在本研究中,利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所得的豐富數(shù)據(jù)來(lái)挖掘糜子基因組的特異性SSR標(biāo)記,同時(shí)對(duì)來(lái)自不同生態(tài)區(qū)的糜子資源進(jìn)行多樣性研究,旨在為日后糜子分子水平的研究提供更多SSR分子標(biāo)記作為有力的工具,更為日后糜子優(yōu)良品種的篩選提供一定的借鑒。本次試驗(yàn)選用來(lái)自6大糜子生態(tài)區(qū)15個(gè)�。ㄗ灾螀^(qū)）的96份糜子資源作為試材,首先對(duì)其進(jìn)行表型多樣性分析,然后對(duì)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所獲得的四、五和六堿基重復(fù)的151個(gè)SSR標(biāo)記序列設(shè)計(jì)特異性引物并選用6份地域差異較遠(yuǎn)的糜子品種進(jìn)行篩選,利用篩選出的85對(duì)SSR引物對(duì)96個(gè)糜子品種進(jìn)行遺傳多樣性分析。主要的分析結(jié)果如下:1.調(diào)查了 96份糜子資源的7個(gè)農(nóng)藝性狀,其中其中變異系數(shù)最高的是分蘗數(shù)為42.19%,最低是葉長(zhǎng)為18.21%,shannon指數(shù)最高的是株高為2.08,最低的是葉長(zhǎng)為1.78。通過(guò)對(duì)糜子進(jìn)行相關(guān)性分析、主成分分析和利用隸屬函數(shù)對(duì)96個(gè)糜子品種進(jìn)行綜合分析發(fā)現(xiàn)來(lái)自甘肅省榆中縣的18號(hào)榆中黃糜的值最高為0.738,因而其綜合評(píng)價(jià)最好;來(lái)自山西孝義市的黃糜子值最低為0.231,其綜合評(píng)價(jià)最低。對(duì)96個(gè)糜子進(jìn)行聚類(lèi)分析,分為四大類(lèi),第一類(lèi)群的糜子品種株高較高,穗... 

【文章來(lái)源】：山西農(nóng)業(yè)大學(xué)山西省

【文章頁(yè)數(shù)】：79 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２．１?７個(gè)表型性狀隸屬值分布??Ｆｉｇ．２．１?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｓｕｂｏｒｄｉｎａｔｅ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｖａｌｕｅ?ｏｆ?ｓｅｖｅｎ?

３．４結(jié)果與分析??３．４．１模板ＤＮＡ的檢測(cè)??本次試驗(yàn)所提取的ＤＮＡ，經(jīng)過(guò)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其純度和片段大小，如圖３．１??所示，條帶都比較明亮且沒(méi)有出現(xiàn)特別明顯的拖尾，且條帶基本出現(xiàn)在了預(yù)期的位置，??利用超微量紫外分光光度計(jì)，測(cè)其濃度及ＯＤ值，結(jié)果表明：濃度均在１５０－３００ｎｇ＾Ｌ??之間，Ａ２６０／２８００Ｄ值為１．７－１．９，Ａ２６０／２３００Ｄ值大于２。提取的模板ＤＮＡ質(zhì)量較好，??滿足下一步ＰＣＲ擴(kuò)增要求。??Ｉ??圖３．１部分糜子ＤＮＡ電泳圖??Ｆｉｇ．３．１?Ｔｈｅ?ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ?ｏｆ?ｇｅｎｏｍｉｃ?ＤＮＡ?ｏｆ?ｐａｒｔｉａｌ?ｃｏｍｍｏｎ?ｍｉｌｌｅｔ?ｓａｍｐｌｅ??３．４．２?ＰＣＲ反應(yīng)體系的建立和優(yōu)化結(jié)果??經(jīng)過(guò)一系列的試驗(yàn)，最終確立比較適宜糜子ＰＣＲ擴(kuò)增程序?yàn)椋侯A(yù)變性９４°Ｃ５ｍｉｍ??變性９４°Ｃ?４５ｓ，退火Ｔｍ５０ｓ，延伸７２°Ｃ?ｌｍｉｎ，共３８?jìng)�(gè)循環(huán)；后延伸７２°Ｃ?ｌＯｍｉｎ；??反應(yīng)體系成份為：ｌ〇ｘｂｕｆｆｅｒ２＾Ｌ，?ｄＮＴＰｓｌ．８＾Ｌ，Ｔａｑ聚合酶０卻Ｌ，前后引物各０．６私，??ｄｄＨ２０?１３加Ｌ，ＤＮＡ模版１疝，總體積２０吣。如下圖３．２和圖３．３，是體系優(yōu)化前后??對(duì)比的對(duì)比。??結(jié)果表明：采用優(yōu)化后ＰＣＲ擴(kuò)增程序時(shí)

