谷子PEPC基因的鑒定及其對非生物逆境的響應(yīng)特性
發(fā)布時(shí)間:2023-06-06 19:56
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvatecarboxylase,PEPC)是C4植物光合作用關(guān)鍵酶,并在植物多種代謝途徑及逆境信號應(yīng)答過程中起重要作用。本研究通過序列比對,從谷子基因組中篩選出6個(gè)SiPEPC候選基因。SiPEPC蛋白特征參數(shù)相似度很高,序列非常保守,都含有PEPC基因特征功能域PEPcase Motif。SiPEPC成員主要被定位在細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核和線粒體。在SiPEPC成員啟動(dòng)子序列中含大量有光、激素、逆境以及其他生長調(diào)控相關(guān)的順式應(yīng)答元件。苗期逆境qRT-PCR表達(dá)譜分析表明,5個(gè)SiPEPC基因(SiPEPC1、SiPEPC2、SiPEPC3、SiPEPC5、SiPEPC6)不同程度受ABA、PEG、高鹽和低溫誘導(dǎo)表達(dá),表明其參與了苗期對非生物逆境的響應(yīng)。5個(gè)SiPEPC基因表達(dá)量在正常生長條件下隨著谷子的生長呈增強(qiáng)趨勢,且在不同生育時(shí)期干旱脅迫下明顯增加,表明其參與了拔節(jié)、抽穗、灌漿期的干旱脅迫應(yīng)答。拔節(jié)期弱光可誘導(dǎo)5個(gè)SiPEPC基因的表達(dá),而在拔節(jié)期中等強(qiáng)度光照以及抽穗期和灌漿期的中等光照和弱光照下表達(dá)量均急劇降低,揭示光照強(qiáng)度嚴(yán)重影響...
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
1.3 谷子PEPC基因的鑒定及基因結(jié)構(gòu)、蛋白序列分析
1.4 總RNA提取、cDNA合成及引物設(shè)計(jì)
1.5 Real-time PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 谷子PEPC基因成員鑒定與參數(shù)分析
2.2 SiPEPC蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測和啟動(dòng)子區(qū)域順式元件分析
2.3 PEPC序列比對及進(jìn)化分析
2.4 SiPEPC家族基因苗期非生物逆境脅迫下表達(dá)分析
2.5 不同生育期干旱脅迫及不同光照強(qiáng)度下表達(dá)分析
3 討論
4 結(jié)論
本文編號:3832120
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
1.3 谷子PEPC基因的鑒定及基因結(jié)構(gòu)、蛋白序列分析
1.4 總RNA提取、cDNA合成及引物設(shè)計(jì)
1.5 Real-time PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 谷子PEPC基因成員鑒定與參數(shù)分析
2.2 SiPEPC蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測和啟動(dòng)子區(qū)域順式元件分析
2.3 PEPC序列比對及進(jìn)化分析
2.4 SiPEPC家族基因苗期非生物逆境脅迫下表達(dá)分析
2.5 不同生育期干旱脅迫及不同光照強(qiáng)度下表達(dá)分析
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