小麥脅迫相關(guān)蛋白基因TaSAP7的多態(tài)性及功能分析
發(fā)布時(shí)間:2022-07-29 22:21
小麥(Triticum aestivum L.)是世界上最重要的糧食作物之一。全球水資源的日益缺乏和土壤鹽堿化的加劇,嚴(yán)重威脅著小麥的安全生產(chǎn)。發(fā)掘和利用優(yōu)異的抗逆基因,培育抗逆高產(chǎn)小麥新品種是保障小麥安全生產(chǎn)的重要途徑之一。脅迫相關(guān)蛋白(stress associated protein,SAP)是指具有A20和/或AN1結(jié)構(gòu)域的一類(lèi)鋅指蛋白,廣泛參與植物對(duì)逆境脅迫的響應(yīng)與生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)控。小麥種質(zhì)資源中蘊(yùn)藏著豐富的等位變異,發(fā)掘優(yōu)異抗逆基因的等位變異,并開(kāi)發(fā)功能標(biāo)記,對(duì)分子標(biāo)記輔助選擇高產(chǎn)抗逆小麥新品種具有重要的應(yīng)用價(jià)值。關(guān)聯(lián)分析具有研究周期短、精度高等優(yōu)點(diǎn),是進(jìn)行功能基因優(yōu)異等位變異發(fā)掘的有效方法。本研究一方面通過(guò)開(kāi)發(fā)功能標(biāo)記和關(guān)聯(lián)分析,發(fā)掘小麥脅迫相關(guān)蛋白基因TaSAP7的優(yōu)異等位變異,為小麥抗逆高產(chǎn)分子育種提供功能標(biāo)記;另一方面通過(guò)表達(dá)模式分析、亞細(xì)胞定位、轉(zhuǎn)錄激活活性分析及互作蛋白篩選研究TaSAP7-A基因的功能。主要研究結(jié)果如下:1.利用目標(biāo)基因保守結(jié)構(gòu)域的序列在小麥基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行比對(duì),分別獲得小麥TaSAP7的A、B、D基因組的參考序列。根據(jù)參考序列之間的差異,設(shè)計(jì)...
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
第一章 引言
1.1 植物抗逆性研究進(jìn)展
1.1.1 逆境脅迫對(duì)植物的影響
1.1.2 植物對(duì)逆境的響應(yīng)機(jī)制
1.2 單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記
1.2.1 單核苷酸多態(tài)性的概念
1.2.2 單核苷酸多態(tài)性的檢測(cè)方法
1.2.3 單核苷酸多態(tài)性的應(yīng)用
1.2.4 單核苷酸多態(tài)性與單倍型
1.3 關(guān)聯(lián)分析
1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的概念
1.3.2 關(guān)聯(lián)分析的方法
1.3.3 關(guān)聯(lián)分析的應(yīng)用
1.4 脅迫相關(guān)蛋白的研究現(xiàn)狀
1.4.1 脅迫相關(guān)蛋白分類(lèi)
1.4.2 脅迫相關(guān)蛋白研究進(jìn)展
1.4.3 脅迫相關(guān)蛋白作用機(jī)制
1.4.4 脅迫相關(guān)蛋白作用模式
1.5 本研究的目的意義
1.5.1 目的意義
1.5.2 技術(shù)路線(xiàn)
第二章 試驗(yàn)材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 載體和菌株
2.1.3 試驗(yàn)試劑、酶和引物
2.1.4 數(shù)據(jù)分析軟件
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 基因組DNA提取
2.2.2 基因組特異性引物設(shè)計(jì)
2.2.3 目標(biāo)基因擴(kuò)增
2.2.4 目標(biāo)基因連接和轉(zhuǎn)化
2.2.5 質(zhì)粒提取
2.2.6 基因測(cè)序
2.2.7 分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)
2.2.8 亞細(xì)胞定位
2.2.9 表達(dá)模式分析
2.2.10 擬南芥轉(zhuǎn)化
2.2.11 轉(zhuǎn)錄激活活性檢測(cè)
2.2.12 酵母雙雜交文庫(kù)篩選
2.2.13 互作蛋白驗(yàn)證
第三章 試驗(yàn)結(jié)果與分析
3.1 TaSAP7-A的克隆、染色體定位及關(guān)聯(lián)分析
3.1.1 TaSAP7-A克隆及染色體定位
3.1.2 TaSAP7-A序列多態(tài)性
3.1.3 TaSAP7-A功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.1.4 TaSAP7-A功能標(biāo)記與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2 TaSAP7-B的克隆、定位及關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 TaSAP7-B克隆及核苷酸多態(tài)性
3.2.2 TaSAP7-B功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.2.3 TaSAP7-B染色體及遺傳定位
3.2.4 TaSAP7-B功能標(biāo)記與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2.5 TaSAP7-B關(guān)聯(lián)分析結(jié)果驗(yàn)證
3.2.6 TaSAP7-B優(yōu)異等位變異在我國(guó)十大麥區(qū)的地理分布
3.2.7 TaSAP7-B優(yōu)異等位變異在不同年代品種中的頻率分布
3.3 TaSAP7-D的克隆、染色體定位及標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.3.1 TaSAP7-D克隆及染色體定位
