谷子PEPC基因的鑒定及其對非生物逆境的響應特性
發(fā)布時間:2023-06-06 19:56
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvatecarboxylase,PEPC)是C4植物光合作用關鍵酶,并在植物多種代謝途徑及逆境信號應答過程中起重要作用。本研究通過序列比對,從谷子基因組中篩選出6個SiPEPC候選基因。SiPEPC蛋白特征參數(shù)相似度很高,序列非常保守,都含有PEPC基因特征功能域PEPcase Motif。SiPEPC成員主要被定位在細胞質(zhì)、細胞核和線粒體。在SiPEPC成員啟動子序列中含大量有光、激素、逆境以及其他生長調(diào)控相關的順式應答元件。苗期逆境qRT-PCR表達譜分析表明,5個SiPEPC基因(SiPEPC1、SiPEPC2、SiPEPC3、SiPEPC5、SiPEPC6)不同程度受ABA、PEG、高鹽和低溫誘導表達,表明其參與了苗期對非生物逆境的響應。5個SiPEPC基因表達量在正常生長條件下隨著谷子的生長呈增強趨勢,且在不同生育時期干旱脅迫下明顯增加,表明其參與了拔節(jié)、抽穗、灌漿期的干旱脅迫應答。拔節(jié)期弱光可誘導5個SiPEPC基因的表達,而在拔節(jié)期中等強度光照以及抽穗期和灌漿期的中等光照和弱光照下表達量均急劇降低,揭示光照強度嚴重影響...
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗設計
1.3 谷子PEPC基因的鑒定及基因結(jié)構(gòu)、蛋白序列分析
1.4 總RNA提取、cDNA合成及引物設計
1.5 Real-time PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 谷子PEPC基因成員鑒定與參數(shù)分析
2.2 SiPEPC蛋白亞細胞定位預測和啟動子區(qū)域順式元件分析
2.3 PEPC序列比對及進化分析
2.4 SiPEPC家族基因苗期非生物逆境脅迫下表達分析
2.5 不同生育期干旱脅迫及不同光照強度下表達分析
3 討論
4 結(jié)論
本文編號:3832120
【文章頁數(shù)】:12 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗設計
1.3 谷子PEPC基因的鑒定及基因結(jié)構(gòu)、蛋白序列分析
1.4 總RNA提取、cDNA合成及引物設計
1.5 Real-time PCR分析
2 結(jié)果與分析
2.1 谷子PEPC基因成員鑒定與參數(shù)分析
2.2 SiPEPC蛋白亞細胞定位預測和啟動子區(qū)域順式元件分析
2.3 PEPC序列比對及進化分析
2.4 SiPEPC家族基因苗期非生物逆境脅迫下表達分析
2.5 不同生育期干旱脅迫及不同光照強度下表達分析
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