玉米pTAC2影響苗期葉片葉綠素合成的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時(shí)間:2022-08-09 13:29
【目的】葉綠素是參與光合途徑最為重要的光合色素。葉綠體的發(fā)育及葉綠素的合成在很大程度上依賴(lài)于質(zhì)體基因組與核基因組之間的雙向信號(hào)傳導(dǎo)來(lái)精確協(xié)調(diào)基因表達(dá)。通過(guò)對(duì)白化表型的CRISPR/Cas9-ZmpTAC2轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性純合突變材料進(jìn)行RNA-seq研究,篩選和鑒定參與葉綠素合成的相關(guān)基因,為明確葉綠素的合成途徑奠定基礎(chǔ)!痉椒ā恳訡RISPR/Cas9-ZmpTAC2玉米轉(zhuǎn)基因編輯純合突變株系為研究材料,使用透射電鏡觀察葉綠體超微結(jié)構(gòu)和分光光度法測(cè)定葉片葉綠素含量,確定葉綠體發(fā)育狀態(tài)及葉綠素合成情況。對(duì)轉(zhuǎn)基因陰性材料(CK)和CRISPR/Cas9-ZmpTAC2轉(zhuǎn)基因純合編輯材料(zmptac2)苗期葉片取樣進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。通過(guò)生物信息學(xué)分析,尋找CK與zmptac2間差異表達(dá)的基因;qRT-PCR對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行驗(yàn)證。通過(guò)酵母雙雜交篩選與玉米pTAC2互作的蛋白質(zhì)!窘Y(jié)果】共獲得15株T0轉(zhuǎn)基因植株,包括綠色植株(7株)和白色植株(8株)。綠色幼苗中3株為轉(zhuǎn)基因陰性材料,4株為轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性(2株為未編輯,2株為雜合編輯突變),白色植株(8株)均為轉(zhuǎn)基因陽(yáng)性純合編輯。與CK相比,突變體(...
【文章頁(yè)數(shù)】:16 頁(yè)
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 轉(zhuǎn)基因株系陽(yáng)性鑒定
1.3 潛在脫靶位點(diǎn)分析
1.4 zmptac2突變體的葉綠體超微結(jié)構(gòu)觀察
1.5 葉綠素含量的測(cè)定
1.6 苗期葉片RNA提取、轉(zhuǎn)錄組建庫(kù)及測(cè)序
1.7 測(cè)序結(jié)果分析
1.8 qRT-PCR驗(yàn)證
1.9 酵母單雜交轉(zhuǎn)錄激活活性分析
1.1 0 ZmpTAC2互作蛋白捕捉
2 結(jié)果
2.1 zmptac2表型及轉(zhuǎn)基因植株陽(yáng)性編輯情況
2.2 zmptac2突變體脫靶效應(yīng)評(píng)估
2.3 zmptac2突變體的葉綠體超微結(jié)構(gòu)及葉綠素含量測(cè)定
2.4 CK與zmptac2幼苗葉片轉(zhuǎn)錄組測(cè)序質(zhì)量分析
2.5 差異表基因的表達(dá)分析及GO功能富集分析
2.6 差異表達(dá)基因Pathway富集分析
2.7 qRT-PCR驗(yàn)證
2.8 酵母雙雜及轉(zhuǎn)錄激活活性分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]OspTAC2 encodes a pentatricopeptide repeat protein and regulates rice chloroplast development[J]. Dekai Wang,Heqin Liu,Guowei Zhai,Liangsheng Wang,Jianfeng Shao,Yuezhi Tao. Journal of Genetics and Genomics. 2016(10)
[2]秈型雜交稻光合特性的配合力分析[J]. 劉紅梅,周新躍,劉建豐,邱穎波,范峰峰,徐慶國(guó). 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2014(04)
[3]植物透射電鏡樣品制備技術(shù)的改進(jìn)[J]. 劉仁林,虞功清,鄒偉民,杜天真. 江西林業(yè)科技. 2008(01)
[4]細(xì)胞周期蛋白cyclin B1與腫瘤[J]. 趙春玲,宋詠梅,樊飛躍,詹啟敏. 腫瘤. 2007(04)
[5]利用改良的CTAB法提取棉花葉片總RNA[J]. 胡根海,喻樹(shù)迅. 棉花學(xué)報(bào). 2007(01)
[6]細(xì)胞周期蛋白依賴(lài)性激酶及抑制因子與腫瘤[J]. 梁彬,鄒向陽(yáng). 中國(guó)實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2006(11)
