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甘藍(lán)型油菜苗期耐鹽相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-01-07 17:21
  日益加劇的土壤鹽漬化問題對(duì)世界農(nóng)業(yè)發(fā)展構(gòu)成了嚴(yán)重的威脅。近年來(lái),關(guān)聯(lián)分析被成功運(yùn)用到農(nóng)作物重要性狀的遺傳研究和農(nóng)藝性狀相關(guān)基因的挖掘工作之中。本研究利用不同的鹽濃度對(duì)8個(gè)甘藍(lán)型油菜品系進(jìn)行鹽脅迫處理,確定了評(píng)價(jià)不同油菜品系耐鹽性的合適的鹽濃度,并建立了一套油菜耐鹽性鑒定的水培體系;利用該體系對(duì)138份甘藍(lán)型油菜自交系苗期的耐鹽性進(jìn)行了初步鑒定與評(píng)價(jià);利用耐鹽鑒定體系對(duì)368份甘藍(lán)型油菜自交系進(jìn)行耐鹽性評(píng)價(jià),并結(jié)合覆蓋油菜全基因組的SNP標(biāo)記進(jìn)行苗期耐鹽相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析。主要研究?jī)?nèi)容和結(jié)果如下:1.利用濃度為0 g/L、9.0 g/L、10.5 g/L、12.0 g/L、13.5 g/L、15.0 g/L的Na Cl溶液對(duì)8個(gè)甘藍(lán)型油菜自交系幼苗實(shí)施鹽脅迫處理。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,油菜幼苗地上部分生物量的積累受到了鹽脅迫的抑制,并且鹽脅迫對(duì)幼苗地上部分生物量的抑制程度隨著Na Cl濃度的升高而逐漸增強(qiáng),當(dāng)Na Cl濃度為13.5 g/L時(shí),不同材料之間的抑制程度差異最大,最后將該濃度作為評(píng)價(jià)不同油菜自交系苗期的耐鹽性的合適Na Cl濃度。2.利用13.5 g/L Na Cl溶液對(duì)收集... 

【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:111 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

甘藍(lán)型油菜苗期耐鹽相關(guān)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析


植物鹽脅迫抗性機(jī)制簡(jiǎn)圖(引自(蔡曉鋒等2015))

示意圖,高等植物,示意圖,羥基自由基


除 ROS 的過程中起著重要作用(Du et al 2001)。GSH 能與超氧自由基( O2-)、羥基自由基( OH)以及 H2O2反應(yīng),從而清除自由基的功能。AsA 是一種非常重要的膜保護(hù)物質(zhì),其可以清除多種 ROS抑制不飽和脂肪酸氧化,對(duì)膜結(jié)構(gòu)和功能的穩(wěn)定性起著重要作用。當(dāng)植物遭受迫時(shí),GSH 有助于維持質(zhì)膜的通透性和細(xì)胞活性(Hamed et al 2008),同時(shí) GS AsA 的應(yīng)用有效地提升植物在鹽脅迫條件下的耐受能力(Sparringa et al 2011)育酚是一種類囊體膜抗氧化物,其能通過物理手段淬滅或者化學(xué)手段來(lái)清除單氧、超氧化物和羥基自由基,從而達(dá)到防止膜脂質(zhì)過氧化的目的(Noctor and Foy998)。總的來(lái)說(shuō),活性氧清除酶具有高效性與專一性的特點(diǎn),在活性氧的產(chǎn)生與代程中,抗氧化酶催化不同的反應(yīng)過程,終止活性氧的級(jí)聯(lián)反應(yīng),并且與抗氧化質(zhì)共同工作,形成一套成熟穩(wěn)定的抗氧化系統(tǒng)(圖 1.2)。

群體結(jié)構(gòu),關(guān)聯(lián)分析,假陽(yáng)性,群體


圖 1.3 群體結(jié)構(gòu)造成關(guān)聯(lián)分析的假陽(yáng)性(引自(Nordborg and Weigel 2008))Fig.1.3 The population structure causes false positives in association analysis.2 多親群體隨著數(shù)量遺傳學(xué)的發(fā)展,研究者開發(fā)出綜合了關(guān)聯(lián)和連鎖分析優(yōu)點(diǎn)的群體巢式關(guān)聯(lián)群體(Nested association mapping, NAM)和多親本高世代互交AGIC,Multi-parent Advanced Generation Inter-Cross)。NAM 群體是由 一個(gè)共同親本雜交,再分別單籽傳,形成 n 個(gè) RIL 群體(圖 1.4)。NAM了連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析兩種方法的優(yōu)點(diǎn),同時(shí)也相互彌補(bǔ)了對(duì)方的缺點(diǎn)。優(yōu)點(diǎn)是親本少,僅需要少量的覆蓋于整個(gè)基因組的遺傳標(biāo)記,并且每個(gè)等有較高的統(tǒng)計(jì)效力;而存在等位基因不足、定位分辨率較低等缺點(diǎn)。而關(guān)優(yōu)勢(shì)是高分辨率,并富集了更多的等位基因,然而由于等位基因頻率的不某些低頻率的等位基因難以被檢測(cè)到(杜月 2012)。由于親本較多,NA含了較多的等位基因和高重組率,同時(shí)多個(gè) RIL 群體內(nèi)部并不存在群體結(jié)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[5]青島市城陽(yáng)區(qū)鹽堿灘涂地景觀規(guī)劃[D]. 馬棟棟.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009



本文編號(hào):3574951

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