目的探討艾草可燃性特征的轉錄組學基礎。方法采摘新鮮艾草后分別提取葉、根、莖組織的總RNA并建立3個組織的cDNA文庫,進行高通量測序。對測序后的原始讀段進行過濾得到高質量讀段,使用Trinity軟件對高質量讀段進行de novo組裝得到功能基因,再對功能基因進行京都基因和基因組百科全書(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)注釋和表達量的計算。結果艾草高通量測序獲得99 807個功能基因,與KEGG數據庫比對后得到萜類和纖維素合成的代謝通路,發(fā)現參與萜類物質合成的相關基因有116個,編碼16種關鍵酶;參與纖維素合成相關基因有119個,編碼5種關鍵酶。在萜類物質合成的關鍵酶基因中,葉、根、莖組織中都僅存在1個MVD基因和2個CMS基因,并且這3種關鍵酶基因均在葉中的表達水平最高。結論艾草中存在許多參與萜類和纖維素合成的關鍵酶基因,但其最關鍵的限速酶在艾葉中的表達量比根、莖高,這可能是艾葉作為灸材的關鍵因素之一。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 植物材料與cDNA文庫的制備
    1.2 轉錄組測序與數據組裝
    1.3 功能基因的KEGG注釋與表達量計算
2 結果
    2.1 轉錄組測序結果
    2.2 代謝途徑分析
        2.2.1 單萜類與倍半萜類生物合成相關基因的鑒定與分析
        2.2.2 纖維素合成途徑分析
3 討論



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