為研究水稻芒的遺傳調(diào)控機制,本研究在‘日本晴’/‘93-11’染色體片段代換系群體中篩選出一個長芒材料‘CSSL14’,研究了其主要農(nóng)藝性狀和長芒的遺傳方式,并對長芒基因LA1進行了基因定位。結果表明‘CSSL14’的芒長、芒著生率、分蘗數(shù)和單株產(chǎn)量與‘93-11’存在極顯著（p<0.01）或顯著（p<0.05）差異,分別為‘93-11’的2.98倍、2.82倍、0.68倍和0.76倍。遺傳分析表明‘CSSL14’的長芒表型受一對半顯性基因LA1控制。通過圖位克隆的方法,將LA1定位在第4染色體長臂標記M3和M4之間12.14 kb的范圍內(nèi),該定位區(qū)間內(nèi)只有1個預測的候選基因Os04g0518800,與已知的野生稻長芒基因An-2/LABA1等位。本研究結果為進一步研究LA1的功能提供了參考。 

【文章來源】：分子植物育種. 2020,18(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

‘93-11’(A)和‘CSSL14’(B)的表型比較分析

為了定位LA1基因，選取‘CSSL14’和‘93-11’配制的F2群體的4 731個與‘93-11’芒長類似的短芒單株作為定位群體。利用篩選出來的第2和第4染色體上的多態(tài)性分子標記對這些短芒單株進行連鎖分析，發(fā)現(xiàn)LA1基因與第4染色體的多態(tài)性分子標記M1和M2(表2)連鎖，在M1和M2處的交換單株分別為19株和8株，這些交換單株不相同，因此LA1基因被初步定位在M1和M2之間。我們利用在該定位區(qū)間內(nèi)開發(fā)出來的1對多態(tài)性分子標記對LA1基因進行進一步的精細定位，最終將LA1基因定位在兩個多態(tài)性分子標記即M3和M4(表2)之間12.14 kb的范圍之內(nèi)(圖2B)。利用The Rice Genome Annotation Project Database對定位區(qū)間內(nèi)的候選基因進行預測分析發(fā)現(xiàn)，在此定位區(qū)間內(nèi)，有一個已克隆的控制水稻芒長的基因Os04g0518800。測序比對分析發(fā)現(xiàn)，‘日本晴’和普通野生稻Os04g0518800基因的編碼區(qū)序列完全一致，而‘93-11’中Os04g0518800基因的第一個外顯子起始密碼子上游69 bp處發(fā)生了一個C堿基的缺失，導致‘93-11’的Os04g0518800基因形成了一個只有55個氨基酸的截短蛋白。因此，我們將Os04g0518800作為LA1的候選基因。

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3575716