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大豆基質(zhì)金屬蛋白酶基因Gm1-MMP和Gm2-MMP的分離以及響應(yīng)高溫高濕脅迫的功能分析

發(fā)布時間:2024-02-23 22:43
  基質(zhì)金屬蛋白酶(Matrix metalloproteinases,MMPs)是一類高度保守的鋅鈣依賴型的內(nèi)肽酶家族。在植物生長發(fā)育以及應(yīng)答生物和非生物脅迫過程中具有重要的作用。大豆[Glycine max(L.)Merr.]是世界上重要的油料作物,在我國種植業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整中發(fā)揮重要作用。我國南方春大豆種子生理成熟期往往會遇到高溫多雨的夏季,導(dǎo)致種子發(fā)生田間劣變,嚴(yán)重影響了春大豆的產(chǎn)量和品質(zhì)。本課題組前期的差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究結(jié)果表明高溫高濕(40℃/100%RH)脅迫后Gm1-MMP蛋白在抗田間劣變品種中與對照相比顯著上調(diào)表達(dá),表明Gm1-MMP可能響應(yīng)高溫高濕脅迫從而參與春大豆種子田間劣變抗性。為進(jìn)一步研究大豆MMPs在響應(yīng)高溫高濕脅迫中的功能,本研究擬選用Gm1-MMP和Gm2-MMP兩個基因作為研究對象,以種子田間劣變抗性品種湘豆3號和不抗品種寧鎮(zhèn)1號為材料,在此基礎(chǔ)上開展以下研究:(1)大豆Gm1-MMP和Gm2-MMP的分離、生物信息學(xué)分析及其編碼蛋白的亞細(xì)胞定位;(2)Gm1-MMP和Gm2-MMP基因在不同組織器官、種子發(fā)育過程以及高溫高濕(40℃/100%RH)脅迫下的表達(dá)...

【文章頁數(shù)】:157 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1-2哺乳動物中MMP-1催化區(qū)結(jié)構(gòu)示意圖(Borkakoti,2000)??Fig.?1-2?The?catalytic?domain?of?MMP-1?in?mammal?(Borkakoti,?2000)??另外,與大多數(shù)哺乳動物中的MMPs不同的是,目前在高等植物中發(fā)現(xiàn)的所有??

圖1-2哺乳動物中MMP-1催化區(qū)結(jié)構(gòu)示意圖(Borkakoti,2000)??Fig.?1-2?The?catalytic?domain?of?MMP-1?in?mammal?(Borkakoti,?2000)??另外,與大多數(shù)哺乳動物中的MMPs不同的是,目前在高等植物中發(fā)現(xiàn)的所有??

類血紅素結(jié)合蛋白區(qū)(Cauwe和Opdenakker,2010)。有時,MMPs在C末端還含介??跨膜結(jié)構(gòu)域或GPI錨定位點(diǎn)。大多數(shù)動物MMPs保守結(jié)構(gòu)域中含有類血紅素結(jié)合蛋白??區(qū),而植物MMPs沒有這一結(jié)構(gòu),詳見圖1-1。??〇-[?1?a)?general?domain?s....


圖1-3技術(shù)路線??Fig.?1-3?Technology?roadmap??

圖1-3技術(shù)路線??Fig.?1-3?Technology?roadmap??

?大豆基質(zhì)金屬蛋白酶基因Gw/-MMP和Gm2-MMP的分離以及響應(yīng)高溫高濕脅迫的功能分析???


圖2-1大豆葉片RNA及Jc//7?檢測結(jié)果??M:?DL2000Marker;?h?寧鎮(zhèn)?1?號;2.?湘豆?3?號??

圖2-1大豆葉片RNA及Jc//7?檢測結(jié)果??M:?DL2000Marker;?h?寧鎮(zhèn)?1?號;2.?湘豆?3?號??

2.2大豆總DNA的提取??采用CTAB法對大豆第一葉期的基因組DNA進(jìn)行提取,經(jīng)1.5?%瓊脂糖凝膠電泳??檢測,結(jié)果顯示(圖2-2):?DNA降解很少,表明所提DNA具有較好的質(zhì)量。??DNA??M?1?2??500?bp???250?bp??_議議國??100bp?—?p』....


圖2-3?基因的cDNA和DNA擴(kuò)增結(jié)果??M:?DL2000Marker;?1:寧鎮(zhèn)?1?號;2:湘豆?3?號??

圖2-3?基因的cDNA和DNA擴(kuò)增結(jié)果??M:?DL2000Marker;?1:寧鎮(zhèn)?1?號;2:湘豆?3?號??

以NCBI公布的Gw2-MMP?CDS序列為模板,使用Primer?Premier?5.0軟件設(shè)計的??引物分別對寧鎮(zhèn)1號及湘豆3號的cDNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,經(jīng)1.5?%瓊脂糖凝膠電泳檢??測,在1163?bp位置有淸楚的特異性條帶(圖2-4),與預(yù)期大小一致。把擴(kuò)增的產(chǎn)物回??....



本文編號:3908099

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