濟(jì)麥22和良星99是我國(guó)黃淮冬麥區(qū)和北部冬麥區(qū)大面積推廣的高產(chǎn)小麥品種,也是目前小麥雜交育種的重要親本。雖然濟(jì)麥22和良星99的來(lái)源和系譜不同,但在重要農(nóng)藝、產(chǎn)量等性狀上存在較高的相似性。為了從全基因組水平研究其遺傳組成的異同,本研究采用IlluminaHiSeq2500測(cè)序平臺(tái)對(duì)上述兩個(gè)品種進(jìn)行了全基因組測(cè)序（平均測(cè)序深度為5.8×）,并系統(tǒng)地比較了兩個(gè)品種拷貝數(shù)變異（CNV）、單核苷酸多態(tài)性（SNP）和插入/缺失（InDel）的序列差異。與中國(guó)春參考基因組序列相比,兩個(gè)品種除了具有總長(zhǎng)466 Mb的共有CNV變異區(qū)間外,濟(jì)麥22和良星99的特有CNV變異區(qū)間的總長(zhǎng)分別為91Mb和45Mb,這些特有CNV區(qū)間主要集中在2B和4B染色體上;濟(jì)麥22和良星99間存在1,547,371個(gè)SNP差異位點(diǎn)和137,817個(gè)InDel差異位點(diǎn)。以差異SNP分布規(guī)律為依據(jù),在全基因組水平鑒定出濟(jì)麥22和良星99間存在14.2%的差異多態(tài)性熱點(diǎn)區(qū)間,這些區(qū)間集中分布在1D、2B和4B染色體上。通過(guò)對(duì)5個(gè)控制小麥株高和穗長(zhǎng)基因的序列分析,發(fā)現(xiàn)有2個(gè)位于多態(tài)性熱點(diǎn)區(qū)間的基因在品種間存在移碼突變。本研究為... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 小麥材料及田間表型考察
    1.2 全基因組重測(cè)序與多態(tài)性位點(diǎn)鑒定
    1.3 拷貝數(shù)變異區(qū)間鑒定及比較分析
    1.4 品種間全基因組高頻率SNP差異區(qū)段的鑒定
    1.5 差異CNV區(qū)間和基因序列差異差異位點(diǎn)的驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
    2.1 濟(jì)麥22與良星99的農(nóng)藝性狀比較
    2.2 濟(jì)麥22和良星99全基因組多態(tài)性位點(diǎn)檢測(cè)
    2.3 濟(jì)麥22與良星99的基因組CNV區(qū)間的鑒定與比較
    2.4 濟(jì)麥22和良星99間的SNP多態(tài)性熱點(diǎn)區(qū)間和序列相似區(qū)間分析
    2.5 濟(jì)麥22和良星99的多態(tài)性熱點(diǎn)區(qū)間和序列相似區(qū)間的突變類型分析
    2.6 株高候選基因在濟(jì)麥22和良星99之間的序列差異分析及重測(cè)序結(jié)果驗(yàn)證
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]黃淮麥區(qū)300個(gè)小麥種質(zhì)的主要農(nóng)藝性狀比較[J]. 張婷,逯臘虎,張偉,楊斌,袁凱,史曉芳.  小麥研究. 2018 (01)
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博士論文
[1]普通小麥2D染色體株高和穗長(zhǎng)QTL的精細(xì)定位與圖位克隆[D]. 柴嶺嶺.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019



本文編號(hào)：3653834