)材料主要為陸地棉及陸地棉背景下的海陸漸滲系材料,故本研??宄后續(xù)分析以陸地棉基因組為參考基因組[157]。整個(gè)分析思路及流程見圖4-1。??4.1.4.1數(shù)據(jù)過濾與處理??利用Hiseq2000?v4測(cè)序平臺(tái)完成樣品的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,測(cè)序模式為....
圖4,3不同祥本間主成分分析
Fig?4-3?The?principal?component?analysis?among?different?samples??結(jié)果顯示,在取樣的的6個(gè)時(shí)間點(diǎn)(7DPA、10DPA、15DPA、20DPA、25DPA),??2優(yōu)質(zhì)漸滲系MBI7747與MBI7561更多的聚合....
圖4-5纖維伸長(zhǎng)期4個(gè)階段差異基因交集
XLOC_025348與XLOC_026944,全為?LncRNA,這?2?個(gè)?LncRN還需要進(jìn)一步的研宄。另外,還可以看出,在纖維伸長(zhǎng)期的各階特有的差異基因的數(shù)量明顯高于與其它階段共有的差異基因,這纖維伸長(zhǎng)的調(diào)控是個(gè)動(dòng)態(tài)變化的過程。??1QDPA?15DPA??^^""""^....
本文編號(hào):3926254
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