濟麥22和良星99是我國黃淮冬麥區(qū)和北部冬麥區(qū)大面積推廣的高產(chǎn)小麥品種,也是目前小麥雜交育種的重要親本。雖然濟麥22和良星99的來源和系譜不同,但在重要農(nóng)藝、產(chǎn)量等性狀上存在較高的相似性。為了從全基因組水平研究其遺傳組成的異同,本研究采用IlluminaHiSeq2500測序平臺對上述兩個品種進行了全基因組測序（平均測序深度為5.8×）,并系統(tǒng)地比較了兩個品種拷貝數(shù)變異（CNV）、單核苷酸多態(tài)性（SNP）和插入/缺失（InDel）的序列差異。與中國春參考基因組序列相比,兩個品種除了具有總長466 Mb的共有CNV變異區(qū)間外,濟麥22和良星99的特有CNV變異區(qū)間的總長分別為91Mb和45Mb,這些特有CNV區(qū)間主要集中在2B和4B染色體上;濟麥22和良星99間存在1,547,371個SNP差異位點和137,817個InDel差異位點。以差異SNP分布規(guī)律為依據(jù),在全基因組水平鑒定出濟麥22和良星99間存在14.2%的差異多態(tài)性熱點區(qū)間,這些區(qū)間集中分布在1D、2B和4B染色體上。通過對5個控制小麥株高和穗長基因的序列分析,發(fā)現(xiàn)有2個位于多態(tài)性熱點區(qū)間的基因在品種間存在移碼突變。本研究為... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 小麥材料及田間表型考察
    1.2 全基因組重測序與多態(tài)性位點鑒定
    1.3 拷貝數(shù)變異區(qū)間鑒定及比較分析
    1.4 品種間全基因組高頻率SNP差異區(qū)段的鑒定
    1.5 差異CNV區(qū)間和基因序列差異差異位點的驗證
2 結果與分析
    2.1 濟麥22與良星99的農(nóng)藝性狀比較
    2.2 濟麥22和良星99全基因組多態(tài)性位點檢測
    2.3 濟麥22與良星99的基因組CNV區(qū)間的鑒定與比較
    2.4 濟麥22和良星99間的SNP多態(tài)性熱點區(qū)間和序列相似區(qū)間分析
    2.5 濟麥22和良星99的多態(tài)性熱點區(qū)間和序列相似區(qū)間的突變類型分析
    2.6 株高候選基因在濟麥22和良星99之間的序列差異分析及重測序結果驗證
3 討論
4 結論


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3653834