3.3.2 TaSAP7-D序列多態(tài)性及標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.4 TaSAP7-A功能初探
3.4.1 TaSAP7-A序列比對(duì)分析
3.4.2 TaSAP7-A亞細(xì)胞定位
3.4.3 TaSAP7-A表達(dá)模式分析
3.4.4 TaSAP7-A植物表達(dá)載體構(gòu)建
3.4.5 TaSAP7-A轉(zhuǎn)化擬南芥
3.4.6 轉(zhuǎn)TaSAP7-A擬南芥對(duì)ABA的敏感度分析
3.4.7 TaSAP7-A轉(zhuǎn)錄激活活性檢測(cè)
3.4.8 TaSAP7-A互作蛋白篩選
3.4.9 TaSAP7-A互作蛋白在酵母系統(tǒng)中的驗(yàn)證
3.4.10 TaSAP7-A互作蛋白在植物系統(tǒng)中的驗(yàn)證
第四章 討論
4.1 TaSAP7序列分析
4.2 TaSAP7單核苷酸多態(tài)性
4.3 TaSAP7單倍型分析
4.4 TaSAP7-A基因功能初探
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
Abstract
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水楊酸和油菜素內(nèi)酯對(duì)低溫脅迫下黃瓜幼苗光合作用的影響[J]. 徐曉昀,郁繼華,頡建明,胡琳莉,李杰. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2016(09)
[2]泛素-26S蛋白酶體系統(tǒng)參與調(diào)控植物免疫研究進(jìn)展[J]. 游全遠(yuǎn),何祖華. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]利用高密度SNP遺傳圖譜定位小麥穗部性狀基因[J]. 劉凱,鄧志英,李青芳,張瑩,孫彩鈴,田紀(jì)春,陳建省. 作物學(xué)報(bào). 2016(06)
[4]黃淮小麥農(nóng)藝性狀進(jìn)化及對(duì)產(chǎn)量性狀調(diào)控機(jī)理的分析[J]. 張麗英,張正斌,徐萍,衛(wèi)云宗,劉新江. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
[5]植物A20/AN1型鋅指蛋白基因功能研究進(jìn)展[J]. 李曉君,武媛麗,孔冉,楊本鵬,張樹(shù)珍. 生物技術(shù)通報(bào). 2013 (12)
[6]脅迫相關(guān)蛋白(SAP)與植物的抗逆性[J]. 王瑛華,王小菁. 華南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(01)
[7]Ubiquitination-mediated protein degradation and modification:an emerging theme in plant-microbe interactions[J]. Li-Rong Zeng~1 Miguel E Vega-Sánchez~1 Tong Zhu~2 Guo-Liang Wang~(1,3)~1Department of Plant Pathology and Plant Molecular Biology and Biotechnology Program,The Ohio State University,Columbus,OH 43210,USA:~2Syngenta Biotechnology Inc.Research Triangle Park,NC 27709-2257.USA:~3Rice Genomics Laboratory,Human Agricultural University,Changsha,Human 410128,China. Cell Research. 2006(05)
博士論文
[1]小麥抗逆相關(guān)基因TaABC1和TaSAP1/2的分離及功能分析[D]. 王彩香.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
本文編號(hào):3667291
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
第一章 引言
1.1 植物抗逆性研究進(jìn)展
1.1.1 逆境脅迫對(duì)植物的影響
1.1.2 植物對(duì)逆境的響應(yīng)機(jī)制
1.2 單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記
1.2.1 單核苷酸多態(tài)性的概念
1.2.2 單核苷酸多態(tài)性的檢測(cè)方法
1.2.3 單核苷酸多態(tài)性的應(yīng)用
1.2.4 單核苷酸多態(tài)性與單倍型
1.3 關(guān)聯(lián)分析
1.3.1 關(guān)聯(lián)分析的概念
1.3.2 關(guān)聯(lián)分析的方法
1.3.3 關(guān)聯(lián)分析的應(yīng)用
1.4 脅迫相關(guān)蛋白的研究現(xiàn)狀
1.4.1 脅迫相關(guān)蛋白分類(lèi)
1.4.2 脅迫相關(guān)蛋白研究進(jìn)展
1.4.3 脅迫相關(guān)蛋白作用機(jī)制
1.4.4 脅迫相關(guān)蛋白作用模式
1.5 本研究的目的意義
1.5.1 目的意義
1.5.2 技術(shù)路線(xiàn)
第二章 試驗(yàn)材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 載體和菌株
2.1.3 試驗(yàn)試劑、酶和引物
2.1.4 數(shù)據(jù)分析軟件
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 基因組DNA提取
2.2.2 基因組特異性引物設(shè)計(jì)
2.2.3 目標(biāo)基因擴(kuò)增
2.2.4 目標(biāo)基因連接和轉(zhuǎn)化
2.2.5 質(zhì)粒提取
2.2.6 基因測(cè)序
