【目的】鑒定谷子TCP轉(zhuǎn)錄因子家族成員,并進(jìn)行生物信息學(xué)及組織表達(dá)特性分析,為探究谷子TCP轉(zhuǎn)錄因子在植物生長(zhǎng)發(fā)育、激素信號(hào)途徑和生物脅迫中的生物學(xué)功能提供理論依據(jù)�！痉椒ā客ㄟ^(guò)HMMER構(gòu)建隱馬爾可夫模型,在谷子蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索含有TCP特征性結(jié)構(gòu)域的TCP蛋白,對(duì)其理化性質(zhì)、保守基序和系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化進(jìn)行分析,并對(duì)其基因結(jié)構(gòu)、啟動(dòng)子順式作用元件及組織表達(dá)特性進(jìn)行分析。【結(jié)果】從谷子蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)中共鑒定出23個(gè)TCP轉(zhuǎn)錄因子(編號(hào)SiTCP1～SiTCP23),氨基酸數(shù)量為95～451個(gè),分子量為9743.9～46502.6 Da,理論等電點(diǎn)(pI)為4.2682～11.8710,其編碼基因在9條染色體上呈不均勻方式分布。23個(gè)谷子TCP蛋白被分為3個(gè)亞族,其中Group Ⅰ和Group Ⅲ中各有10個(gè)TCP蛋白,Group Ⅱ有3個(gè)TCP蛋白。谷子TCP蛋白保守基序的組成存在一定差異,但親緣關(guān)系較近的蛋白具有相同的保守基序,部分谷子TCP蛋白含有特殊的基序;除SiTCP5、SiTCP20、SiTCP18和SiTCP22外,其余TCP蛋白均含有保守Motif 1和Motif 2。除SiTC...

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 谷子TCP轉(zhuǎn)錄因子家族成員鑒定
    1.3 谷子TCP基因染色體定位及基因結(jié)構(gòu)分析
    1.4 谷子TCP蛋白保守基序分析
    1.5 谷子TCP蛋白系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析
    1.6 谷子TCP基因組織表達(dá)特性分析
    1.7 谷子TCP基因啟動(dòng)子順式作用元件分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 谷子TCP轉(zhuǎn)錄因子家族成員鑒定與染色體定位分析結(jié)果
    2.2 谷子TCP轉(zhuǎn)錄因子的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化分析結(jié)果
    2.3 谷子TCP蛋白保守基序分析結(jié)果
    2.4 谷子TCP基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
    2.5 谷子TCP基因啟動(dòng)子順式作用元件分析結(jié)果
    2.6 谷子TCP基因的組織特異性表達(dá)分析結(jié)果
3 討論
4 結(jié)論



本文編號(hào)：3814861