[7]兩種氨基酸和三種遺傳病[J]. 吳久利. 生物學(xué)教學(xué). 2005(10)
[8]玉米葉綠體atpB及atpE基因在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 王振國(guó),魏家綿,沈允鋼. 植物生理學(xué)報(bào). 1995(03)
博士論文
[1]小黑楊PsnCYCD1;1基因參與細(xì)胞分裂及次生生長(zhǎng)作用機(jī)理研究[D]. 鄭唐春.東北林業(yè)大學(xué) 2016
碩士論文
[1]果糖激酶類(lèi)似蛋白1,2與硫氧還蛋白Z互作調(diào)控水稻葉綠體發(fā)育[D]. 張森.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]pTAC7調(diào)控?cái)M南芥葉綠基因表達(dá)的機(jī)理研究[D]. 葉琳珊.上海師范大學(xué) 2015
本文編號(hào):3672643
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【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 轉(zhuǎn)基因株系陽(yáng)性鑒定
1.3 潛在脫靶位點(diǎn)分析
1.4 zmptac2突變體的葉綠體超微結(jié)構(gòu)觀察
1.5 葉綠素含量的測(cè)定
1.6 苗期葉片RNA提取、轉(zhuǎn)錄組建庫(kù)及測(cè)序
1.7 測(cè)序結(jié)果分析
1.8 qRT-PCR驗(yàn)證
1.9 酵母單雜交轉(zhuǎn)錄激活活性分析
1.1 0 ZmpTAC2互作蛋白捕捉
2 結(jié)果
2.1 zmptac2表型及轉(zhuǎn)基因植株陽(yáng)性編輯情況
2.2 zmptac2突變體脫靶效應(yīng)評(píng)估
2.3 zmptac2突變體的葉綠體超微結(jié)構(gòu)及葉綠素含量測(cè)定
2.4 CK與zmptac2幼苗葉片轉(zhuǎn)錄組測(cè)序質(zhì)量分析
2.5 差異表基因的表達(dá)分析及GO功能富集分析
2.6 差異表達(dá)基因Pathway富集分析
2.7 qRT-PCR驗(yàn)證
2.8 酵母雙雜及轉(zhuǎn)錄激活活性分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]OspTAC2 encodes a pentatricopeptide repeat protein and regulates rice chloroplast development[J]. Dekai Wang,Heqin Liu,Guowei Zhai,Liangsheng Wang,Jianfeng Shao,Yuezhi Tao. Journal of Genetics and Genomics. 2016(10)
[2]秈型雜交稻光合特性的配合力分析[J]. 劉紅梅,周新躍,劉建豐,邱穎波,范峰峰,徐慶國(guó). 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2014(04)
[3]植物透射電鏡樣品制備技術(shù)的改進(jìn)[J]. 劉仁林,虞功清,鄒偉民,杜天真. 江西林業(yè)科技. 2008(01)
[4]細(xì)胞周期蛋白cyclin B1與腫瘤[J]. 趙春玲,宋詠梅,樊飛躍,詹啟敏. 腫瘤. 2007(04)
[5]利用改良的CTAB法提取棉花葉片總RNA[J]. 胡根海,喻樹(shù)迅. 棉花學(xué)報(bào). 2007(01)
[6]細(xì)胞周期蛋白依賴(lài)性激酶及抑制因子與腫瘤[J]. 梁彬,鄒向陽(yáng). 中國(guó)實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2006(11)
[7]兩種氨基酸和三種遺傳病[J]. 吳久利. 生物學(xué)教學(xué). 2005(10)
[8]玉米葉綠體atpB及atpE基因在大腸桿菌中的表達(dá)[J]. 王振國(guó),魏家綿,沈允鋼. 植物生理學(xué)報(bào). 1995(03)
博士論文
[1]小黑楊PsnCYCD1;1基因參與細(xì)胞分裂及次生生長(zhǎng)作用機(jī)理研究[D]. 鄭唐春.東北林業(yè)大學(xué) 2016
碩士論文
[1]果糖激酶類(lèi)似蛋白1,2與硫氧還蛋白Z互作調(diào)控水稻葉綠體發(fā)育[D]. 張森.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2018
[2]pTAC7調(diào)控?cái)M南芥葉綠基因表達(dá)的機(jī)理研究[D]. 葉琳珊.上海師范大學(xué) 2015
本文編號(hào):3672643
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