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玉米秸稈消化率全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2023-04-16 18:06
  48h體外干物質(zhì)消化率(48h in vitro dry matter digestibility, 48h IVDMD)是衡量青貯玉米品質(zhì)的重要指標。為了初步探究玉米秸稈消化率的分子遺傳機理,以341份玉米自交系為材料,于2018年在沈陽和通遼種植,收獲后測定秸稈48h IVDMD。利用全基因組重測序獲得的6 276 612個高質(zhì)量SNPs進行全基因組關(guān)聯(lián)分析,共檢測到153個與玉米秸稈消化率顯著相關(guān)的SNPs位點(P<1.0×10-6),4個SNPs顯著水平在P<1.0×10-8以上;共找到38個秸稈消化率的候選基因,主要涉及細胞生長發(fā)育、防御反應(yīng)和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等生物學(xué)功能。

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 供試材料及田間設(shè)計
    1.2 品質(zhì)測定方法
    1.3 表型統(tǒng)計方法
    1.4 基因型測定及分析
    1.5 群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系
    1.6 秸稈48h IVDMD全基因組關(guān)聯(lián)分析
    1.7 秸稈48h IVDMD定位結(jié)果比較分析
    1.8 秸稈48h IVDMD候選基因預(yù)測
    1.9 群體變異位點分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 秸稈48h IVDMD表型分析
    2.2 秸稈48h IVDMD全基因組關(guān)聯(lián)分析
    2.3 候選基因分析
3 討論
    3.1 GWAS定位結(jié)果分析
    3.2 有潛力的候選基因分析
4 結(jié)論



本文編號:3791592

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