花椒(Zanthoxylum bungeanum Maxim)為蕓香科花椒屬植物,有較高的藥用、食用和生態(tài)價(jià)值;花椒在我國(guó)栽培歷史悠久,品種資源繁多,且栽培范圍廣泛,但由于在引種栽培過程中,同名異種、同種異名的現(xiàn)象比較嚴(yán)重,不利于花椒種質(zhì)資源的鑒定、引種工作。本文以12個(gè)有地域代表的花椒種質(zhì)為試驗(yàn)材料,開展了花椒EST-SSR功能性標(biāo)記的開發(fā),并對(duì)12份花椒種質(zhì)資源進(jìn)行了鑒定,豐富花椒在分子標(biāo)記方面類型,為花椒種質(zhì)資源鑒定提供依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.采用生物信息學(xué)分析軟件MISA對(duì)前期測(cè)序獲得的45057條Unigene序列進(jìn)行了SSR位點(diǎn)數(shù)據(jù)挖掘,發(fā)現(xiàn)在全部的非冗余序列中有3315條序列包含SSR位點(diǎn),共3814個(gè),SSR位點(diǎn)在全部序列中的出現(xiàn)頻率為8.46%,平均分布距離約7.2kb;在檢索出的SSR位點(diǎn)中,三核苷酸是主導(dǎo)重復(fù)類型,且三核苷酸重復(fù)基元中以GAA/CTT、AGA/TCT重復(fù)基元出現(xiàn)頻率最高;在檢索出的不同SSR位點(diǎn)類型中,所有重復(fù)基元的重復(fù)次數(shù)范圍在4-12次。其中二核苷酸重復(fù)次數(shù)范圍6-12次、為最大,六核苷酸重復(fù)次數(shù)范圍只有4次、為最小。隨著重復(fù)基元重復(fù)次數(shù)的...

【文章頁數(shù)】：48 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-1花椒與其他樹種SSR平均分布距離對(duì)比

采用CTAB法能提取到純度較高、濃度較大的DNA。所提DNA符合標(biāo)準(zhǔn)，以用于后續(xù)試驗(yàn)(張大偉等2014)。.3.2花椒cDNA序列SSR位點(diǎn)分布特征.3.2.1花椒EST-SSR頻率和密度通過對(duì)蔣弘剛(2014)在鳳縣大紅袍花椒皮刺分化轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及數(shù)據(jù)....

圖2-2花椒EST-SSR重復(fù)基元及SSR位點(diǎn)分布特征

圖2-2花椒EST-SSR重復(fù)基元及SSR位點(diǎn)分布特征Fig.2-2distributioncharacteristicsofEST-SSRrepeatsandSSRlociinZanthoxylumbungeanum注：a為核苷酸重復(fù)類....

圖3-3引物FX-27對(duì)12份花椒種質(zhì)的擴(kuò)增結(jié)果

引物FX-27在頂壇花椒、鳳縣大紅袍上均表現(xiàn)出特征譜帶，在特征譜面與其他引物相比都較為豐富，在對(duì)花椒利用指紋圖譜法進(jìn)行種質(zhì)鑒3-3）。利用引物組合法對(duì)花椒種質(zhì)進(jìn)行鑒別時(shí)，選擇FX-15、FX-27-60、FX-40和FX-15兩組引物進(jìn)行組合可以將12份花椒種質(zhì)....

本文編號(hào)：3891044