棉花(Gossypium hirsutum)絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)家族的全基因組鑒定及GhMPK6在棉纖維伸長中
發(fā)布時(shí)間:2022-01-17 07:11
棉花作為重要的經(jīng)濟(jì)作物,為紡織工業(yè)提供重要的原材料。但是,棉纖維發(fā)育過程的分子調(diào)控機(jī)制仍不清楚。絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)在植物發(fā)育以及對(duì)逆境響應(yīng)中扮演著重要的角色。然而,關(guān)于MAPK在棉纖維發(fā)育過程中的生物學(xué)功能,目前仍缺乏研究報(bào)道。本文通過全基因組篩查分析,鑒定了 56個(gè)陸地棉MAPKs基因,并對(duì)棉纖維伸長階段優(yōu)勢(shì)表達(dá)的GhMAPK家族成員GhMPK6的功能進(jìn)行了初步探究。具體研究結(jié)果如下:1.陸地棉MAPK家族全基因組鑒定及分析利用已知的擬南芥和水稻MAPK的蛋白序列在陸地棉基因組數(shù)據(jù)庫(HAU和NAU)中鑒定了 56個(gè)陸地棉MAPKs基因,其中28個(gè)來自A基因組,28個(gè)來自D基因組。根據(jù)與擬南芥MAPK蛋白序列的相似性,將陸地棉中鑒定的56個(gè)GhMAPKs基因命名為GhMPK1A/D-GhMPK20aA/D。進(jìn)化樹分析表明該基因家族可分為4個(gè)亞支(A、B、C和D)。GhMAPKs基因不均勻分布在棉花基因組的22條染色體上,而其余4條染色體(AtChr6,DtChr6,AtChr13和DtC
【文章來源】:華中師范大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1陸地棉、擬南芥和水稻中MAPKs蛋白系統(tǒng)進(jìn)化分析??無根樹是通過Clustal?Omega在線軟件使用Neighbor-Joining算法而得
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【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]棉花(Gossypium hirsutum)JAZ11-D和XND1基因的生物學(xué)功能及調(diào)控研究[D]. 李雯.華中師范大學(xué) 2016
[2]棉花(Gossypium hirsutum)GhGalT1和GhDi19-1/-2基因的生物學(xué)功能及調(diào)控研究[D]. 秦麗霞.華中師范大學(xué) 2016
[3]GhFP1基因在棉花(Gossypium hirsutum)纖維發(fā)育中的功能及其分子機(jī)制研究[D]. 劉致浩.華中師范大學(xué) 2015
本文編號(hào):3594285
【文章來源】:華中師范大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:75 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖3-1陸地棉、擬南芥和水稻中MAPKs蛋白系統(tǒng)進(jìn)化分析??無根樹是通過Clustal?Omega在線軟件使用Neighbor-Joining算法而得
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【參考文獻(xiàn)】:
博士論文
[1]棉花(Gossypium hirsutum)JAZ11-D和XND1基因的生物學(xué)功能及調(diào)控研究[D]. 李雯.華中師范大學(xué) 2016
[2]棉花(Gossypium hirsutum)GhGalT1和GhDi19-1/-2基因的生物學(xué)功能及調(diào)控研究[D]. 秦麗霞.華中師范大學(xué) 2016
[3]GhFP1基因在棉花(Gossypium hirsutum)纖維發(fā)育中的功能及其分子機(jī)制研究[D]. 劉致浩.華中師范大學(xué) 2015
本文編號(hào):3594285
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