2.2.7 分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)
2.2.8 亞細(xì)胞定位
2.2.9 表達(dá)模式分析
2.2.10 擬南芥轉(zhuǎn)化
2.2.11 轉(zhuǎn)錄激活活性檢測(cè)
2.2.12 酵母雙雜交文庫(kù)篩選
2.2.13 互作蛋白驗(yàn)證
第三章 試驗(yàn)結(jié)果與分析
3.1 TaSAP7-A的克隆、染色體定位及關(guān)聯(lián)分析
3.1.1 TaSAP7-A克隆及染色體定位
3.1.2 TaSAP7-A序列多態(tài)性
3.1.3 TaSAP7-A功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.1.4 TaSAP7-A功能標(biāo)記與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2 TaSAP7-B的克隆、定位及關(guān)聯(lián)分析
3.2.1 TaSAP7-B克隆及核苷酸多態(tài)性
3.2.2 TaSAP7-B功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.2.3 TaSAP7-B染色體及遺傳定位
3.2.4 TaSAP7-B功能標(biāo)記與農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析
3.2.5 TaSAP7-B關(guān)聯(lián)分析結(jié)果驗(yàn)證
3.2.6 TaSAP7-B優(yōu)異等位變異在我國(guó)十大麥區(qū)的地理分布
3.2.7 TaSAP7-B優(yōu)異等位變異在不同年代品種中的頻率分布
3.3 TaSAP7-D的克隆、染色體定位及標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.3.1 TaSAP7-D克隆及染色體定位
3.3.2 TaSAP7-D序列多態(tài)性及標(biāo)記開(kāi)發(fā)
3.4 TaSAP7-A功能初探
3.4.1 TaSAP7-A序列比對(duì)分析
3.4.2 TaSAP7-A亞細(xì)胞定位
3.4.3 TaSAP7-A表達(dá)模式分析
3.4.4 TaSAP7-A植物表達(dá)載體構(gòu)建
3.4.5 TaSAP7-A轉(zhuǎn)化擬南芥
3.4.6 轉(zhuǎn)TaSAP7-A擬南芥對(duì)ABA的敏感度分析
3.4.7 TaSAP7-A轉(zhuǎn)錄激活活性檢測(cè)
3.4.8 TaSAP7-A互作蛋白篩選
3.4.9 TaSAP7-A互作蛋白在酵母系統(tǒng)中的驗(yàn)證
3.4.10 TaSAP7-A互作蛋白在植物系統(tǒng)中的驗(yàn)證
第四章 討論
4.1 TaSAP7序列分析
4.2 TaSAP7單核苷酸多態(tài)性
4.3 TaSAP7單倍型分析
4.4 TaSAP7-A基因功能初探
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
Abstract
附錄
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水楊酸和油菜素內(nèi)酯對(duì)低溫脅迫下黃瓜幼苗光合作用的影響[J]. 徐曉昀,郁繼華,頡建明,胡琳莉,李杰. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2016(09)
[2]泛素-26S蛋白酶體系統(tǒng)參與調(diào)控植物免疫研究進(jìn)展[J]. 游全遠(yuǎn),何祖華. 植物生理學(xué)報(bào). 2016(06)
[3]利用高密度SNP遺傳圖譜定位小麥穗部性狀基因[J]. 劉凱,鄧志英,李青芳,張瑩,孫彩鈴,田紀(jì)春,陳建省. 作物學(xué)報(bào). 2016(06)
[4]黃淮小麥農(nóng)藝性狀進(jìn)化及對(duì)產(chǎn)量性狀調(diào)控機(jī)理的分析[J]. 張麗英,張正斌,徐萍,衛(wèi)云宗,劉新江. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
[5]植物A20/AN1型鋅指蛋白基因功能研究進(jìn)展[J]. 李曉君,武媛麗,孔冉,楊本鵬,張樹(shù)珍. 生物技術(shù)通報(bào). 2013 (12)
[6]脅迫相關(guān)蛋白(SAP)與植物的抗逆性[J]. 王瑛華,王小菁. 華南師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(01)
[7]Ubiquitination-mediated protein degradation and modification:an emerging theme in plant-microbe interactions[J]. Li-Rong Zeng~1 Miguel E Vega-Sánchez~1 Tong Zhu~2 Guo-Liang Wang~(1,3)~1Department of Plant Pathology and Plant Molecular Biology and Biotechnology Program,The Ohio State University,Columbus,OH 43210,USA:~2Syngenta Biotechnology Inc.Research Triangle Park,NC 27709-2257.USA:~3Rice Genomics Laboratory,Human Agricultural University,Changsha,Human 410128,China. Cell Research. 2006(05)
博士論文
[1]小麥抗逆相關(guān)基因TaABC1和TaSAP1/2的分離及功能分析[D]. 王彩香.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
本文編號(hào):3667291
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