圖３．２?ＰＣＲ條件優(yōu)化前??Ｆｉｇ．３．２?ＰＣＲ?ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ?ｂｅｆｏｒｅ?ｏｐｔｉｍｉｚａｔｉｏｎ??圖３．３?ＰＣＲ條件優(yōu)化后??Ｆｉｇ．３．３?ＰＣＲ?ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ?ａｆｔｅｒ?ｏｐｔｉｍｉｚａｔｉｏｎ??３．４．３引物篩選及擴(kuò)增結(jié)果??本次試驗(yàn)從１５１條引物中篩選出１２６條有擴(kuò)增條帶，其中４１條引物擴(kuò)增的條帶是??單態(tài)性，８５條引物可以擴(kuò)增出可識(shí)別、清楚且具有特異性的條帶，占其總數(shù)的比例為??５６．２９％，其中六堿基重復(fù)的有４條，占篩選出引物總數(shù)的比例為４．７％；五堿基重復(fù)的??有１０條，占比例為１１．７６％；四堿基重復(fù)的引物有７１條，占比例為８３．５３％。引物的具??體明細(xì)見(jiàn)附表二所示。??部分引物篩選擴(kuò)增情況如下（其余見(jiàn)附圖一）：??Ｉ?Ｖ??Ｍ?Ｆ５ＹＷ１

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]利用熒光SSR分析中國(guó)糜子遺傳多樣性[J]. 王瑞云,季煦,陸平,劉敏軒,許月,王綸,王海崗,喬治軍.  作物學(xué)報(bào). 2017(04)
[2]利用SSR分子標(biāo)記研究國(guó)內(nèi)外黍稷地方品種和野生資源的遺傳多樣性[J]. 連帥,陸平,喬治軍,張琦,張茜,劉敏軒,王瑞云.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(17)
[3]利用SSR標(biāo)記分析40份糜子資源的遺傳多樣性[J]. 劉笑瑜,王瑞云,劉敏軒,邱巖巖,季煦,連帥,喬治軍,王綸,王海崗.  分子植物育種. 2016(06)
[4]糜子骨干種質(zhì)遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 董俊麗,王海崗,陳凌,王君杰,曹曉寧,王綸,喬治軍.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(16)
[5]不同生態(tài)區(qū)糜子種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析[J]. 連帥,王瑞云,馬躍敏,劉笑瑜,季煦.  山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(03)
[6]10個(gè)糜子品種產(chǎn)量與農(nóng)藝性狀的灰色關(guān)聯(lián)度分析[J]. 張立媛,楊恒山,王顯瑞,琦明玉,趙敏.  種子. 2014(11)
[7]新疆杏種質(zhì)資源表型多樣性研究[J]. 劉娟,廖康,曼蘇爾·那斯?fàn)?趙世榮,劉歡,賈楊.  果樹(shù)學(xué)報(bào). 2014(06)
[8]構(gòu)建黍稷分子遺傳圖譜SSR引物的篩選[J]. 王銀月,劉敏軒,陸平,喬治軍,楊天育,李海,崔喜艷.  作物雜志. 2014(04)
[9]黍稷種質(zhì)資源芽、苗期耐中性混合鹽脅迫評(píng)價(jià)與耐鹽生理機(jī)制研究[J]. 劉敏軒,張宗文,吳斌,陸平.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(18)
[10]甘肅省糜子地方資源農(nóng)藝性狀遺傳多樣性分析[J]. 董孔軍,楊天育,何繼紅.  河北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(02)

博士論文
[1]中國(guó)沿海三疣梭子蟹群體形態(tài)、生化與分子遺傳多樣性研究[D]. 董志國(guó).上海海洋大學(xué) 2012



本文編號(hào)：3576129