目的探討艾草可燃性特征的轉(zhuǎn)錄組學(xué)基礎(chǔ)。方法采摘新鮮艾草后分別提取葉、根、莖組織的總RNA并建立3個(gè)組織的cDNA文庫(kù),進(jìn)行高通量測(cè)序。對(duì)測(cè)序后的原始讀段進(jìn)行過(guò)濾得到高質(zhì)量讀段,使用Trinity軟件對(duì)高質(zhì)量讀段進(jìn)行de novo組裝得到功能基因,再對(duì)功能基因進(jìn)行京都基因和基因組百科全書(shū)(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)注釋和表達(dá)量的計(jì)算。結(jié)果艾草高通量測(cè)序獲得99 807個(gè)功能基因,與KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)后得到萜類(lèi)和纖維素合成的代謝通路,發(fā)現(xiàn)參與萜類(lèi)物質(zhì)合成的相關(guān)基因有116個(gè),編碼16種關(guān)鍵酶;參與纖維素合成相關(guān)基因有119個(gè),編碼5種關(guān)鍵酶。在萜類(lèi)物質(zhì)合成的關(guān)鍵酶基因中,葉、根、莖組織中都僅存在1個(gè)MVD基因和2個(gè)CMS基因,并且這3種關(guān)鍵酶基因均在葉中的表達(dá)水平最高。結(jié)論艾草中存在許多參與萜類(lèi)和纖維素合成的關(guān)鍵酶基因,但其最關(guān)鍵的限速酶在艾葉中的表達(dá)量比根、莖高,這可能是艾葉作為灸材的關(guān)鍵因素之一。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 植物材料與cDNA文庫(kù)的制備
    1.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與數(shù)據(jù)組裝
    1.3 功能基因的KEGG注釋與表達(dá)量計(jì)算
2 結(jié)果
    2.1 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果
    2.2 代謝途徑分析
        2.2.1 單萜類(lèi)與倍半萜類(lèi)生物合成相關(guān)基因的鑒定與分析
        2.2.2 纖維素合成途徑分析
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