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棉花R2R3-MYB結(jié)構(gòu)與功能分析及三個(gè)MYB轉(zhuǎn)錄因子的功能預(yù)測(cè)

發(fā)布時(shí)間:2022-02-10 05:18
  棉花是世界上最重要的經(jīng)濟(jì)作物之一。近年來(lái)針對(duì)棉纖維發(fā)育調(diào)控基因的研究日益增多。MYB轉(zhuǎn)錄因子家族是植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子之一,在玉米和擬南芥等作物中的研究表明,MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物激素響應(yīng)和耐逆性方面有著非常重要的作用。在棉花的研究中也表明MYB家族中的一些基因可以調(diào)控棉纖維發(fā)育。本研究選取了在棉纖維發(fā)育的起始期、快速伸長(zhǎng)期和次生壁加厚期三個(gè)時(shí)期分別顯著高表達(dá)的MYB 基因GhA12G1309、Gh<sub>D12G1202 和 GhA12G2460 進(jìn)行功能研究。以TM-1基因組為參考基因組,利用R2R3結(jié)構(gòu)域?yàn)槟0暹M(jìn)行比對(duì),篩選出包括以上三個(gè)基因在內(nèi)的34個(gè)同源基因,并對(duì)這些基因進(jìn)行亞族劃分、氨基酸保守序列鑒定及基因信息方面的分析。然后根據(jù)C-端序列相同為亞族的原則將所選基因劃分為4個(gè)亞族,余下9個(gè)基因未劃分入亞族。通過(guò)基因序列和氦基酸序列分析,結(jié)合擬南芥、水稻等其他物種中同源基因的功能研究,對(duì)各亞族的功能進(jìn)行研究和預(yù)測(cè)。我們還發(fā)現(xiàn)每個(gè)亞族的MYB基因在棉花不同組織、纖維和胚珠不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式表現(xiàn)出差... 

【文章來(lái)源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省211工程院校教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:64 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

棉花R2R3-MYB結(jié)構(gòu)與功能分析及三個(gè)MYB轉(zhuǎn)錄因子的功能預(yù)測(cè)


圖1-1植物MYB轉(zhuǎn)錄因子分類??Figure?1-1?Classification?of?MYB?transcription?factors?in?plant??1.2?MYB

棉纖維,起始期,纖維


?第一章植物轉(zhuǎn)錄因子研究???生長(zhǎng)伸長(zhǎng)、細(xì)胞次生壁生成及植物體內(nèi)纖維素合成模式的最好材料。??1.4.1棉纖維發(fā)育模式??為了更好的了解和研究棉纖維的生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,科研人員通過(guò)長(zhǎng)時(shí)間的研宄實(shí)驗(yàn)??將棉纖維發(fā)育分為四個(gè)時(shí)期(圖1-3),即纖維起始期(Initiation)、快速伸長(zhǎng)期??(Elongation)、次生壁合成期(Secondary?wall?biosynthesis)和成熟期(Maturation)??(Leeetal.2007)。從開(kāi)花當(dāng)天即0DPA幵始,至50DPA纖維發(fā)育結(jié)束,四個(gè)時(shí)期間??相互重疊分界并不明顯。??m?luiiu??i?:j?.tana??ODPA?1?DPA?2?DPA?7?DPA?30?DPA?>50?DPA??/??J??J?.z.?\??/?????\??/???,?一????????...z?\??c?丨Vi::::????r'??Initiation?Elongation?Secondary?v/ail?biosynltiesis?Maturation??I?!?l?I?l?l?l?i?t??i??0?5?10?15?20?25?30?35?40?45?50??Days?post-anthesis?(DPA)??圖1-3棉纖維發(fā)育時(shí)期(Lee?etal.?2007)??Figure?1-3?Cotton?fiber?development?periods??纖維起始期,又稱纖維突起期,是從開(kāi)花開(kāi)始ODPA到5?DPA左右的時(shí)期,從電??鏡圖片中可以看到,這個(gè)時(shí)期棉花胚珠的表皮

形態(tài)圖,表皮,毛發(fā),形態(tài)


圍。通過(guò)電鏡觀察及組織鑒定,發(fā)現(xiàn)表皮毛生長(zhǎng)起始位置與葉片有絲分??裂活躍區(qū)域是相同的,表明細(xì)胞的發(fā)育及DNA的復(fù)制影響表皮毛發(fā)育進(jìn)程(Payneet??al.?1999)。??形態(tài)學(xué)研究中將擬南芥表皮毛發(fā)育生長(zhǎng)總結(jié)為六個(gè)階段(Szymanski?and?Marks??1998)。第一階段中,表皮毛前體細(xì)胞膨脹,核內(nèi)DNA發(fā)生復(fù)制。在表皮毛前體細(xì)胞??膨脹到普通表皮細(xì)胞體積的2-3倍時(shí)開(kāi)始產(chǎn)生突起,形成表皮毛的桿狀組織。形成桿??狀組織后,桿狀組織頂端增大發(fā)育出共軛焦點(diǎn),開(kāi)始形成分支(圖1-4)。這個(gè)時(shí)期細(xì)??胞呈彌散性生長(zhǎng),高度和直徑均增加。分支形成初期其尖端圓潤(rùn),隨著生長(zhǎng)逐漸變尖。??表皮毛生長(zhǎng)完成之后,不同表皮毛周圍的乳突數(shù)目不同。??圖1-4表皮毛發(fā)育形態(tài)特征??Figure?1-4?Morphological?characteristics?of?trichome?development??9??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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[2]棉花R3-MYB基因GhCPC對(duì)纖維發(fā)育的負(fù)向調(diào)控作用[D]. 劉炳亮.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]大豆MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及其表達(dá)研究[D]. 楊文杰.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007

碩士論文
[1]棉纖維發(fā)育相關(guān)R2R3-MYB和CAD基因家族分析[D]. 張經(jīng)博.新疆師范大學(xué) 2016
[2]桑樹(shù)MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學(xué)及黃酮合成相關(guān)基因的表達(dá)分析[D]. 陳泓宇.西南大學(xué) 2015
[3]棉花MYB轉(zhuǎn)錄因子的克隆與功能驗(yàn)證[D]. 王諾菡.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[4]擬南芥開(kāi)花調(diào)控基因EFS1的功能研究[D]. 李莉.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009



本文編號(hào):3618317

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