源-庫(kù)比的變化與葉片的衰老速度有密切關(guān)系,但是其調(diào)控機(jī)制仍不清楚。為了進(jìn)一步明確控制玉米授粉阻斷后葉片衰老性狀的遺傳位點(diǎn),本研究利用B73×Mo17IBM（Intermated B73×Mo17）群體,于2015年、2016年在抽絲前套袋阻止授粉后觀察葉片衰老狀況,取2年表型一致的142個(gè)家系結(jié)合對(duì)應(yīng)的基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行QTL分析,共定位出1個(gè)主效QTL和4個(gè)微效QTL位點(diǎn)。為確認(rèn)QTL的真實(shí)性,我們利用來(lái)自于相同群體表型有明顯差異的2個(gè)極端池的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),通過(guò)集群分離轉(zhuǎn)錄組測(cè)序法（Bulked Segregant RNA-seq,BSR-seq）物理定位與授粉阻斷后葉片衰老性狀的顯著相關(guān)的區(qū)段。第8染色體上一個(gè)4.47 Mb區(qū)段與授粉阻斷后葉片衰老性狀的相關(guān)性最好,并且與我們使用遺傳圖譜定位出的主效QTL位點(diǎn)在基因組上的位置基本重合。該染色體區(qū)段共有81個(gè)基因,我們預(yù)測(cè)其中7個(gè)基因可能與授粉阻斷后的葉片衰老性狀有關(guān)。分析B73與Mo17在抽絲期、抽絲后1周與抽絲后2周的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果顯示,UDP-葡萄糖焦磷酸化酶基因AC197705.4＿FGT011所在的模塊的... 

【文章頁(yè)數(shù)】：75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 緒論
    1.1 影響玉米葉片衰老的因素
        1.1.1 氮素利用效率
            1.1.1.1 玉米的氮素利用
            1.1.1.2 氮轉(zhuǎn)運(yùn)對(duì)葉片衰老的影響
        1.1.2 葉片中糖分的積累
        1.1.3 植物激素水平
    1.2 葉片衰老性狀的研究方法
    1.3 基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
        1.3.1 基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)概論
        1.3.2 加權(quán)相關(guān)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
    1.4 結(jié)束語(yǔ)
第2章 玉米授粉阻斷后葉片衰老性狀的QTL定位
    2.1 材料與方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 方法
            2.1.2.1 表型測(cè)定
            2.1.2.2 取樣
            2.1.2.3 DNA提取(SDS)
            2.1.2.4 分子標(biāo)記連鎖圖的收集
            2.1.2.5 分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)
            2.1.2.6 分子標(biāo)記檢測(cè)
            2.1.2.7 QTL分析
    2.2 結(jié)果
        2.2.1 葉片衰老性狀的表現(xiàn)型分析
        2.2.2 InDel標(biāo)記開(kāi)發(fā)
        2.2.3 遺傳圖譜的加密
        2.2.4 調(diào)控授粉阻斷后葉片衰老性狀的QTL位點(diǎn)
    2.3 討論
        2.3.1 IBM群體的優(yōu)勢(shì)
        2.3.2 玉米授粉阻斷后葉片衰老性狀的遺傳分析
        2.3.3 葉片早衰與紅色色素沉積
        2.3.4 葉片早衰與糖積累
        2.3.5 葉片早衰與碳、氮代謝
        2.3.6 玉米分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
        2.3.7 遺傳圖譜的加密
        2.3.8 QTL定位分析
            2.3.8.1 QTL定位的統(tǒng)計(jì)方法
            2.3.8.2 QTL定位的準(zhǔn)確性
    2.4 結(jié)論
第3章 集群分離轉(zhuǎn)錄組測(cè)序法驗(yàn)證QTL定位結(jié)果
    3.1 材料與方法
        3.1.1 材料
        3.1.2 方法
            3.1.2.1 RNA提取,r RNA去處和RNA測(cè)序
            3.1.2.2 RNA測(cè)序序列的定位
            3.1.2.3 SNP的檢測(cè)和過(guò)濾
            3.1.2.4 物理定位阻止授粉后葉片衰老性狀
            3.1.2.5 QTL真實(shí)性驗(yàn)證
            3.1.2.6 候選基因的篩選
    3.2 結(jié)果
        3.2.1 混樣池的構(gòu)建
        3.2.2 超深度RNA測(cè)序和定位
        3.2.3 物理定位阻止授粉后葉片衰老性狀及QTL真實(shí)性驗(yàn)證
        3.2.4 候選基因的篩選
    3.3 討論
        3.3.1 混樣池的構(gòu)建
        3.3.2 測(cè)序質(zhì)量評(píng)估和預(yù)處理
        3.3.3 SNP的檢測(cè)和過(guò)濾
        3.3.4 物理定位阻止授粉后葉片衰老性狀
        3.3.5 QTL真實(shí)性驗(yàn)證
        3.3.6 候選基因的篩選
        3.3.7 BSR-Seq的優(yōu)點(diǎn)
    3.4 結(jié)論
第4章 加權(quán)相關(guān)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 材料
        4.1.2 方法
            4.1.2.1 RNA測(cè)序序列的定位
            4.1.2.2 計(jì)算轉(zhuǎn)錄本豐度
            4.1.2.3 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
            4.1.2.4 基因功能富集分析
    4.2 結(jié)果
        4.2.1 基因豐度分析
        4.2.2 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
            4.2.2.1 樣品聚類(lèi)樹(shù)
            4.2.2.2 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
            4.2.2.3 模塊功能富集化分析
        4.2.3 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的可視化
    4.3 討論
        4.3.1 基因豐度分析
        4.3.2 樣品聚類(lèi)樹(shù)
        4.3.3 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
        4.3.4 模塊功能分析
        4.3.5 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的可視化
    4.4 結(jié)論
第5章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]源庫(kù)比改變對(duì)玉米生育后期莖鞘貯存物質(zhì)含量及產(chǎn)量的影響[J]. 王滿(mǎn)意,薛吉全,梁宗鎖,路海東,馬國(guó)勝.  西北植物學(xué)報(bào). 2004(06)
[4]質(zhì)量-數(shù)量性狀的遺傳分析 Ⅰ.遺傳組成和主基因基因型鑒別[J]. 莫惠棟.  作物學(xué)報(bào). 1993(01)



本文編號(hào)：3653713