氮素是小麥生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中重要的營(yíng)養(yǎng)元素,利用轉(zhuǎn)錄組技術(shù)鑒定參與小麥低氮脅迫分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的基因,對(duì)揭示小麥耐低氮分子機(jī)理、開(kāi)展耐低氮育種具有重要參考意義。采用Illumina Hiseq^TM 2500高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)小麥品種晉麥47正常生長(zhǎng)和低氮脅迫下的葉片進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選差異表達(dá)基因并在GO、KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行比對(duì)注釋,分析小麥低氮脅迫響應(yīng)相關(guān)基因。結(jié)果顯示,對(duì)照組與低氮組分別獲得高質(zhì)量序列52 383 726和52 192 061條,檢測(cè)到差異表達(dá)基因1 267個(gè),其中上調(diào)表達(dá)基因179個(gè),下調(diào)表達(dá)基因1 088個(gè)。差異基因GO功能注釋到3個(gè)大類的44個(gè)功能組。差異表達(dá)基因被注釋到178個(gè)途徑上,主要富集于氨基酸代謝、碳水化合物代謝、脂類代謝和信號(hào)傳導(dǎo)等途徑。轉(zhuǎn)錄因子分析發(fā)現(xiàn),在低氮條件下變化明顯的轉(zhuǎn)錄因子家族包括WRKY、MYB和NAC等。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料培養(yǎng)及處理
    1.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
    1.3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的組裝
    1.4 差異表達(dá)基因分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 測(cè)序數(shù)據(jù)分析
    2.2 轉(zhuǎn)錄組NR庫(kù)注釋
    2.3 轉(zhuǎn)錄組COG注釋
    2.4 低氮脅迫下差異表達(dá)基因的篩選
    2.5 葉片差異表達(dá)基因GO富集分析
    2.6 葉片差異表達(dá)基因KEGG通路顯著性富集分析
    2.7 轉(zhuǎn)錄因子
    2.8 差異表達(dá)基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析
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